该机场最初规模很小。英文维基百科援引斯洛文尼亚当地媒体的报道称，南斯拉夫军方在20世纪30年代因其气候和地形而选定此地，并修建了一条草坪跑道作为辅助机场，以及木制机库。1941年4月，德国、意大利和匈牙利入侵南斯拉夫时，隶属于第七集团军的南斯拉夫皇家陆军第六空中侦察大队就驻扎于此。在入侵的第一天，该大队就损失了九架飞机，仅剩下三架布雷盖19型飞机和一架菲泽勒鹳式飞机。.

1941年秋季至1942年春季期间，德军扩建了该机场，延长了跑道并增建了三座砖砌建筑。该机场于1945年5月9日解放。1953年11月，在与意大利的的里雅斯特危机期间，南斯拉夫人民军接管了该机场并升级了跑道。到南斯拉夫解体时，第82航空旅驻扎于此，下辖第237战斗轰炸机中队（装备J-21“雅斯特雷布”）、第238战斗轰炸机中队（装备J-22“奥拉奥斯”）和第351侦察机中队（装备IJ-21和IJ-22）。.

据查阅的资料显示，切尔克列并未直接参与斯洛文尼亚上空的空战，但它的命运却折射出新国家所继承的遗产。1991年夏天，随着《布里奥尼宣言》结束十日战争，所有南斯拉夫部队撤往波斯尼亚和黑塞哥维那以及塞尔维亚，并带走了他们的装备。最后一批南斯拉夫军队于1991年10月26日离开斯洛文尼亚。.

因此，斯洛文尼亚获得了一个地理位置优越的机场，但却没有飞机可以部署。1992年6月9日成立的第15军事航空旅以布尔尼克和采尔克列为基地。2004年重组后，采尔克列保留了空军学校和空军基地，而直升机则留在布尔尼克。.

2006年12月7日，国防部长卡尔·埃尔亚韦茨与三位部长级同僚签署了一项关于重建和发展该机场的议定书，其中包括为北约飞机过境建设设施。英文维基百科指出，该计划因其对环境的影响而引起克罗地亚邻国居民的担忧。.

该部于2021年3月发布的工程概要列出了新建的控制塔、停机坪、CAT I级跑道照明、导航和气象设备、机库、技术楼、燃料储存设施、仓库和消防救援站，以及供水、供电和一条绕行道路。第一阶段耗资7250万欧元（北约4100万欧元），第二阶段耗资3320万欧元（北约3100万欧元）。约70%的工程由斯洛文尼亚承包商完成，该部向当地社区支付了超过500万欧元。既定目标是实现仪表着陆系统（ILS）运行，并可容纳4E级及以下飞机。.

切尔克列现为第15军事航空和防空旅的基地，该旅成立于2024年5月。C-27J“斯巴达”运输机“马丁·克尔潘”号于2023年12月19日抵达，国防部长马里安·沙雷茨和该旅团长亚内兹·高贝上校于次日迎接了这架飞机；由于没有足够大的机库，该机最初停放在马里博尔。第二架“斯巴达”运输机“爱德华·鲁斯扬”号于2024年12月17日抵达。.

2025年6月，该基地为第12届亚得里亚海打击演习敞开大门，约有来自30个盟国和伙伴国的800名人员参加，其中包括来自四个国家的七种直升机和来自九个国家的九种固定翼飞机。2025年11月通过的中期国防计划将切尔克列基地的进一步发展列为优先事项，该旅预计将于2026年安装新的机场系统。.