Авиабаза RAF Lossiemouth открылась в 1939 году на равнинной прибрежной сельскохозяйственной местности рядом с рыбацким городком Морей, давшим ей название. В истории самой авиабазы RAF первым подразделением была 15-я школа летной подготовки: она была построена для обучения пилотов, а не для ведения боевых действий. Война быстро изменила ситуацию. В той же истории упоминаются противокорабельные операции, проводившиеся с этой базы в период с 1939 по 1945 год, в том числе 9-й (бомбардировочной) и 617-й эскадрильями.

Война достигла аэродрома вечером 26 октября 1940 года. Три Heinkel He 111 атаковали на малой высоте, уничтожив по меньшей мере один Blenheim, подожгли здания и повредили ангар; один из нападавших разбился на аэродроме, вероятно, попав под собственные бомбы. Данные о жертвах разнятся: в хронологии Исторического общества Битвы за Британию указаны два убитых и двенадцать раненых, в других источниках – три погибших.

Наиболее известная связь Лоссимута с событиями войны связана с немецким линкором “Тирпиц”, стоящим в норвежских фьордах. Для атак осенью 1944 года бомбардировщики «Ланкастер» 9-й и 617-й эскадрилий летели на север, в Лоссимут, Кинлосс и Миллтаун в Морее. Операция «Обвиат» 29 октября была сорвана из-за облачности. 12 ноября, в ходе операции «Катехизм», бомбардировщики обнаружили корабль вдали от облаков; два «Таллбоя» попали в него, и «Тирпиц» перевернулся недалеко от Тромсё. Сигнал 5-й группы в Лоссимут гласил: «Работа выполнена. Корабль перевернулся».”

После войны Министерство авиации передало аэродром Адмиралтейству. В собственной истории морской авиации, «История Фулмара», говорится, что военно-морская авиабаза была введена в строй как HMS Fulmar 7 июля 1946 года, когда командир эскадрильи Э. А. Джонстон передал командование капитану Д. Макинтайру из Королевского флота. В течение следующих 26 лет Лоссимут был военно-морской авиабазой, сначала для подготовки пилотов морской авиации, а позже — базой для ударных эскадрилий передовой линии.

Военно-морской флот перестроил аэродром для реактивных самолетов. В 1952–1953 годах были расширены две из трех взлетно-посадочных полос военного времени: 23/05 с 5720 футов до 9140 футов и 29/11 с 4050 футов до 6068 футов. Затем последовали самолеты Sea Hawk, Scimitar и Sea Venom, а в марте 1961 года на смену Scimitar прибыл Blackburn Buccaneer. Лоссимут стал штаб-квартирой ВМФ по размещению самолетов Buccaneer, и в 1966 году численность базы достигла рекордной отметки в более чем 2500 человек личного состава плюс 500 гражданских лиц.

Самый известный момент в истории станции произошёл 28 марта 1967 года, когда самолётам Buccaneer из 800-й и 736-й морских авиационных эскадрилий был отдан приказ бомбить потерпевший крушение супертанкер «Торри-Каньон» у берегов Корнуолла; было зафиксировано 23 прямых попадания из 36 бомб. С 11 сентября 1967 года по 12 марта 1970 года командиром был капитан Эрик Браун. В итоге 809-я морская авиационная эскадрилья, последнее подразделение, использовавшее самолёты Buccaneer, вылетела на борт HMS Ark Royal 4 сентября 1972 года, а Королевские ВВС вернули станцию 28-29 сентября 1972 года. Источники указывают обе даты.

Первым подразделением Королевских ВВС, вернувшимся на базу, стала эскадрилья D 202-й эскадрильи, оснащенная поисково-спасательными вертолетами. В августе 1973 года 8-я эскадрилья (сегодня пишется VIII) передислоцировалась с базы Королевских ВВС Кинлосс с самолетами ДРЛО Shackleton. Это был поршневой самолет дальнего радиолокационного обнаружения, который продолжал летать до тех пор, пока в 1991 году на вооружение Королевских ВВС не поступил E-3D Sentry. Самолеты Shackleton базировались в Лоссимуте до 1 июля 1991 года, после чего были сняты с вооружения. Один из них, WR965, был потерян на острове Харрис в 1990 году со всеми десятью самолетами на борту.

Самолеты Buccaneer также вернулись, на этот раз в цветах Королевских ВВС; архивные фотографии газеты Press and Journal показывают, как в 1981 году в Лоссимуте на самолеты Buccaneer загружали бомбы. В 1991 году этот тип самолетов отправился на войну: в истории 12-й эскадрильи зафиксировано, что она использовала Buccaneer в операции «Гранби», войне в Персидском заливе. 13 марта 1991 года семьи в Лоссимуте приветствовали возвращение экипажей Buccaneer (воздушных, наземных и вспомогательных) после двухмесячного отсутствия.

«Торнадо» занял место «Буканира». В 1994 году 617-я эскадрилья была переведена на базу ВВС Лоссимут, где использовала самолеты Tornado GR1B для борьбы с надводными кораблями, и оставалась там двадцать лет. Оттуда она совершала вылеты в Персидский залив, Ирак и Афганистан, вернулась из своей последней командировки в Херрик 30 января 2014 года и была расформирована 28 февраля 2014 года. 15-я (резервная) эскадрилья обучала экипажи «Торнадо» на этой базе и потеряла два самолета и трех членов экипажа в результате столкновения над заливом Морей-Ферт в июле 2012 года.

Его будущее не было определено до 2011 года. После оборонного обзора 2010 года будущее обеих баз в Морее, Лоссимута и Кинлосса, оказалось под вопросом. 18 июля 2011 года министр обороны Лиам Фокс заявил в Палате общин, что авиабазы Тайфун, которые должны были быть созданы на базе ВВС Леучарс, “вместо этого будут созданы на базе ВВС Лоссимут”, в то время как Мархам сохранил бы самолеты Tornado GR4, а Кинлосс перешел бы в ведение армии. Депутат от Морея Ангус Робертсон поздравил “все сообщество Морея” с кампанией по сохранению обеих баз.

Истребители «Тайфун» прибыли из Файфа. 8 сентября 2014 года 1-я истребительная эскадрилья передислоцировалась с авиабазы RAF Leuchars. Министерство обороны объявило, что 1-я истребительная и 6-я эскадрильи теперь будут обеспечивать прикрытие в рамках системы быстрого реагирования на севере Великобритании, а южные подразделения быстрого реагирования будут базироваться на авиабазе RAF Coningsby. В 2015 году 2-я эскадрилья (армейского сотрудничества) перешла с авиабазы RAF Marham на истребители «Торнадо», а в 2019 году в Лоссимуте была воссоздана 9-я бомбардировочная эскадрилья, специализирующаяся на истребителях «Тайфун» и обеспечении быстрого реагирования.

Первый запуск британской системы быстрого реагирования QRA North с космодрома Лоссимут состоялся 19 сентября 2014 года, когда истребители «Тайфун» 6-й эскадрильи поднялись в воздух, чтобы встретить два российских самолета «Медведь» в международном воздушном пространстве. В ответе Министерства обороны на запрос о предоставлении информации в марте 2020 года было указано количество дней, в которые британская система QRA осуществляла запуски: 12, 12, 6, 9 и 14 в 2015–2019 годах. Российские военные самолеты участвовали в 8, 5, 3, 7 и 8 из этих дней. Министерство не разглашает точное количество запусков.

В письменном ответе парламента от 2 июля 2026 года было указано шесть дней для запуска самолетов против российских самолетов в 2025 году. Как и прежде, в нем были приведены объединенные данные по Лоссимуту и Конингсби, а не данные по отдельным базам. Например, 2 мая 2023 года истребители Typhoon из Лоссимута, дозаправлявшиеся самолетом Voyager с авиабазы RAF Brize Norton, встретили Ту-142 Bear-F рядом с норвежскими F-35A; последний зашел с северо-востока над Норвежским морем и не входил в суверенное воздушное пространство Великобритании.

На протяжении десятилетий истребители подводных лодок Королевских ВВС базировались на авиабазе Кинлосс, расположенной на побережье Морей. Самолет Nimrod MR2 был снят с вооружения в марте 2010 года, а в октябре 2010 года в рамках Стратегического обзора обороны и безопасности была отменена его замена – Nimrod MRA4. Национальное аудиторское управление установило, что проект отставал от графика на 114 месяцев и превысил первоначально утвержденную стоимость в 2,8 миллиарда фунтов стерлингов на 789 миллионов фунтов стерлингов. Планируемый флот сократился с 21 самолета до 9, а к 31 марта 2011 года было потрачено 3,4 миллиарда фунтов стерлингов.

В сентябре 2012 года Комитет по обороне сообщил, что у Великобритании в настоящее время нет и не планируется наличие самолетов для патрулирования морских территорий. В нем отмечалось, что Министерство обороны признает, что этот пробел не может быть полностью покрыт никакими другими средствами или их комбинацией, от фрегатов типа 23 до вертолетов Merlin, и что Великобритания в настоящее время полагается на союзников. Комитет был “не убежден”, что министерство сможет отреагировать на любую эскалацию, и задался вопросом, почему его устраивает ожидание до 2015 года для принятия решения. В итоге для устранения пробела было заказано девять самолетов Boeing P-8 Poseidon.

Первый самолет, «Pride of Moray», пролетел 4060 миль из Джексонвилла, штат Флорида, и приземлился в Кинлоссе 4 февраля 2020 года, положив конец, как заявили в Королевском флоте, десятилетнему перерыву. Он использовал Кинлосс, потому что взлетно-посадочные полосы Лоссимута ремонтировались в рамках программы стоимостью 75 миллионов фунтов стерлингов. 13 октября 2020 года ZP802, «City of Elgin», стал первым «Посейдоном», прибывшим в Лоссимут. Девятый и последний, ZP809, был поставлен в январе 2022 года. 120-я и 201-я эскадрильи эксплуатируют флот, в каждом экипаже есть военнослужащие Королевского флота, а 42-я (торпедоносная) эскадрилья была воссоздана в 2023 году для их подготовки.

Данные о стоимости строительных работ разнятся в зависимости от источника. Королевские ВВС оценили общую стоимость модернизации Лоссимута в 400 миллионов фунтов стерлингов, а Королевский флот — почти в 500 миллионов фунтов стерлингов. На стратегический объект «Посейдон», переименованный впоследствии в «Атлантическое здание», Королевские ВВС выделили 132 миллиона фунтов стерлингов, а Управление оборонного оборудования и поддержки — 100 миллионов фунтов стерлингов. Королевские ВВС также зафиксировали прибытие на базу 400 дополнительных человек для обеспечения полетов и технического обслуживания девяти самолетов.

Самолет E-3D Sentry, эксплуатируемый 8-й эскадрильей с базы ВВС Уоддингтон с 1991 года, был снят с вооружения в 2021 году, в результате чего Великобритания осталась без собственного самолета раннего предупреждения. Его замена, E-7 Wedgetail, использует тот же планер Boeing 737, что и Poseidon, и ВВС ожидают, что совместное использование базы принесет пользу обоим флотам. Библиотека Палаты общин сообщает, что в 2019 году было заказано пять самолетов, а после публикации оборонного документа 2021 года заказ был сокращен до трех. Комитет по обороне назвал это решение самым нелепым из всех: сокращение флота на 401 самолет TP3T при экономии средств на закупках всего на 121 самолет TP3T.

Программа также затянулась. В июле 2025 года библиотека ожидала, что самолет Wedgetail поступит на вооружение к концу 2025 года, на два года позже, чем планировалось изначально. Первый самолет, WT001, вылетел из STS Aviation Services в аэропорту Бирмингема и приземлился на авиабазе RAF Lossiemouth 21 мая 2026 года. Ему еще предстояло пройти испытания и оценку в MOD Boscombe Down и Lossiemouth, прежде чем быть официально переданным в состав RAF.

8-я эскадрилья является британским вкладом в силы раннего воздушного предупреждения НАТО. Ее летный состав и инженеры проходят обучение по соседству в 42-й (торпедоносной) эскадрилье, которая начала инженерную подготовку по программе Wedgetail в 2024 году, а подготовку летного состава — в 2025 году. В стратегическом обзоре обороны от июня 2025 года было рекомендовано закупить больше самолетов E-7, когда позволит финансирование, отметив, что совместное финансирование НАТО может компенсировать часть инфраструктурных и эксплуатационных расходов.