Аэродром был создан 7 июня 1943 года как «Спутниковый аэродром на 26-й миле», дополнительная взлетно-посадочная полоса для аэродрома Лэдд в Фэрбенксе. Его название произошло от телеграфной станции Корпуса связи армии США и километрового столба на шоссе Ричардсона, который отмечал это место. Строительство началось 25 августа 1943 года и было завершено 17 октября 1944 года. Работа длилась четырнадцать месяцев и обошлась примерно в восемь миллионов долларов. Первый самолет, использовавший его, легкий L-5, совершил посадку 11 июня 1944 года.

13 января 1948 года аэродром был переименован в авиабазу Эйелсон в честь Карла Бена Эйелсона, и база перешла в ведение Аляскинского командования ВВС. Эйелсон родился в Хаттоне, Северная Дакота, 20 июля 1897 года в семье норвежских иммигрантов. В феврале 1924 года он совершил первый в Аляске перелет авиапочтой из Фэрбенкса в Макграт менее чем за три часа по маршруту, для преодоления которого собачьим упряжкам требовалось до тридцати дней. В апреле 1928 года он и австралийский исследователь Джордж Хьюберт Уилкинс совершили перелет из Пойнт-Барроу на Шпицберген, первое пересечение Северного Ледовитого океана из Северной Америки в Европу.

Он не дожил до того момента, когда что-либо из этого было бы названо в его честь. 9 ноября 1929 года Эйелсон и его механик Эрл Борланд пропали без вести, направляясь к торговому судну «Нанук», замерзшему у сибирского побережья, чтобы доставить пассажиров и груз мехов. Ему было 32 года. Обломки корабля были найдены следующей зимой недалеко от реки Амгуэма, и данные разнятся: в «Энциклопедии Арктика» указывается дата обнаружения — январь 1930 года, в то время как другие источники указывают на обнаружение тел двух мужчин 18 февраля 1930 года. Мемориал в его честь был установлен на базе 20 июля 1957 года.

Стратегическое командование ВВС прибыло в конце 1947 года, когда 97-я бомбардировочная группа была развернута с армейской авиабазы Смоки-Хилл в Канзасе с бомбардировщиками B-29; источники указывают на ноябрь и 1 декабря 1947 года, а разница, вероятно, заключается в том, что передовой отряд противостоял основным силам. В течение следующих шестнадцати лет на авиабазе Эйлсон осуществлялась ротация крыл B-29, B-50, B-36 и B-47, которые находились в состоянии боевой готовности. Развертывания продолжались до 1963 года. 5010-я группа боевой поддержки, позже 5010-е авиакрыло, существовала главным образом для их размещения и оставалась постоянной организацией до 1981 года.

Взлетно-посадочная полоса — это то, что оставили после себя бомбардировщики. В конце 1940-х годов Стратегическое авиационное командование (SAC) удлинило эту полосу, существовавшую во время войны, примерно до 14 500 футов, что на тот момент сделало её самой длинной в Северной Америке. Собственный отдел по связям с общественностью Эйелсона теперь указывает 14 507 футов (4422 м) и называет её второй по длине взлетно-посадочной полосой на континенте; другие опубликованные данные указывают 14 530 футов (4428 м), и разница настолько мала, что зависит от начальной точки съемки. Она бетонная, односторонняя и ориентирована под углом 14/32.

Часто повторяющееся утверждение о том, что взлетно-посадочная полоса длинная, потому что она использовалась для аварийной посадки космического челнока, не выдерживает проверки: ни в одном опубликованном НАСА списке мест аварийной или трансокеанской посадки челноков не упоминается Эйлсон или какой-либо другой аэродром на Аляске. Объяснение с тяжелыми бомбардировщиками, напротив, документально подтверждено и неинтересно. Проблема заключается в поддержании полосы в надлежащем состоянии. Летом 2023 года 354-я инженерно-строительная эскадрилья закрыла взлетно-посадочную полосу на месяц для замены четырех бетонных плит во всю толщину, герметизации швов, восстановления поверхности и ремонта системы инструментальной посадки.

3 сентября 1949 года самолет WB-29 совершил плановый разведывательный полет из Мисавы (Япония) в Эйлсон, неся на борту специальные фильтры, предназначенные для улавливания радиоактивных остатков атмосферного ядерного испытания. В Эйлсоне большой счетчик Гейгера провел измерения по фильтрам и обнаружил радиоактивные следы. Это было зарегистрировано как 112-е сообщение системы обнаружения атомной энергии, и после дальнейшего анализа президент Труман 23 сентября 1949 года объявил, что Советский Союз взорвал атомное устройство. Первое доказательство существования советской бомбы было получено с фильтровальной бумаги на Аляске.

Эта работа никогда не прекращалась. Отряд 460 в Эйелсоне, подчиняющийся Центру технических приложений ВВС, отслеживает природные и техногенные сейсмические возмущения в рамках миссии по мониторингу выполнения ядерного договора. Он управляет пятью сейсмическими сетями по всей Аляске, включающими тридцать пять приборов, а также оборудованием для отбора проб атмосферы в трех других местах на Аляске. В конце 1950-х годов около 200 сотрудников AFTAC были распределены по шести отрядам на Аляске; сеть сократилась и стала гораздо более эффективной.

Авиационная часть того же предприятия включала 6-е стратегическое крыло, созданное на базе Эйлсон 25 марта 1967 года, которое до 1992 года эксплуатировало разведывательные самолеты RC-135 и самолеты-заправщики KC-135. Его самолеты RC-135S Cobra Ball были построены с использованием оптических и электронных датчиков для наблюдения за входом баллистических ракет в атмосферу, а само крыло располагалось на краю советских полигонов для испытаний. На базе Эйлсон также осуществлялись вылеты самолетов U-2 для отбора проб воздуха над полярной шапкой в рамках проекта «Звездная пыль», один из которых едва не обернулся дипломатической катастрофой в октябре 1962 года.

Учения COPE THUNDER начались на авиабазе Кларк на Филиппинах в 1976 году по инициативе бригадного генерала Ричарда Г. Хеда, чтобы дать экипажам тихоокеанских ВВС реалистичный первый опыт боевых действий. Обоснование этого решения довольно простое и до сих пор цитируется в собственных информационных бюллетенях ВВС: большинство боевых потерь происходит во время первых восьми-десяти вылетов экипажа, поэтому учения существуют для того, чтобы использовать эти вылеты в мирное время. Когда в июне 1991 года произошло извержение вулкана Пинатубо, и авиабаза Кларк была оставлена, учениям некуда было деваться.

Она отправилась на Аляску. Авиабаза COPE THUNDER была переведена на базу Эйлсон в 1992 году, выбранную из-за огромного количества тренировочного воздушного пространства над внутренними районами, и в 2006 году была переименована в RED FLAG-Alaska. 353-я боевая учебно-тренировочная эскадрилья, базирующаяся на Эйлсоне с августа 1993 года, планирует и контролирует её работу, управляя тремя полигонами для отработки навыков стрельбы на Аляске с их излучателями угроз и целеуказательными системами. Типичная группа участников прибывает на базу Эйлсон, где размещается от 700 до 1000 человек и до 60 самолетов, а ещё 500 человек и 40 самолетов находятся на объединенной базе Элмендорф-Ричардсон.

Данные о воздушном пространстве различаются в зависимости от источника и года, и эти различия стоит отметить, а не сглаживать. В информационном бюллетене Объединенного тихоокеанского полигона Аляски указано 65 000 квадратных миль воздушного пространства плюс 2490 квадратных миль суши и 42 000 квадратных морских миль над заливом Аляска; в информационном бюллетене RED FLAG-Alaska говорится о более чем 67 000; 353-я эскадрилья указывает более 68 000 в 18 районах военных операций; в пресс-релизах Эйелсона за 2025 год говорится о более чем 77 000. Какая бы цифра ни использовалась, она в несколько раз превышает площадь воздушного пространства комплекса в Неваде, расположенного за полигоном Red Flag в Неллисе.

В 2005 году в рамках программы реорганизации и закрытия баз (BRAC) авиабаза Эйлсон едва не была полностью опустошена. Министерство обороны предложило вывести самолеты и сохранить базу в качестве анклава для крупных учебных учений; Комиссия BRAC отклонила это предложение, посчитав его пустой тратой ресурсов базы. В результате был достигнут компромисс: F-16 остались, а A-10 были выведены. Подполковник Квентин Райдоут совершил свой последний вылет на A-10 31 июля 2007 года, а последние три самолета покинули базу 15 августа 2007 года, что привело к расформированию 355-й истребительной эскадрильи после четырнадцати лет службы на Эйлсоне.

24 августа 2007 года 18-я истребительная эскадрилья была преобразована в 18-ю эскадрилью агрессоров, перепрофилированную для выполнения задач противника в рамках операции RED FLAG-Alaska на истребителях F-16C/D Block 30, переданных из 80-й истребительной эскадрильи в Кунсане в начале 2008 года и окрашенных в зарубежные схемы окраски. Пять лет спустя база снова оказалась под угрозой из-за плана ВВС 2012 года перевести эту эскадрилью на объединенную базу Элмендорф-Ричардсон. Делегация Конгресса от Аляски боролась с этим планом три года, и 15 апреля 2015 года министр ВВС принял решение о том, что F-16 останутся на базе.

Отсрочка имела значение, поскольку F-35 уже был задействован. 7 августа 2014 года Эйлсон был назван предпочтительным вариантом, а 4 апреля 2016 года в решении было утверждено создание двух эскадрилий — 48 основных самолетов плюс 6 резервных, всего 54. Первые два F-35A прибыли 21 апреля 2020 года, пятьдесят четвертый — 15 апреля 2022 года, а окончательное формирование было отмечено 13 мая 2022 года после строительства стоимостью около 500 миллионов долларов. 2 февраля 2024 года эскадрилья снова сменила название, став 18-й истребительно-перехватной эскадрильей с задачами противовоздушной обороны.

Электростанция Эйелсон самоокупается и обеспечивает себя электроэнергией. Центральная теплоэлектростанция работает на угле, в период с 1952 по 1987 год в эксплуатацию были введены пять энергоблоков общей номинальной мощностью около 25 МВт, и она производит как пар, так и электроэнергию, поскольку при температуре ниже 40 градусов пар имеет большее значение. В настоящее время ВВС намерены заменить часть этой системы микрореактором: Эйелсон является предпочтительным местом для пилотного проекта Министерства ВВС, а компания Oklo, Inc. была выбрана в рамках 30-летнего соглашения с фиксированной ценой на строительство электростанции мощностью от 1 до 50 МВт, при условии получения лицензии от Комиссии по ядерному регулированию.

Холод — это постоянная величина. Зафиксированные на базе экстремальные температуры составляют −64°F в январе 1971 года и 93°F в июне 1969 года, разброс составляет 157 градусов по Фаренгейту, а годовое количество осадков составляет менее десяти дюймов, что технически делает это место пустыней. В сильный мороз над базой образуется ледяной туман, который её закрывает. С 1 апреля 2024 года ВВС утвердили поощрительные выплаты за работу в условиях низких температур на базах Аляски, где температура опускается ниже −20°F: 2000 долларов для военнослужащего без семьи и 4000 долларов для военнослужащего с иждивенцами при условии выполнения двенадцатимесячного контракта.

Экологическая репутация базы – это то, что помнит местное сообщество. Территория базы Эйелсон площадью 19 790 акров была включена в Национальный список приоритетных территорий в ноябре 1989 года из-за загрязнения нефтью, трихлорэтиленом, бензолом, толуолом, ксилолом и ПХБ в результате сброса отходов в необорудованные свалки, траншеи для осадка и зоны разливов; около 9000 человек получали питьевую воду из колодцев в радиусе трех миль. Начиная с 2015 года, тестирование химических веществ в пенообразователях для пожаротушения выявило превышение допустимых концентраций PFOA и PFOS в 150 из 152 колодцев питьевой воды в Мус-Крик (0,01–2,24 частей на миллиард), и ВВС поставляли бутилированную воду и угольные фильтры.