Sargodha začínala jako skromná přistávací dráha Královského letectva ve 30. letech 20. století, jedna z mnoha vybudovaných v Paňdžábu v posledních desetiletích britské nadvlády. Bylo to pákistánské letectvo, které mu dodalo na významu. Pákistánské letectvo pověřilo výstavbou základny Sargodha v roce 1959, v letech, kdy americká vojenská pomoc doplňovala vybavení o stíhačky F-86 Sabre, a stala se centrem toho, co služba nazývala letištním komplexem Sargodha: hlavní základna a satelitní letiště kolem ní.

Podle zprávy z roku 2019 v deníku ThePrint, na kterou cituje Wikipedie, se v létě 1965 v komplexu nacházelo až 80 stíhaček F-86 Sabre a pět stíhaček F-104 Starfighter, což byla velká část síly PAF v první linii. Tato koncentrace vysvětluje, proč se Indie stala prvním cílem, když se válka v září rozšířila. Dnes je základna hlavní operační základnou pod Ústředním velitelstvím letectva, kde sídlí 38. víceúčelové křídlo a letky, které Wikipedie uvádí jako 9. ‘Griffins’, 24. ‘Blinders’, 29. ‘Aggressors’ a 82. ‘Stallions’, létající typy, které zahrnují F-16, JF-17 a F-7. PAF nezveřejňuje bitevní pořadí pro jednotlivé letky a stránky Wikipedie se neshodují ve všech detailech.

Základna se nachází ve stejné čtvrti jako Kirana Hills, rezervace ministerstva obrany, kterou Wikipedie popisuje jako místo pákistánských subkritických jaderných experimentů v letech 1983 až 1995. Toto sousedství je jedním z důvodů, proč oblast přitahuje pozornost v každé indicko-pákistánské krizi.

Večer 6. září 1965 zaútočilo indické letectvo na Pathankot, Adampur a Halwaru. Indie odpověděla následující ráno. Zpráva o letecké válce na Wikipedii, která se opírá o indické historiky Jagana Mohana a Samira Chopru, uvádí, že indické letectvo 7. září provedlo 33 bojových letů proti silně bráněnému komplexu Sargodha a že indické ztráty místních letek indického letectva činily dva Mystère a tři Huntery. Jeden poškozený Mystère se utkal s F-104 a oba byly sestřeleny; jeho pilot, velitel letky Ajjamada B. Devaiah, byl zabit a v roce 1988, asi o 23 let později, poté, co byl jeho osud objasněn, byl posmrtně vyznamenán řádem Maha Vir Chakra.

Boje o Sargodhu vedly k nejznámějšímu a nejspornějšímu tvrzení války. Pákistánské zdroje připisují veliteli letky Muhammadovi Mahmoodovi Alamovi, pilotujícímu Sabre, sestřelení pěti letounů Hawker Hunter za zhruba minutu, z toho čtyř, podle jeho vlastního vyjádření, za 30 sekund. Indické letectvo vždy popíralo, že by v ten den ztratilo pět Hunterů. Wikipedie uvádí, že několik expertů tento počet zpochybnilo a že nebyly zveřejněny žádné ověřitelné záznamy z kamer. Upřímné shrnutí je, že obě letectva ztratila v ten den letadla nad Sargodhou a jejím okolí a že tato čísla zůstávají slovem jedné strany proti slovu druhé.

Tento den je stále důležitý pro obě strany. Pákistán pojmenoval v roce 2014 svou základnu v Mianwali po Alamovi a v roce 2025 indický film Sky Force zdramatizoval indické nálety na Sargodhu.

V dubnu 1958 otevřelo PAF v Masrooru pod vedením leteckého maršála Asghara Chána školu velitelů letek. Po válce v roce 1965 upadla a na začátku 70. let 20. století zanikla. Dne 5. května 1976 zřídila služba v Sargodze školu bojových velitelů, aby ji oživila a rozšířila, a ta byla slavnostně otevřena 15. srpna 1977.

Škola školí velitele letek v polovině kariéry, instruktory zbraní a kontrolory protivzdušné obrany, vyvíjí taktiku a standardizuje stíhací letky. Provozuje čtyř až pětiměsíční kurz bojových velitelů, tříměsíční kurz zbraní a čtyř až pětitýdenní integrační kurz stíhaček; do února 2023 absolvovalo 57 kurzů. Její vybavení kopíruje historii samotného PAF: na začátku Mirage III a F-6, od roku 1988 letka F-16, od roku 1993 F-7P, od roku 2015 JF-17 a od roku 2023 F-7PG. Eskadra Mirage byla vyřazena z provozu v lednu 2024.

Článek na Wikipedii uvádí, že návštěvníci letectva byli ohromeni svobodou, kterou škola dává studentským pilotům v odlišném výcviku vzdušného boje, plánování a létání vlastních misí na velmi nízké úrovni. Od roku 1992 se zde také koná cvičení Saffron Bandit, rozsáhlé cvičení, jehož cílem je co nejvíce se přiblížit válce, jak jen to dovolí doba míru.

Dne 20. února 2003 vletěl za nepříznivého počasí do vyvýšeného terénu v oblasti Kohat letoun PAF Fokker F27 s náčelníkem štábu letectva, vrchním maršálem letectva Mushafem Alim Mirem. Zahynulo sedmnáct lidí, mezi nimiž byla jeho manželka a patnáct vyšších důstojníků. Později téhož roku byla po něm přejmenována základna PAF Sargodha. Zprávy pákistánského tisku shrnuté Wikipedií v roce 2015 uváděly, že letadlo bylo identifikováno jako vadné dlouho před havárií.

Dne 1. listopadu 2007 sebevražedný atentátník na motorce zaútočil na autobus s důstojníky letectva na silnici ve Faisalabadu poblíž Sargodhy, nedaleko muničního skladu v Kirane. Televizní stanice ABC News informovala o jedenácti mrtvých, z nichž sedm bylo důstojníků PAF, a 28 zraněných; útok byl připsán ozbrojencům Tálibánu a al-Káidy.

Dne 10. května 2025, během konfliktu, který Indie nazývá operací Sindoor a Pákistán operací Bunyan-um-Marsoos, Indie uvedla, že zasáhla Mušáf přesnými zbraněmi, a satelitní snímky zveřejněné indickými a americkými médii ukázaly kráter na ranveji. Pákistánská armáda potvrdila, že v Mušáfu byl zabit jeden letec, jeden ze šesti zabitých při úderech na její základny. Pákistán nezveřejnil hodnocení škod na základně.