1941年，加拿大皇家空军在萨格奈河可通航水域的源头寻找平坦的土地，最终找到了。该地区拥有开垦过的农田、地理位置相对偏僻、附近有深水港阿尔弗雷德港以及一条铁路。同年夏天，两处基地开始动工：位于希库蒂米附近的圣奥诺雷皇家空军基地（RCAF Station St-Honoré），于1942年6月启用；以及位于拉贝的巴戈特维尔皇家空军基地（RCAF Station Bagotville），于1942年7月17日启用，圣奥诺雷基地是其分基地。.

萨格奈河之所以值得守卫，是因为铝。位于阿维达的加拿大铝业公司（Alcan）冶炼厂是加拿大最大的工业企业之一，为盟军空军提供了大量金属装备，而为其供电的水电站也坐落于同一山谷。1942年，德国U型潜艇在海湾和圣劳伦斯河下游海域击沉船只，史称圣劳伦斯河战役。为了应对这一威胁并安抚当地民众的恐惧，巴戈特维尔和蒙特乔利两地同时成立，这并非易事。.

该基地同时承担两项任务。第一作战训练部队（1 OTU）根据英联邦空军训练计划，训练来自英联邦各地的战斗机飞行员，机型包括飓风战斗机、小鹰战斗机、哈佛教练机和莱桑德教练机；它是当时英国唯一的飓风战斗机训练基地。毗邻基地的是第130"黑豹"中队，这是一支负责冶炼厂防空作战的部队，其座右铭"保卫萨格奈"（Défendez le Saguenay）后来被整个基地采用。1943年10月24日，第129中队接管了防空任务，两个月后，第1 OTU将其并入。.

训练的统计数据令人警醒。在28个月的29期课程中，第1作战训练部队（1 OTU）培养了940名战斗机飞行员，但也有41人阵亡。随着对飞行员的需求下降，基地也随之衰落：第1作战训练部队于1944年10月28日停止运作，同年11月解散，巴戈特维尔和圣奥诺雷基地于1945年1月5日关闭并封存。.

第425中队于1942年6月22日在约克郡的迪什福斯皇家空军基地组建，是加拿大皇家空军第一支法裔加拿大籍部队，隶属于第6大队，装备维克斯·威灵顿轰炸机。该中队于1942年10月5/6日夜间对亚琛投入战斗。1943年，该中队部署至突尼斯凯鲁万，参与了对意大利和西西里岛的作战行动，之后于11月返回英国，并于12月换装汉德利·佩奇·哈利法克斯轰炸机，于1944年2月执行了哈利法克斯轰炸机的首次飞行任务。.

该部队在战争中的最后一次作战行动是1945年4月25日，目标是弗里斯兰群岛旺格罗格岛上的炮台。之后，该部队换装了加拿大制造的阿弗罗·兰开斯特Mk X型轰炸机，并于6月返回加拿大，准备加入“虎式部队”并入侵日本本土。然而，原子弹的出现使得“虎式部队”不再必要，425轰炸机中队于1945年9月5日在加拿大皇家空军德伯特基地解散，此时距离日本投降还不到三周。.

该中队于1954年10月在圣休伯特重建，装备CF-100“加拿大人”战斗机；1961年末，成为纳马奥CF-101“巫毒”战斗机的作战训练部队；1962年夏季，该中队迁至巴戈特维尔，并一直驻扎至今。1984年7月1日，该中队换装CF-188“大黄蜂”战斗机。2008年，该中队因在科索沃“盟军行动”中的出色表现，荣获二战以来首个战斗荣誉。.

其近期历史主要与东欧相关。2014年，作为北约在克里米亚被吞并后采取的保证措施的一部分，四架飞机被派往罗马尼亚的坎皮亚图尔齐；2016年3月，一个由四架飞机和约100名人员组成的分遣队被部署到米哈伊尔·科格尔尼恰努空军基地，参加“坚韧决心”演习；2022年，该中队再次返回米哈伊尔·科格尔尼恰努空军基地，以加强黑海地区的空中警戒。这就是2020年代萨格奈河畔战斗机基地的实际意义所在。.

随着朝鲜战争和冷战的加剧，巴戈特维尔空军基地于1951年7月1日重新启用，最初作为即将部署到欧洲的各中队的训练基地。第413和414中队在此使用佩刀式战斗机进行训练，随后于1953年3月参加了“蛙跳III”联合军演，部署到欧洲。第431中队于1954年1月以临时身份重建，装备佩刀式战斗机，并在九个月后解散。1954年，CF-100“加拿大人”全天候战斗机抵达巴戈特维尔，装备第432和440中队；1957年，CT-133“银星”教练机也加入该基地。.

“巫毒”导弹改变了基地的性质。1961年，第416中队在巴戈特维尔基地组建，装备CF-101战斗机，次年移驻查塔姆；1962年夏天，第425中队也抵达，装备的是同型号飞机。这些飞机经过改装，可以携带AIR-2“精灵”导弹，这是一种无制导空对空火箭，带有核弹头，旨在摧毁苏联轰炸机群。这些核弹头根据1963年导致迪芬贝克政府垮台的危机后制定的保管安排，储存在巴戈特维尔基地。.

他们一直待到 20 世纪 80 年代初核武器撤出为止。这是基地历史上游客最不了解的部分，也是对这个地方改变最大的部分：二十年来，一个宁静的魁北克峡湾小镇与美国的核武器基地毗邻而居，而这种安排既不秘密，也鲜为人知。.

1968年2月1日合并后，加拿大皇家空军巴戈特维尔基地更名为加拿大空军巴戈特维尔基地。同年，第410中队在此组建训练，并于1982年迁至冷湖；第433中队于1969年9月重组后抵达，装备CF-5战斗机；第434中队"蓝鼻子"于1982年接替第410中队，并于1985年7月前往查塔姆。1984年7月1日，第425中队用其巫毒战斗机换装了黄蜂战斗机，1985年，首批两架黄蜂战斗机开始执行北美防空司令部（NORAD）的24小时值守任务。.

第433中队于1943年9月25日在斯基普顿-昂-斯韦尔皇家空军基地组建，随后近两个月没有飞机可用。哈利法克斯Mk III型轰炸机抵达后，该中队于1944年1月2日完成训练并开始作战，在欧洲大陆上空进行了一年的夜间飞行，之后于1945年1月换装兰开斯特轰炸机。从1944年1月到1945年4月，这支绰号“豪猪”的中队共成功执行了2316次任务。战后，他们负责从德国和意大利运送部队和战俘回国，直到1945年10月15日在斯基普顿-昂-斯韦尔解散。.

该中队于1954年11月15日在冷湖重新组建为全天候战斗机中队，1955年10月移驻北湾，装备CF-100战斗机执行北美防空任务，并于1961年7月31日解散。1969年9月26日，该中队在巴戈特维尔以机动司令部法语中队的身份重新组建，装备CF-5自由战士战斗机执行战术和侦察任务，并于1984年换装CF-188大黄蜂战斗机。该中队于1986年停止运作进行重组，并于1988年1月重新装备大黄蜂战斗机。.

随后，它再次消亡。2005年7月14日，这支服役62年的中队被解散，其飞机和人员并入425中队，后者成为一个双语单位。"豪猪"中队只剩下记忆和一枚徽章——银底金豪猪，配以座右铭"Qui s'y frotte s'y pique"，大致意思是“谁碰它谁就被刺伤”——而中队成员也从此四散各地。.

该中队于2015年6月9日在巴戈特维尔重新启用，使加拿大皇家空军恢复了四个战斗机中队。空军司令伊万·布隆丁中将出席了启用仪式。他本人也曾在第433中队服役，驾驶CF-188战斗机，并在十年前签署了该中队军旗退役的命令。中队成员被称为"Ti-pics"，布隆丁中将也用这个词来称呼自己。.

1996年7月19日至21日，连续两周的降雨导致土壤饱和，引发了加拿大20世纪历史上最大的陆地洪水。萨格奈河两天内的降雨量相当于尼亚加拉瀑布四周的流量；希库蒂米和拉贝的部分地区被超过两米深的洪水淹没。洪水造成10人死亡，另有2人死于洪水引发的泥石流，488栋房屋被毁，1230栋房屋受损，16000人被疏散，损失高达约15亿加元。.

巴戈特维尔基地成为了该地区的避难所。在加拿大军队开展的规模最大的国内救援行动之一——萨格奈行动中，该基地收容了4189名撤离人员，其厨房供应了创纪录的15000份餐食。该基地在萨格奈地区的地位并非取决于征兵海报；它源于1996年那两周的经历，至今仍令山谷中的大多数人记忆犹新。.

往年，巴戈特维尔与当地的联系主要体现在工资发放和航展上。巴戈特维尔拥有约1700名军人和文职人员，是该地区最大的雇主之一。自1953年以来，巴戈特维尔国际航展大约每两年举办一次；2024年6月22日至23日举行的航展吸引了创纪录的15.1万名观众，其中周六8.3万人，周日6.8万人，这是该航展时隔五年再次举办。航空博物馆就坐落在基地内，馆外陈列着各种飞机。.

未来已然化为现实。1999年3月1日，第12雷达中队在此成立，取代了位于阿皮卡山的已关闭雷达站。2012年，可部署远征联队司令部——第2中队成立，其耗资1.31亿英镑的设施于2023年开始建设。2024年8月，波默罗开始为北美防空司令部（NORAD）建造耗资1.2亿英镑的CF-35A快速反应警戒设施：该设施占地1.7万平方米，包括7400平方米的机库、办公室和机组人员宿舍，预计将于2027年竣工，届时将为当地创造600多个就业岗位。.