马来西亚皇家海军的前五十年，其前身是1934年4月27日在新加坡成立的海峡殖民地皇家海军志愿后备队，一直以新加坡岛上的兀兰为基地。维基百科指出，1973年1月，为了保卫马六甲海峡，在霹雳州海岸的卢穆特设立了一个小型基地，并于1973年至1984年间由德国的科克斯、布洛姆-福斯和蒂森公司建造完成。.

该基地于1980年投入使用，1984年9月9日，海军总部开始从伍德兰兹迁往卢穆特。如今，该基地占地约1800英亩，设有西部舰队司令部、教育训练司令部、海军特种部队司令部和马来西亚皇家海军航空兵司令部。据维基百科记载，该基地自2021年11月11日起由努尔·祖基·哈伦海军上将担任司令，但其是否仍在任尚未得到证实。.

马来西亚海军航空兵起步较晚，规模也较小。维基百科显示，马来西亚海军于1986年5月从英国皇家海军购入六架二手韦斯特兰“黄蜂”直升机，并于1988年4月8日正式加入海军服役——与其他购买该机型的国家相比，马来西亚的入役时间较晚。其中一架编号为M499-07的直升机自1965年起就以XT426的编号在英国皇家海军服役，因此这些飞机的机龄已超过二十年。.

黄蜂式飞机在马来西亚服役时间很短。维基百科称，它大约十年后就被淘汰，并由耳廓狐式飞机取代；但由于耳廓狐式飞机直到2004年才抵达马来西亚，现有资料并未解释两者之间的空白期。目前仅存两架黄蜂式飞机：一架是位于北根的彭亨皇家博物馆的M499-01（原XV636），另一架是位于马六甲海事博物馆的M499-07。.

现今的海军航空兵部队是在2003年至2004年间采购的。《海军新闻》记录显示，501中队共接收了6架超级山猫Mk 100型直升机，交付时间为2003年3月3日至2004年6月；502中队则接收了6架AS555SN“小狐狸”（后更名为H125M）型直升机，首架于2004年3月30日交付。山猫直升机是护卫舰的专用直升机，用于反舰、反潜、水面监视和超视距目标探测；而小狐狸直升机则用于训练、监视、医疗后送、搜救、火力支援和特种部队支援。.

据《海军新闻》报道，截至2019年3月，山猫无人机累计飞行超过10210小时，在航行舰艇上进行了4372次甲板着舰，未发生任何致命事故；而小狐狸无人机累计飞行19000小时，也未发生任何事故。两款无人机都曾在亚丁湾参与打击索马里海盗的行动，其中最著名的当属2011年1月成功解救了油轮“邦加·劳雷尔”号。2019年7月，一架超级山猫无人机在南海“驯服萨里”演习中发射了两枚海鸥导弹。.

老旧机龄终究会显现。2023年，海军司令拉赫曼·阿尤布海军上将透露，六架“山猫”反潜直升机中有两架因资金不足而长期封存。2024年，《海军新闻》报道称，海军需要在2026年至2030年间采购四架新型反潜直升机。但截至2026年10月，仍未收到任何订单。.

海军原计划庆祝成立90周年，直升机正在基地上空进行飞行表演彩排。2024年4月23日当地时间上午9点32分，第503中队的AW139 M503-3号直升机和第502中队的Fennec M502-6号直升机相撞。一架坠毁在基地体育场楼梯附近，另一架坠毁在游泳池附近。机上十人全部遇难：AW139直升机上七人，Fennec直升机上三人。.

根据维基百科对中央社报道的总结，2024年5月30日，调查人员发现一架直升机飞行高度错误，剐蹭了另一架直升机的旋翼。此次事故导致空军损失了三架AW139直升机中的一架和六架“小狐狸”直升机中的一架。.