该机场最初并非波兰基地。德国吞并大波兰后，1940年，在波兹南东南郊的格乌什纳村和克热西尼村之间，福克-沃尔夫波森-克雷辛飞机制造厂（Flugzeugfabrik Focke-Wulf Posen-Kreising）开始动工，该厂拥有自己的机场。《波兹南城市编年史》（Kronika Miasta Poznania）记载，该厂生产Fw 190战斗机，并参与Ta 154的研发工作，雇佣了约7000名员工。.

1944年，美国陆军航空兵对该地进行了轰炸。当地历史网站Polot记录了4月9日和5月29日的空袭；该市自身的资料则侧重于第二次空袭，即圣灵降临节当天，当时B-17轰炸机投下了近百枚炸弹，摧毁了车间、机库、飞机和跑道。2009年的编年史记载，85%的建筑物遭到破坏。该编年史还指出，来自奥斯特鲁夫·维尔科波尔斯基的波兰地下抵抗组织无线电操作员爱德华·西科拉通过秘密无线电传递了目标信息。.

1945年2月23日波兹南战役结束后，苏联红军于3月接管了该机场。苏联第836轰炸航空团从列宁格勒地区抵达，装备了图-2轰炸机。1945年4月16日，该团各中队从这里飞往泽洛高地，这是德军在柏林前的最后一道重要防线。关于苏军最终撤离的时间，各方说法不一。市政史料记载，该机场于1954年移交给波兰军队，而波洛特则记录了波兰第11战斗机团早在1951年4月就从瓦维察进驻。.

1954年9月，克热西尼成为战斗机基地，当时国防部下令组建第62战斗机训练团。波洛特称该团由第11战斗机团第2中队改编而成。1957年，该团正式成为正规战斗机团，番号为“第62战斗机团”（62. Pułk Lotnictwa Myśliwskiego），并加入国家防空系统。1958年，该团更名为“大波兰起义军”（62. Pułk Lotnictwa Myśliwskiego），以纪念1918-1919年的大波兰起义军。关于更名日期，各方说法不一：有的说是1958年9月6日，有的说是1958年10月13日。.

该团经历了苏联战斗机的整个发展历程。最初装备的是米格-15及其波兰特许生产的改进型Lim-1和Lim-2，1958年接收了Lim-5，1959年接收了米格-19P和米格-19PM全天候截击机。1962年机场重建后，米格-21也随之到位。据城市史料记载，1966年的进一步重建迫使该团暂时迁往他处，先是巴比莫斯特，后是扎里。.

战斗机时代付出了惨痛的生命代价。波洛特和当地历史学家汇编的事故清单显示，1963年至1992年间，第62战斗机团及其后继团至少有六名飞行员在驾驶米格-21战斗机时阵亡，其中包括基地指挥官。共产主义政权垮台后，该团于1994年更名为第3战斗机团，并于1999年吸收了波兹南另一军用机场——瓦维察机场的第17中队。2001年1月1日，该基地重组为第31空军基地（JW 1156）和第3战术空军中队，该中队继续驾驶米格-21战斗机直至2003年。.

波兰于2002年12月选定F-16战斗机，并于2003年4月18日签署了36架F-16C和12架F-16D Block 52+的采购合同，击败了鹰狮和幻影2000-5的竞争。克热西尼空军基地此前已被选定为接收基地。早在2001年，波兰就决定建造一座符合北约标准的F-16基地，并于2002年7月12日正式启用新的跑道和停机坪。根据计划，克热西尼基地接收32架F-16，拉斯克基地接收剩余的16架。目前克热西尼基地究竟有多少架F-16尚未公布。.

第一架飞机于2006年11月8日抵达波兰，此前它飞越大西洋并进行了空中加油。第二天，莱赫·卡钦斯基总统正式接见了这架飞机，第一夫人玛丽亚·卡钦斯卡为该机型命名为“鹰”（Jastrząb）。首批三名波兰飞行员于2006年6月完成了在美国的改装训练：他们分别是达里乌什·马利诺夫斯基准将、罗斯奇斯瓦夫·斯捷潘纽克上校和兹比格涅夫·扎瓦达中校。《波兰军工报》（Polska Zbrojna）报道称，到第一年年底，波兰已有18名飞行员接受了培训。《大波兰之声》（Głos Wielkopolski）则表示，48架喷气式飞机中的最后三架于2008年12月抵达波兰。.

飞行员大多来自米格-21战斗机，而这种转变远比新飞机本身更大。洛克希德·马丁公司的杂志《Code One》曾描述米格-21的飞行任务时长仅为20至40分钟，且航电设备有限。F-16则带来了更长时间的任务、空中加油以及北约的作战程序。驻扎在克热西尼的第3中队负责波兰本土的F-16基础训练课程，首批学员于2010年毕业，同年波兰的F-16战斗机正式接管了快速反应警戒任务。第6中队于2006年从波维兹迁至克热西尼，并于2011年9月通过了北约的部队评估。这两个中队于2008年合并，隶属于第31战术空军基地。.

第6中队是克热西尼空军基地的“老虎”中队。波兰于2011年首次参加北约“老虎”飞行大会，那一年也是该协会成立50周年。波兰国防部表示，该中队在2014年赢得最佳飞行中队称号后，正式成为北约“老虎”协会的成员。此后，该中队参加了协会的各项演习和比赛，最近一次是在希腊阿拉克索斯举行的2026年“老虎”飞行大会，该大会由希腊第335中队主办。.

2018年5月，正值波兰独立一百周年之际，该中队在克热西尼空军基地举办了“老虎会”，这是波兰首次举办此类活动。5月14日至25日，来自13个国家的22个飞行中队从该基地起飞了约70架飞机、10架直升机和一架北约预警机，其中包括F-16战斗机、台风战斗机、阵风战斗机、鹰狮战斗机和旋风战斗机，以及瞪羚直升机、美洲狮直升机和梅林直升机。波兰国防部称这是波兰空军当年规模最大的行动，参与人员超过2000人。.

同一个中队孕育了波兰F-16“虎”式战斗机飞行表演队。该队成立于2015年，并于同年9月在基地周年庆典上进行了首次表演。希腊宙斯飞行表演队的飞行员负责培训波兰首批飞行员。该队使用一架涂有虎纹涂装的普通F-16C Block 52+战斗机。罗伯特·格瓦兹卡上尉是该队的首位飞行表演飞行员。马切伊·克拉科夫扬于2023年春季接任，据消息人士透露，具体时间是4月下旬或5月。.

2025年8月28日，该飞行队的征程在拉多姆以悲剧告终。时任少校兼队长克拉科夫在为第18届拉多姆国际航展进行彩排时不幸遇难，航展也因此取消。这是波兰F-16飞行队近二十年来首例致命事故。军事检察官和国家事故调查委员会正在对此事进行调查。.

克热西尼位于波兹南市境内，F-16战斗机的到来使该基地卷入了一场法律纠纷。2003年12月17日，大波兰省长在机场周围设立了限制使用区（第50号条例）。限制区内的业主可以就财产损失申请赔偿。2006年F-16战斗机开始飞行后，《大波兰之声》报道称，当地居民因不愿忍受噪音而举行了抗议活动。.

索赔案件数量迅速增长。《大波兰之声》报道称，该地区的飞机所有者索赔金额接近2.8亿兹罗提。到2013年初，约500起案件已使军方损失约3900万兹罗提，另有约200起案件仍在审理中。在2008年的一起案件（II CSK 367/08）中，最高法院裁定，飞机所有者无需证明飞行行为违法，因为飞机运营责任即风险责任。.

随后，法院意见出现分歧。2008年的一项法律修改将设立此类区域的权力从省长（voivode）移交给了地区议会。最高行政法院在2009年和2010年裁定，2003年的法规因此失效，而最高法院和普通法院则继续将其视为有效。到2019年底，该问题已提交至宪法法院。《大波兰之声》（Głos Wielkopolski）报道称，在约4500名有权获得补偿的居民中，只有约1500人提出了索赔。.

俄罗斯入侵乌克兰时，克热西尼空军基地的F-16战机正处于快速反应任务状态。第6中队指挥官卢卡什·格拉津斯基中校告诉《波兰武器报》，2022年2月24日当天一切平静，没有紧急升空作战。凌晨4点左右警报响起，此后战机便开始不间断地执行任务。随后，战机在东部边境沿线进行了持续的空中巡逻。.

该基地此前已被用于测试美国从分散式机场起飞的计划。2018年7月中旬至8月中旬，该基地承办了美国空军在欧洲首次部署式空军基地系统演习，参演人员包括美国空军、空中国民警卫队和美国陆军人员。2021年4月，来自英国皇家空军莱肯希思基地的第48战斗机联队的F-15E和F-15C战斗机飞抵拉斯克和克热西尼，参加了敏捷作战部署演习。.

最引人注目的盟军力量来自挪威。根据波兰和挪威于2024年12月达成的协议，来自厄兰空军基地第132航空联队的四架挪威皇家空军F-35A战斗机于2025年1月8日至9日降落在克热西尼空军基地。它们执行北约的综合防空和导弹防御任务，负责守卫包括热舒夫-亚西翁卡枢纽在内的多个区域，该枢纽是向乌克兰运送援助物资的必经之地。2025年1月15日晚，在俄罗斯对乌克兰发动导弹袭击期间，其中两架战斗机紧急升空。第一轮部署持续到夏季，第二轮部署包括四架飞机和约100名人员，于2025年10月初抵达。.

波兰空军（Polska Zbrojna）描述了挪威的F-35和波兰的F-16在同一停机坪协同作战的场景。第三中队指挥官米哈乌·兹洛赫中校（Lt Col Michał Zloch）用通俗易懂的方式说道：在联合任务中，F-35才是真正突破防线的利器。这预示着波兰未来第五代战机的发展方向。波兰首个F-35中队将在瓦斯克（Łask）而非克热西尼（Krzesiny）组建。克热西尼的下一步计划是升级F-16V战机，该项目于2025年8月签署，净价约为38亿美元，预计将于2028年至2038年间在比得哥什的WZL-2工厂完成。.