RAF Akrotiri, 1 Temmuz 1955'te, istasyonun kendi tarihçesinde "rüzgarlı Akrotiri Yarımadası'ndaki düz, kuru, kayalık çalılık alan" olarak tanımlanan yere 30 personelin atanmasıyla başladı. Planlanandan çok daha hızlı büyüdü. Ağustos 1956'nın sonuna kadar istasyonun personel sayısı 260 subay ve 2.864 erden oluşuyordu; RAF bunu on iki ayda yaşanan büyük bir artış olarak tanımlıyor. Karavanlar ve çamurlu yollardan istasyon kuruldu, yollar yapıldı ve hangarlar ile bazı kalıcı binalar inşa edildi. İnşaat talebin çok gerisinde kaldığı için, çoğunlukla aşırı kalabalık ve sağlıksız koşullar nedeniyle 1.430 personel her gün hasta raporu alıyordu.

Birkaç ay içinde Musketeer Operasyonu başladı. İmparatorluk Savaş Müzesi'nin kayıtlarına göre, RAF ve Filo Hava Kuvvetleri 31 Ekim 1956'da Mısır'ı bombalamaya başladı; Kıbrıs ve Malta'dan kalkan Valiant ve Canberra uçakları havaalanlarını, Venom uçakları ise birlikleri, uçakları ve araçları hedef aldı. 8. Filo'nun Venom uçakları 1 Kasım şafak vakti Kanal Bölgesi havaalanlarına ve Kahire yakınlarındaki Huckstep'teki tank parkına saldırdı ve filo iki gün içinde yerde 43 uçağı imha ettiğini iddia etti. 7 Kasım'da ateşkes ilan edilerek operasyonel uçuşlar sona erdi.

Üs, aynı zamanda ülke içinde de hedef alınmıştı. EOKA harekatı sırasında, 27 Kasım 1957'de bir hangarda patlayan bir bomba, 6, 13 ve 73 numaralı filoların Canberra uçaklarını yok eden bir yangına neden oldu. İngiltere Seri Numaraları kayıp kayıt defteri, seri numarasına göre dört Canberra uçağını listeliyor; 6 Numaralı Filo Derneği ise bir hangarın yandığını ve beş uçağın kaybedildiğini kaydediyor. Bu nedenle bu sayfada 4-5 uçağın imha edildiği belirtiliyor. Her iki kaynak da herhangi bir can kaybı kaydetmiyor.

Kıbrıs, 16 Ağustos 1960'ta Birleşik Krallık'tan bağımsızlığını kazandı, ancak adanın tamamı değil. Cumhuriyeti kuran antlaşmaya göre, Birleşik Krallık batıda Akrotiri ve doğuda Dhekelia olmak üzere iki Egemen Üs Bölgesi üzerinde egemenliğini korudu. Avam Kamarası Kütüphanesi, bu bölgelerin toplam alanını 98 mil kare olarak belirtiyor; bu da adanın yaklaşık %3'üne denk geliyor. Eş zamanlı bir antlaşma ise Yunanistan, Türkiye ve Birleşik Krallık'ı Kıbrıs'ın bağımsızlığını, toprak bütünlüğünü ve güvenliğini garanti altına almaya mecbur etti.

Üsler İngiliz topraklarında yer alıyor, ancak İngiliz kasabaları değiller. Birleşik Krallık, buraları askeri amaçlar dışında geliştirmemeyi ve koloni, yeni yerleşim yeri, ilgisiz ticari işletme veya sivil liman ve havaalanı oluşturmamayı taahhüt etti. Egemen Üs Bölgeleri içinde yaklaşık 10.000 Kıbrıslı, yaklaşık 3.800 askeri ve Birleşik Krallık merkezli personel ve aile fertleriyle birlikte yaşıyor. Arazinin yaklaşık 'ı özel mülkiyete ait olup, Savunma Bakanlığı ve Egemen Üs Yönetimi'nin her birinin yaklaşık 'lik payı bulunmaktadır.

Bu düzenlemeler istasyondaki günlük yaşamı şekillendiriyor. Kıbrıs Avrupa Birliği'ne katıldığında, 2003 katılım anlaşmasına eklenen bir protokol, AB hukukunun üslerde nasıl uygulanacağını belirledi. Ayrı bir 2003 anlaşması ise Kıbrıs yetkililerini üs bölgesine gelen göçmenlerden sorumlu tutuyor ve bu durum Ekim 2015'te yüzden fazla insanı taşıyan teknelerin Akrotiri kıyılarına yanaşmasıyla test edildi. Mart 2026'daki insansız hava aracı saldırısından sonra Kıbrıs hükümeti sözcüsü üslerin durumu hakkında şunları söyledi: "Bu bağlamda, hiçbir şeyi dışlamıyoruz."’

1960'lar boyunca Akrotiri, Doğu Akdeniz'deki RAF'ın (Kraliyet Hava Kuvvetleri) taarruz üssüydü. Yakın Doğu Hava Kuvvetleri Taarruz Kanadı, 10 Ocak 1969 gece yarısına kadar Merkezi Antlaşma Örgütü'nü desteklemek amacıyla Canberra uçakları uçurdu ve 6. Filo da bu kanat tarafından kapatıldı. Üssün tarihçesinde, 1960'lar ve 1970'leri en parlak yılları yapan birimler arasında Lightning, Vulcan, Hercules, Argosy ve Canberra uçakları ile Whirlwind ve Wessex helikopterleri listelenmiştir.

Temmuz 1974'teki Türk işgali, üsleri bir sığınak haline getirdi. 22 Temmuz'da Dışişleri Bakanı James Callaghan, Avam Kamarası'na adadaki İngiliz vatandaşlarının büyük bir bölümünün, diğer birçok yabancı uyrukluyla birlikte, artık egemen üs bölgelerinde toplandığını söyledi. 30 Temmuz'da Savunma Bakanı Roy Mason, 49 farklı uyruğa sahip 8.000 kişinin (İngiliz vatandaşları ve turistler) eve getirildiğini ve üslerin dışında yaşayan yaklaşık 1.200 askerin yakınının tahliye edildiğini bildirdi.

Daimi vurucu güç krizden sonra varlığını sürdüremedi. Mason, 3 Aralık 1974 tarihli Savunma İncelemesi açıklamasında şunları söyledi: "Kıbrıs'ta, özellikle orada konuşlanmış hava kuvvetlerimizde bazı erken azaltmalar yapmayı öneriyoruz." Üssün tarihçesine göre, 1980'lerin sonuna gelindiğinde sadece 84. Filo'nun helikopterleri kalmıştı ve Akrotiri bir eğitim, ileri operasyon ve ileri konuşlanma üssü olarak hayatına başladı. 1990 tarihli bir parlamento cevabında, Ortadoğu barış koruma düzenlemelerini desteklemek amacıyla 1974'ten beri orada daimi olarak bir ABD Hava Kuvvetleri U-2 uçağının konuşlandırıldığı belirtiliyor.

İleri konuşlanma rolü, Temmuz 2006'da Lübnan'daki savaşın İngiliz vatandaşlarının tahliyesini zorunlu kıldığı zaman test edildi. Savaş gemileri, tahliye edilenleri Beyrut'tan Kıbrıs'a taşıdı; burada işlemler yapıldıktan sonra İngiltere'ye uçakla gönderildiler. Hükümetin ders çıkarma raporuna göre, 18-24 Temmuz tarihleri arasında toplamda yaklaşık 4.500 İngiliz vatandaşı tahliye edildi. İstasyonun kendi kayıtlarına göre ise sadece 18 ve 19 Temmuz'da Akrotiri üzerinden 2.000'den fazla İngiliz tahliye edildi.

Shader Operasyonu, Akrotiri'yi İngiliz hava kuvvetlerinin IŞİD'e karşı ana operasyon üssü haline getirdi. 30 Eylül 2014'te, üsten kalkan ve silahlı keşif görevi yapan iki Tornado GR4, Irak harekatının ilk saldırılarını gerçekleştirdi: ağır silah mevzisine bir Paveway IV bombası ve silahlı bir kamyonete bir Brimstone füzesi. Avam Kamarası'nın 2 Aralık 2015'te Suriye'ye saldırıları genişletme kararı almasının ardından, Tornadolar ertesi gün ilk taarruz görevini gerçekleştirdi.

14 Nisan 2018'de, Duma'ya yapılan kimyasal saldırının ardından, Suriye'ye yaklaşık 500 kilometre uzaklıktaki Akrotiri'den dört Tornado GR4 havalandı ve Homs'un yaklaşık 24 kilometre batısında bulunan, kimyasal silah öncülleri depoladığı düşünülen eski bir füze üssüne sekiz adet Storm Shadow seyir füzesi fırlattı. Haziran 2019'da üs, İngiltere tarafından gerçekleştirilen ilk operasyonel F-35B Lightning sorti uçuşlarını başlattı; eğitim için konuşlandırılan 617. Filo jetleri Suriye üzerinde Shader devriyelerine geçti.

İstasyonun etki alanı Levant'ın çok ötesine uzanıyor. 11-12 Ocak 2024 gecesi, Voyager tankerlerinin desteğiyle dört Typhoon FGR4 uçağı, Yemen'deki Bani'deki bir insansız hava aracı üssünü ve Abbs'deki havaalanını Paveway IV bombalarıyla vurdu ve Avam Kamarası Kütüphanesi, üslerin Ocak ve Şubat 2024'te Husi hedeflerine yönelik İngiliz saldırıları için kullanıldığını doğruluyor. Bu baskınlar ve Ekim 2023'ten itibaren Gazze üzerinde gerçekleştirilen yüzlerce silahsız İngiliz gözetleme uçuşu, protestocuları üs kapılarına getirdi.

İstasyon, 20 Mart 2003'te Ramsar Sözleşmesi kapsamında Uluslararası Öneme Sahip Sulak Alan olarak belirlenen Akrotiri tuz gölü ile aynı yarımadada yer almaktadır. Alan 2.171 hektarlık bir alanı kapsamakta olup, güney sınırında RAF Akrotiri bulunmaktadır. JNCC bilgi notunda göl, Doğu Akdeniz'deki yarı doğal durumdaki çok az sayıdaki büyük tuz gölünden biri olarak tanımlanmakta ve 1998 ile 2002 yılları arasında ortalama 6.000 büyük flamingo sayısına ulaşıldığı, bunun da bölgesel popülasyonun yaklaşık %2'sine denk geldiği belirtilmektedir.

Kuşlar ve direkler uzun süredir devam eden bir tartışma konusu olmuştur. Pluto projesi yarımadaya iki anten yerleştirdi: 1999'da 58 metre yüksekliğindeki Pluto I ve 2003'te 96 metre yüksekliğindeki Pluto II. Bern Sözleşmesi Daimi Komitesi'ne rapor veren bağımsız bir uluslararası panel, 1997'deki orijinal çevre değerlendirmesinde turna kuşları ve büyük flamingolar için eksiklikler buldu. Panel, Pluto II'nin en önemli türler üzerinde minimum düzeyde etki yaratacağını ancak ölüm oranlarını artırabileceğini belirterek gece aydınlatması, gergi teli işaretleyicileri ve izleme yapılmasını istedi.

Tartışma 2026'da yeniden alevlendi. Mayıs ayında Kourion belediyesi, İngilizlerin daha fazla anten kurma planına karşı ihtiyati tedbir kararı almak üzere avukatlar görevlendirdi. Cyprus Mail gazetesi, bu planın koruma altındaki bir alanda yaklaşık 340 dönümlük kamulaştırma gerektiren 32 direk içerdiğini bildirdi. Eylül ayında sakinler tekrar protesto etti ve aynı gazete, 18 mevcut antenin kaldırılmasıyla birlikte 68, 68 ve 31-34 antenden oluşan üç aşamayı tanımladı. Bu nedenle, genişleme için yayınlanan rakamlar 32 ile yaklaşık 170 anten arasında değişiyor. Sakinler kanser korkusunu dile getiriyor, ancak Pluto kurulumunun bağımsız testleri emisyonların AB sınırlarının çok altında olduğunu gösterdi.

İstasyona 1986'dan beri yapılan ilk saldırı, ABD ve İsrail'in 28 Şubat 2026'da İran'a saldırmaya başlamasından bir gün sonra gerçekleşti. 2 Mart yerel saatiyle 00:03'te (1 Mart GMT 22:03), İran yapımı Şahed tipi bir insansız hava aracı RAF Akrotiri'deki bir hangara isabet etti; bu saat farkı nedeniyle İngiliz kaynakları saldırıyı 1 Mart, Kıbrıs kaynakları ise 2 Mart olarak tarihlendiriyor. Middle East Eye, Amerikan U-2 uçakları tarafından kullanılan hangarın alev aldığını bildirdi; Savunma Bakanlığı içerideki ekipmanın hasar görmediğini söyledi. Kimse yaralanmadı.

Kıbrıs yetkilileri, insansız hava araçlarının Lübnan'daki İran destekli Hizbullah grubu tarafından ateşlendiğini söyledi. İngiliz Savunma İstihbaratı, insansız hava aracının türü, menzili ve performansı göz önüne alındığında İran'dan fırlatılmadığı sonucuna vardı; Savunma Bakanlığı ise Lübnan veya Batı Irak'taki İran yanlısı bir milis grubunu işaret etti ancak soruşturmanın fırlatma noktasını kesin olarak belirleyemediğini söyledi. Kıbrıs hükümeti, 2 Mart'ta üsse doğru giden iki insansız hava aracının daha ele geçirildiğini açıkladı.

Ardından takviye kuvvetler geldi. 3 Mart'ta Savunma Bakanı John Healey, Doğu Akdeniz için Martlet füzeleriyle donatılmış Type 45 sınıfı HMS Dragon destroyerini ve Wildcat helikopterlerini, ayrıca ek hava savunma radarları ve insansız hava aracı karşıtı sistemleri duyurdu. Fransa ve Yunanistan, Kıbrıs'ı korumaya yardımcı olmak için gemi ve uçak gönderdi. HMS Dragon, mühimmat yüklemek için yaklaşık bir hafta bekletildi ve Kıbrıs'ın Londra Büyükelçisi Kyriacos Kouros, "halk hayal kırıklığına uğradı, halk korktu" dedi.