في عهد الشاه، كانت القاعدة تُسمى شاهروخي. بعد الثورة، أُعيد تسميتها نسبةً إلى الكابتن محمد نوجي، الذي وصفته ويكيبيديا الإنجليزية بأنه أول طيار في سلاح الجو يُقتل في معركة، وذلك في 16 أغسطس 1979.

في غضون عام، ارتبط الاسم بمؤامرة. يذكر سرد ويكيبيديا لمؤامرة انقلاب نوجيه أن عقيدًا متقاعدًا من قوات الدرك، يُدعى محمد باقر بني عامري، هو من نظم الجانب العسكري منها، بدعم مالي من شابور بختيار، آخر رئيس وزراء للشاه، ومنوشهر قربانيفر كحلقة وصل بينه وبين المؤامرة. تمحورت الخطة حول القاعدة الجوية قرب همدان. اكتشفت السلطات ثماني خلايا رئيسية قبل بدء العملية، ونُفذت اعتقالات في القاعدة يومي 9 و10 يوليو/تموز 1980.

الأرقام المذكورة صادمة: 284 معتقلاً و144 معدوماً، وتسريح ما بين 2000 و4000 عسكري في الأشهر اللاحقة. صرّح الرئيس أبو الحسن بني صدر بأن الهدف الحقيقي للمتآمرين كان إثارة اضطرابات داخلية كذريعة لغزو العراق؛ وادّعى بختيار الحصول على مباركة أمريكية، وهو ما نفاه موقع ويكيبيديا. شنّ العراق هجوماً بعد عشرة أسابيع، على سلاح جوّي كان قد خضع لتوه لعملية تطهير جديدة.

نفّذت طائرات فانتوم التابعة لنوجيه بعضًا من أكبر الغارات الإيرانية في الأسابيع الأولى من الحرب. ويذكر سرد ويكيبيديا لعملية كامان 99، المستمد في معظمه من روايات إيرانية، أن 40 طائرة من طراز إف-4 فانتوم أقلعت من همدان في 23 سبتمبر 1980، بعد يوم من الهجوم العراقي المفاجئ: 16 طائرة من طراز إف-4إي ضد الكوت، و12 طائرة ضد الرشيد قرب بغداد، و8 طائرات ضد مطار بغداد.

بعد أسبوع، في 30 سبتمبر، نفّذت أربع طائرات من طراز إف-4 تابعة للسرب المقاتل التكتيكي 33 من قاعدة نوجه، التابعة للكتيبة التكتيكية الثالثة، عملية "السيف الحارق" ضد مركز التويثة النووي ومفاعل أوسيراك التابع له، بدعم من طائرة تزويد وقود من طراز بوينغ 707 برفقة طائرات إف-14. وتشير الروايات الإيرانية إلى أن قنابل أصابت المفاعل، بينما وصف مراقبون عراقيون وغربيون الأضرار بأنها طفيفة.

في 4 أبريل 1981، غادرت ثماني طائرات فانتوم، ست منها من طراز F-4E واثنتان من طراز F-4D، مدينة همدان متجهةً إلى قواعد H-3 الجوية قرب الحدود الأردنية، حيث تزودت بالوقود فوق بحيرة أورميا، ثم مرة أخرى من ناقلات وقود عبرت تركيا وسوريا دون أي اتصال لاسلكي. وتزعم إيران تدمير عشرات الطائرات العراقية، بينما أفاد العراق بتضرر طائرة ميغ-21 واحدة فقط. ولم يتم تأكيد أي من الرقمين بشكل مستقل.

في 16 أغسطس 2016، بدأت قاذفات توبوليف تو-22 إم الروسية بعيدة المدى وطائرات سوخوي سو-34 الهجومية شن غارات جوية فوق سوريا من القاعدة، وفقًا لمقالات ويكيبيديا الإنجليزية حول القاعدة والتدخل الروسي في سوريا.

تغيرت تبريرات الحكومة الإيرانية في غضون أيام. فقد صرّح وزير الدفاع حسين دهقان بأن إيران تستضيف الطائرات بناءً على طلب الحكومة السورية، وأن روسيا يمكنها استخدام القاعدة طالما دعت الحاجة. وفي 21 أغسطس/آب، وفقًا لموقع ويكيبيديا، قال إنه لن تُقدّم إيران للروس قاعدة عسكرية تحت أي ظرف من الظروف. وفي 22 أغسطس/آب، أعلن المتحدث باسم وزارة الخارجية أن روسيا أوقفت استخدام القاعدة مؤقتًا.

يشير موقع GlobalSecurity، وهو موقع مرجعي مفتوح المصدر، إلى رؤية طائرة Su-34 على الساحة الرئيسية في وقت مبكر من 23 نوفمبر 2015.

في اليوم الأول من حرب الأيام الاثني عشر، الموافق 13 يونيو 2025، وردت أنباء عن انفجارات في قاعدة همدان الجوية، وأكد الجيش الإسرائيلي لاحقًا استهدافه لها، وفقًا لما ورد في ويكيبيديا عن الحرب. وشنّ سلاح الجو الإسرائيلي غارات على قواعد جوية وطائرات في أنحاء إيران خلال الأيام التالية. ولم تنشر إيران أي بيان رسمي عن الأضرار التي لحقت بنوجه، كما أن خسائرها هناك غير معروفة من مصادر متاحة للعموم.

لم تتوقف الغارات عند هذا الحد. يذكر موقع ويكيبيديا أن طائرات إسرائيلية قصفت ستة مطارات في غرب وشرق ووسط إيران يومي 22 و23 يونيو/حزيران 2025، مستهدفةً مدارج الطائرات ومنشآت تحت الأرض، ويزعم الموقع تدمير 15 طائرة مقاتلة ومروحية إيرانية، من بينها طائرات إف-14 وإف-5 وإيه إتش-1؛ دون تحديد عددها، إن وُجد، في مطار نوجه. وفي ديسمبر/كانون الأول 2025، أقر الجيش الإيراني، وفقًا للمصدر نفسه، بأن تقاريره السابقة عن إسقاط طائرتين إسرائيليتين من طراز إف-35 كانت كاذبة.