Sargodha comenzó como una modesta pista de aterrizaje de la Real Fuerza Aérea en la década de 1930, una de las muchas construidas en el Punjab durante las últimas décadas del dominio británico. Fue la Fuerza Aérea de Pakistán la que le dio importancia. La PAF inauguró la Base Aérea de Sargodha en 1959, en los años en que la ayuda militar estadounidense estaba reequipando al servicio con aviones F-86 Sabre, y se convirtió en el centro de lo que el servicio denominó el complejo del aeródromo de Sargodha: la base principal y los aeródromos satélite que la rodeaban.

Para el verano de 1965, según un artículo de ThePrint de 2019 citado por Wikipedia, el complejo albergaba hasta 80 F-86 Sabre y cinco F-104 Starfighter, una gran parte de la fuerza de primera línea de la PAF. Esta concentración explica por qué India la convirtió en el primer objetivo cuando la guerra se extendió en septiembre. Hoy en día, la base es una Base Operativa Principal bajo el Mando Aéreo Central, sede del Ala Multiusos n.° 38 y de los escuadrones que Wikipedia enumera como n.° 9 'Griffins', n.° 24 'Blinders', n.° 29 'Aggressors' y n.° 82 'Stallions', que operan aeronaves como F-16, JF-17 y F-7. La PAF no publica un orden de batalla escuadrón por escuadrón, y las páginas de Wikipedia no coinciden en todos los detalles.

La base se ubica en el mismo distrito que las colinas de Kirana, una reserva del Ministerio de Defensa que, según Wikipedia, fue escenario de experimentos nucleares subcríticos de Pakistán entre 1983 y 1995. Esta proximidad geográfica es una de las razones por las que la zona atrae la atención en cada crisis entre India y Pakistán.

En la tarde del 6 de septiembre de 1965, la PAF atacó Pathankot, Adampur y Halwara. India respondió a la mañana siguiente. El relato de Wikipedia sobre la guerra aérea, basado en los historiadores indios Jagan Mohan y Samir Chopra, afirma que la Fuerza Aérea India realizó 33 incursiones contra el complejo de Sargodha, fuertemente defendido, el 7 de septiembre, y que las pérdidas indias para los escuadrones locales de la PAF fueron dos Mystères y tres Hunters. Un Mystère dañado se enfrentó a un F-104 y ambos fueron derribados; su piloto, el comandante de escuadrón Ajjamada B. Devaiah, murió y recibió la Maha Vir Chakra a título póstumo en 1988, unos 23 años después, tras reconstruirse su destino.

Los combates sobre Sargodha dieron lugar a la reclamación más famosa y controvertida de la guerra. Fuentes pakistaníes atribuyen al comandante de escuadrón Muhammad Mahmood Alam, a bordo de un Sabre, el derribo de cinco Hawker Hunter en aproximadamente un minuto; cuatro de ellos, según su propio relato, en 30 segundos. La Fuerza Aérea India siempre ha negado haber perdido cinco Hunter ese día. Wikipedia registra que varios expertos han cuestionado el recuento y que no se ha hecho público ningún vídeo verificable grabado con cámaras de tiro. En resumen, ambas fuerzas aéreas perdieron aeronaves sobre Sargodha y sus alrededores ese día, y las cifras siguen siendo la palabra de una parte contra la de la otra.

Ese día sigue siendo importante para ambas partes. Pakistán bautizó su base en Mianwali con el nombre de Alam en 2014, y en 2025 la película india Sky Force dramatizó los ataques indios a Sargodha.

La Fuerza Aérea de Pakistán (PAF) inauguró una Escuela de Líderes de Vuelo en Masroor en abril de 1958 bajo el mando del Mariscal del Aire Asghar Khan. Tras la guerra de 1965, la escuela desapareció por completo a principios de la década de 1970. El 5 de mayo de 1976, la fuerza aérea estableció la Escuela de Comandantes de Combate en Sargodha para reactivarla y ampliar su alcance, la cual fue inaugurada formalmente el 15 de agosto de 1977.

La escuela capacita a comandantes de escuadrón con experiencia, instructores de armamento y controladores de defensa aérea, desarrolla tácticas y estandariza escuadrones de cazas. Imparte un Curso de Comandantes de Combate de cuatro a cinco meses, un Curso de Armamento de tres meses y un Curso de Integración de Cazas de cuatro a cinco semanas; para febrero de 2023, se habían graduado 57 cursos. Su equipamiento ha seguido la propia historia de la PAF: Mirage III y F-6 al principio, un escuadrón de F-16 desde 1988, F-7P desde 1993, JF-17 desde 2015 y F-7PG desde 2023. El escuadrón de Mirage fue desmantelado en enero de 2024.

El artículo de Wikipedia señala que los jefes de la fuerza aérea que han visitado la escuela se han mostrado impresionados por la libertad que esta brinda a los pilotos en formación en combate aéreo con aeronaves disímiles, permitiéndoles planificar y ejecutar sus propias misiones a muy baja altitud. Desde 1992, también lleva a cabo el ejercicio Saffron Bandit, un gran ejercicio de entrenamiento diseñado para simular una situación de guerra lo más cercana posible a la que permite la paz.

El 20 de febrero de 2003, un Fokker F27 de la Fuerza Aérea de Pakistán (PAF, por sus siglas en inglés) que transportaba al Jefe del Estado Mayor del Aire, el Mariscal del Aire Mushaf Ali Mir, se estrelló contra una zona elevada en el área de Kohat debido a las malas condiciones meteorológicas. Diecisiete personas fallecieron, entre ellas su esposa y quince oficiales superiores. La base de la PAF Sargodha fue rebautizada en su honor ese mismo año. Según informes de la prensa pakistaní, resumidos por Wikipedia en 2015, la aeronave había sido identificada como defectuosa mucho antes del accidente.

El 1 de noviembre de 2007, un atacante suicida en motocicleta atacó un autobús que transportaba oficiales de la fuerza aérea en la carretera de Faisalabad, cerca de Sargodha, próximo al depósito de municiones de Kirana. ABC News informó de once muertos, siete de ellos oficiales de la Fuerza Aérea de Pakistán, y 28 heridos; el ataque fue atribuido a militantes talibanes y de Al Qaeda.

El 10 de mayo de 2025, durante el conflicto que India denominó Operación Sindoor y Pakistán Operación Bunyan-um-Marsoos, India afirmó haber atacado Mushaf con armas de precisión. Imágenes satelitales publicadas por medios indios y estadounidenses mostraron un cráter en la pista de aterrizaje. El ejército pakistaní confirmó la muerte de un aviador en Mushaf, uno de los seis fallecidos en los ataques contra sus bases. Pakistán no ha publicado una evaluación de los daños en la base.