Аэродром изначально не был польской базой. После аннексии Германией Великой Польши в 1940 году началось строительство авиазавода Flugzeugfabrik Focke-Wulf Posen-Kreising, имевшего собственный аэродром между деревнями Глушина и Кшесины на юго-восточной окраине Познани. Городская хроника «Кроника мира Познани» сообщает, что завод производил истребители Fw 190 и работал над Ta 154, и что на нем работало около 7000 человек.

В 1944 году за ним напали ВВС США. На местном историческом сайте Polot указаны налеты 9 апреля и 29 мая; собственные источники города сосредоточиваются на втором налете, в Троицкое воскресенье, когда бомбардировщики B-17 сбросили почти 100 бомб и уничтожили мастерские, ангары, самолеты и взлетно-посадочные полосы. В хронике 2009 года указывается, что разрушено 85 процентов зданий. В ней также говорится о том, что Эдвард Сикора, радист польского подполья из Острува-Велькопольского, передавал информацию о целях по секретной радиосвязи.

После окончания битвы за Познань 23 февраля 1945 года, в марте аэродром заняла Красная Армия. Из Ленинграда прибыл советский 836-й бомбардировочный авиационный полк на бомбардировщиках Ту-2, и 16 апреля 1945 года его эскадрильи вылетели отсюда на Зееловские высоты, последнюю крупную немецкую линию фронта перед Берлином. Источники расходятся во мнениях относительно того, когда советские войска окончательно покинули аэродром. В муниципальной истории передача аэродрома польской армии датируется 1954 годом, в то время как Полот указывает на то, что польский истребительный полк, 11-й, передислоцировался из Лавицы еще в апреле 1951 года.

Кшесины стали истребительной базой в сентябре 1954 года, когда Министерство национальной обороны распорядилось сформировать 62-й учебно-истребительный истребительный полк. По данным издания Polot, он был сформирован из 2-й эскадрильи 11-го истребительного полка. В 1957 году он стал регулярным истребительным полком, 62-м учебно-истребительным полком, и вошел в состав национальной системы противовоздушной обороны. В 1958 году он получил название в честь повстанцев Великой Польши 1918–1919 годов. Источники расходятся во мнениях относительно даты присвоения названия: 6 сентября или 13 октября 1958 года.

Полк эксплуатировался на протяжении всех поколений советских истребителей. Началось всё с МиГ-15 и их польских лицензионных версий, Лим-1 и Лим-2, затем в 1958 году получил Лим-5, а в 1959 году — всепогодные перехватчики МиГ-19П и МиГ-19ПМ. МиГ-21 поступил в 1962 году после реконструкции аэродрома. Городская хроника сообщает, что дальнейшая реконструкция в 1966 году вынудила полк на некоторое время перебазироваться, сначала в Бабимост, а затем в Жары.

Годы службы в истребительной авиации унесли множество жизней. В списках авиакатастроф, составленных Полотом и местными историками, упоминаются как минимум шесть летчиков 62-го полка и его преемника, погибших в боях на МиГ-21 в период с 1963 по 1992 год, в том числе командир базы. После окончания коммунистического режима в 1994 году полк был переименован в 3-й истребительный полк, а в 1999 году в его состав вошла 17-я эскадрилья из Лавицы, другого военного аэродрома Познани. 1 января 2001 года он был реорганизован в 31-ю авиабазу (JW 1156) и 3-ю тактическую авиаэскадрилью, которая продолжала летать на МиГ-21 до 2003 года.

Польша выбрала F-16 в декабре 2002 года и 18 апреля 2003 года подписала контракт на 36 истребителей F-16C и 12 F-16D Block 52+, опередив Gripen и Mirage 2000-5. Кшесины уже были выбраны для их размещения. Решение о создании базы F-16, соответствующей стандартам НАТО, было принято в 2001 году, а 12 июля 2002 года была официально открыта новая взлетно-посадочная полоса и перрон. По плану, Кшесины получили 32 самолета, а Ласк — оставшиеся 16. Сколько F-16 находится в Кшесинах сегодня, не сообщается.

Первые самолеты приземлились 8 ноября 2006 года после перелета через Атлантику с дозаправкой в воздухе. Президент Лех Качиньский официально принял их на следующий день, а первая леди Мария Качиньска дала самолету название «Ястреб» (Jastrząb). Первые три польских пилота завершили обучение в США в июне 2006 года: бригадный генерал Дариуш Малиновский, полковник Росцислав Степанюк и подполковник Збигнев Завада. Издание Polska Zbrojna сообщает, что к концу первого года в Польше прошли обучение 18 пилотов. Издание Głos Wielkopolski утверждает, что последние три из 48 самолетов прибыли в декабре 2008 года.

В основном пилоты пересели с МиГ-21, и изменения были масштабнее, чем просто появление новых самолетов. В журнале Lockheed Martin «Code One» описывались вылеты МиГ-21 продолжительностью от 20 до 40 минут с ограниченным набором авионики. F-16 привнес длительные миссии, дозаправку в воздухе и процедуры НАТО. 3-я эскадрилья в Кшесинах проводила собственный базовый курс F-16 для Польши, и первый выпуск состоялся в 2010 году, когда польские F-16 взяли на себя задачи быстрого реагирования. 6-я эскадрилья, передислоцированная в Кшесины из Повидза в 2006 году, прошла оценку в рамках НАТО в сентябре 2011 года. В 2008 году две эскадрильи были объединены в составе 31-й тактической авиабазы.

6-я эскадрилья — это эскадрилья «Тигр» Кшесины. Польша впервые приняла участие в учениях НАТО «Тигр» в 2011 году, в год 50-летия ассоциации. Министерство сообщает, что эскадрилья стала полноправным членом Ассоциации «Тигр» НАТО в 2014 году, завоевав звание лучшей летной эскадрильи. С тех пор она участвует в учениях и соревнованиях ассоциации, последним из которых стали учения «Тигр 2026» в Араксосе, Греция, организованные 335-й греческой эскадрильей.

В мае 2018 года, в год столетия независимости Польши, эскадрилья провела в Кшесинах «Встречу тигров» — первую в истории Польшу. С 14 по 25 мая 22 летные эскадрильи из 13 стран вывели с базы около 70 самолетов, 10 вертолетов и один самолет ДРЛО НАТО: F-16, Eurofighter, Rafale, Gripen и Tornado, а также вертолеты Gazelle, Puma и Merlin. Министерство назвало это крупнейшим мероприятием ВВС Польши в этом году, в котором приняли участие более 2000 человек.

В той же эскадрилье была создана польская демонстрационная группа F-16 Tiger Demo Team. Она была сформирована в 2015 году и впервые выступила в сентябре того же года на юбилейных торжествах базы. Греческие пилоты из команды Zeus подготовили первых польских пилотов. Команда летает на обычном фронтовом F-16C Block 52+ в тигровой раскраске. Капитан Роберт Глонзка был её первым пилотом. Мацей Краковян принял командование весной 2023 года, и источники указывают на конец апреля или май.

Выступление команды завершилось трагедией в Радоме 28 августа 2025 года. Краковян, к тому времени майор и командир команды, погиб во время репетиции перед 18-м Международным авиашоу в Радоме, и шоу было отменено. Это стало первым смертельным случаем за почти два десятилетия полетов польских F-16. Военная прокуратура и государственная комиссия по расследованию авиационных происшествий проводят расследование.

Кшесины находятся в черте города Познани, и прибытие истребителей F-16 привело базу в суд. 17 декабря 2003 года Великопольское воеводство установило зону ограниченного использования вокруг аэродрома (Постановление № 50). Владельцы недвижимости внутри этой зоны могли требовать компенсацию за снижение стоимости имущества. После начала полетов F-16 в 2006 году газета «Głos Wielkopolski» сообщила о протестах жителей, которые не хотели жить в условиях шума.

Число исков быстро росло. Юридическая фирма «Глух Велькопольски» сообщила, что владельцы воздушных судов в этой зоне требовали почти 280 миллионов злотых. К началу 2013 года около 500 дел обошлись военным примерно в 39 миллионов злотых, и еще около 200 дел находились на рассмотрении. В деле 2008 года (II CSK 367/08) Верховный суд постановил, что владельцам не нужно доказывать незаконность полетов, поскольку ответственность за эксплуатацию воздушных судов — это ответственность за риск.

Затем суды разделились. В 2008 году в закон были внесены изменения, передавшие полномочия по созданию таких зон от воевод к региональным собраниям. В 2009 и 2010 годах Верховный административный суд постановил, что постановление 2003 года утратило силу, в то время как Верховный суд и обычные суды продолжали считать его действительным. К концу 2019 года этот вопрос рассматривался Конституционным трибуналом. Глуш Велькопольский сообщил, что только около 1500 из примерно 4500 жителей, имеющих право на компенсацию, подали заявления.

Истребители F-16 Кшесины находились на дежурстве в режиме быстрого реагирования, когда Россия вторглась в Украину. Подполковник Лукаш Градзинский, командир 6-й эскадрильи, сообщил изданию Polska Zbrojna, что 24 февраля 2022 года началось спокойно, без каких-либо экстренных вылетов в течение дня. Затем около четырех часов утра прозвучала тревога, и с этого момента истребители находились в воздухе без перерыва. Последовали непрерывные воздушные патрули вдоль восточной границы.

База уже использовалась для проверки американских планов полётов с рассредоточенных аэродромов. С середины июля по середину августа 2018 года на ней проходили первые в Европе учения по развертываемой системе авиабаз ВВС США с участием личного состава ВВС США, Национальной гвардии ВВС и армии США. В апреле 2021 года истребители F-15E и F-15C 48-го истребительного крыла с авиабазы RAF Lakenheath совершили полёты в Ласк и Кшесины для участия в учениях по гибкому боевому применению.

Наиболее заметное присутствие союзников было норвежским. Четыре истребителя F-35A Королевских ВВС Норвегии из 132-го авиакрыла на базе Эрланд приземлились в Кшесинах 8–9 января 2025 года в рамках польско-норвежского соглашения от декабря 2024 года. Они выполняли задачи по интегрированной противовоздушной и противоракетной обороне НАТО, охраняя, среди прочего, транспортный узел Жешув-Ясёнка, через который в Украину поступает гуманитарная помощь. В ночь на 15 января 2025 года два из них поднялись в воздух во время российского ракетного удара по Украине. Первая ротация продолжалась до лета, а вторая, состоящая из четырех самолетов и около 100 человек личного состава, прибыла в начале октября 2025 года.

В издании Polska Zbrojna описали совместную работу норвежских F-35 и польских F-16 с одного перрона. Подполковник Михал Злох, командир 3-й эскадрильи, выразился в разговорной форме: по его словам, в совместных миссиях именно F-35 пробивает бреши в обороне. Это был предвестник будущего Польши с истребителями пятого поколения. Первая польская эскадрилья F-35 формируется в Ласке, а не в Кшесинах, и следующим шагом для Кшесинов станет модернизация до F-16V, контракт на которую был подписан в августе 2025 года на сумму около 3,8 миллиарда долларов нетто и которая должна быть завершена на авиабазе ВЗЛ-2 в Быдгоще в период с 2028 по 2038 год.