في أكتوبر/تشرين الأول عام 1931، قام أمريكيان، كلايد بانجبورن وهيو هيرندون الابن، بسحب طائرة بيلانكا أحادية السطح من شاطئ سابيشيرو، وهو شريط رملي يقع على بعد أميال قليلة شرق المدرج الحالي، وحلّقا بها دون توقف إلى ويناتشي، واشنطن. كانت هذه أول رحلة طيران مباشرة عبر المحيط الهادئ، وفازت بجائزة قدرها 25,000 دولار أمريكي مقدمة من صحيفة أساهي شيمبون. ويؤرخ تاريخ الجناح المقاتل الخامس والثلاثين نفسه تاريخ المغادرة إلى 4 أكتوبر/تشرين الأول 1931؛ بينما تؤرخه مؤسسة النصب التذكارية الأمريكية إلى 3 أكتوبر/تشرين الأول، لأن طرفي الرحلة كانا على جانبين متقابلين من خط التاريخ الدولي.

بدأ الطيران العسكري بعد ثماني سنوات. ففي الأول من سبتمبر عام ١٩٣٩، شرعت القوات الجوية البحرية الإمبراطورية اليابانية في حفر مدرج من الرمال نفسها، وكانت أول طائرة تهبط في ميساوا، في مارس عام ١٩٤٢، قاذفة قنابل من طراز G4M تُدعى "بيتي". صُمم المطار في الأصل لقاذفات القنابل بعيدة المدى، لكنه تحول في النهاية إلى محطة تدريب وأبحاث طيران، حيث استُخدمت بحيرة أوغاوارا المجاورة كمياه تدريب للطائرات المائية. وفي السابع من أغسطس عام ١٩٤٢، حلّقت مجموعة ميساوا الجوية بطائراتها من طراز G4M1 جنوبًا إلى رابول لمواجهة عمليات الإنزال الأمريكية في غوادالكانال، وفقدت معظمها في غضون أيام.

تُشير قيادة القوات الجوية في المحيط الهادئ بوضوح إلى أن وحدات البحرية الإمبراطورية اليابانية في ميساوا استخدمت بحيرة أوغاوارا للتدرب على الهجوم على بيرل هاربر. وبحلول سبتمبر 1944، تم تخصيص إحدى الوحدات في الميدان كفرقة تدريب لأطقم الكاميكازي، وانتقل نحو 50 طيارًا من وحدة الكاميكازي الوحيدة في ميساوا جنوبًا إلى كيوشو في يونيو 1945؛ ولم ينجُ ما يقرب من نصفهم من الحرب. وفي 8 و9 أغسطس 1945، دمرت حوالي 30 طائرة تابعة للبحرية الأمريكية 45 طائرة على الأرض، بالإضافة إلى تدمير ما يقرب من 90% من القاعدة.

وصلت القوات الأمريكية إلى أرض المعركة المدمرة في 15 سبتمبر 1945 بقيادة النقيب ديفيس ك. ستارك من مجموعة الهندسة والإنشاءات التابعة للجيش الثاني والثلاثين، وقضت أول عيد ميلاد في إعادة بنائها. أكملت اليابان نقل ملكية الأرض في 5 سبتمبر 1946. أحضرت المجموعة المقاتلة التاسعة والأربعون طائرات إف-51 موستانج في عام 1948. تناوبت ثماني منظمات مختلفة على استضافة القاعدة على مدى العقدين التاليين، ولهذا السبب يبدو تاريخ ميساوا أشبه بسباق تتابع بين قيادات أرادت كل منها الطرف الشمالي من هونشو لسبب مختلف، وليس تاريخ قاعدة واحدة.

حوّلت الحرب الكورية المكان إلى ورشة عمل. ففي 28 سبتمبر 1950، جهّزت المجموعة 49 للمقاتلات القاذفة طائراتها من طراز F-80 بخزان وقود إضافي مُكبّر، أطلقت عليه القوات الجوية اسم "خزان ميساوا"، لأن الخزان القياسي لم يكن يمنح الطائرة النفاثة في تلك الحقبة المدى الكافي للوصول إلى كوريا ومواصلة القتال عند وصولها. وفي 1 مارس 1952، شُكّلت الفرقة الجوية 39 لتتولى الدفاع الجوي عن شمال هونشو وهوكايدو، وبعد إسقاط طائرتها عام 1954، بدأت بمرافقة طائرات الاستطلاع الأمريكية التي كانت تحلق بالقرب من الأراضي السوفيتية.

كانت الأسلحة النووية جزءًا من هذا التوجه، والسجل المتعلق بها قليلٌ عمدًا. وافقت إدارة أيزنهاور على نقل المكونات غير النووية للقنابل الذرية إلى قواعد في اليابان في ديسمبر 1954؛ وبقيت هذه المكونات حتى يونيو 1965، ولا تزال الظروف الدقيقة للانسحاب سرية. وتُدرج إجراءات قيادة الشرق الأقصى التي رُفعت عنها السرية في الفترة 1956-1957 قاعدة ميساوا ضمن مواقع القواعد القادرة على إنتاج أسلحة نووية. أما النوى الانشطارية فكانت محفوظة في أماكن أخرى، مما سمح للحكومتين بالقول إنه لا يوجد سلاح نووي كامل على الأراضي اليابانية - وهو تمييز وصفه النقاد اليابانيون بأنه مجرد تفصيل لغوي.

محطة الاستماع الواقعة على المرتفع شمال خط الطيران أقدم من جناح المقاتلات، وقد تجاوز عمرها عمر معظم معداتها. كان أبرز معالمها هوائي AN/FLR-9، وهو عبارة عن مصفوفة هوائيات دائرية الشكل بنتها شركة نيشيماتسو للإنشاءات بين عامي 1963 و1965 بتكلفة تقارب 3.3 مليون دولار: ثلاث حلقات متحدة المركز من العناصر، بارتفاع 137 قدمًا، قادرة على اعتراض وتثبيت الإرسال اللاسلكي عالي التردد حتى مسافة تقارب 4000 ميل بحري. أطلق عليها السكان المحليون اسم "قفص الفيل"، ووفقًا لرواية القوات الجوية نفسها عن هدمها، اعتبروها رمزًا للحظ السعيد.

كان مركز عمليات الأمن في ميساوا هو الموقع الوحيد في غرب المحيط الهادئ الذي تعمل فيه جميع فروع القوات المسلحة الأمريكية الأربعة على حل نفس المشكلة الاستخباراتية داخل مبنى واحد: المجموعة الاستخباراتية 373، وقيادة عمليات المعلومات البحرية في ميساوا، ومفرزة الاستخبارات العسكرية 403، ومفرزة من مشاة البحرية. فعّلت البحرية مجموعتها الأمنية في ميساوا في يوليو 1971، وظلت لسنوات أطول وحدة أمريكية خدمةً بشكل متواصل في القاعدة. تم تفعيل المجموعة الاستخباراتية 373 في 7 سبتمبر 2000.

لم يكن لأي تغيير في مهمة النظام دور في إنهاء تشغيله، بل في التكنولوجيا والتمويل. بدأ هدمه في 15 أكتوبر 2013 بعد 48 عامًا من الخدمة، وتحولت عملية الهدم إلى برنامج توظيف محلي بحد ذاتها: فقد ضخت هذه العملية حوالي 4.97 مليون دولار في الاقتصاد الياباني ووفرت فرص عمل لأكثر من 250 عاملًا يابانيًا، وكان من المقرر الانتهاء منها في سبتمبر 2015. وكان النظام المماثل في أوكيناوا قد أُغلق بالفعل في عام 2007. ويوجد آخر نموذج متبقٍ من هذا النوع في قاعدة إلمندورف-ريتشاردسون المشتركة في ألاسكا.

استؤنفت حقبة الطائرات المقاتلة في قاعدة ميساوا الجوية في 2 أبريل 1985، عندما هبطت أول طائرة تدريب من طراز إف-16 بقيادة العقيد مايكل إي. رايان، الذي أصبح فيما بعد رئيس أركان القوات الجوية، مُسلِّمًا بذلك أول طائرة من هذا الطراز ستستخدمها القاعدة لأربعة عقود. تم تفعيل السرب الثالث عشر للمقاتلات التكتيكية في 1 يونيو 1985، والسرب الرابع عشر في 1 يناير 1987، وكلاهما تحت قيادة الجناح 432 للمقاتلات التكتيكية، الذي كان يُسيطر على القاعدة منذ عودة القوات الجوية الباسيفيكية إلى ميساوا عام 1978.

حلّ الجناح المقاتل 35 محل الجناح 432 في 1 أكتوبر 1994، حاملاً معه تاريخاً حافلاً بالانتصارات الجوية في الحرب العالمية الثانية وكوريا وفيتنام. واكتمل تحويل الطائرات إلى طراز F-16CJ في 17 سبتمبر 1995. وفي 18 يونيو 1996، تغير شعار الذيل من MJ إلى WW (الوارب البرية)، ويشير تاريخ الجناح إلى أن السرب المقاتل 13 أطلق أول صاروخ قتالي من طراز AGM-88 HARM من طائرة F-16CJ في 27 سبتمبر 1996، خلال العمليات فوق العراق التي أعقبت عملية ضربة الصحراء.

ثم استمرت المهمة لعقد من الزمن. حلّقت طائرات إف-16 سي جيه من قاعدة ميساوا ضمن عمليتي "المراقبة الجنوبية" و"المراقبة الشمالية" فوق العراق خلال أواخر التسعينيات، وفي 21 مارس/آذار 2003، نفّذ السرب المقاتل الرابع عشر أولى طلعاته غير الشبحية ضمن عملية "حرية العراق"، وأطلق أولى صواريخ هارم في تلك العملية. تجري التدريبات على الأسلحة في ميدان دراون، الذي يقع على بعد حوالي 12 ميلاً شمال القاعدة، والذي تسيطر عليه القوات الأمريكية منذ 6 يونيو/حزيران 1949، وأُعيد تسميته في أبريل/نيسان 2003 تكريماً للرقيب البحري ماثيو دراون، الذي فُقد عام 2001.

تصف نشرة حقائق القوات الجوية الأمريكية مطار ميساوا بأنه "المنشأة المشتركة الوحيدة بين مختلف فروع القوات المسلحة في غرب المحيط الهادئ". ويشترك في استخدام المدرج ثلاثة أطراف: الجناح المقاتل الخامس والثلاثون، والجناح الجوي الثالث التابع لقوات الدفاع الذاتي الجوية اليابانية، ومبنى ركاب مدني تديره شركة مطار ميساوا المحدودة التابعة لوزارة النقل اليابانية. بدأت الرحلات الجوية المدنية المنتظمة في 19 يناير 1953، وتوقفت في عام 1965، ثم استؤنفت في 10 مايو 1975 مع مبنى ركاب جديد أعيد بناؤه وتوسيعه في عام 1986.

الجانب المدني صغير ولكنه حقيقي - 336,869 مسافرًا و3,986 حركة طائرات في عام 2024، على خطوط جوية إلى مطارات طوكيو هانيدا وأوساكا إيتامي وسابورو أوكاداما - والترتيب ليس سلسًا. عندما هبطت قاذفة قنابل من طراز B-1B لانسر تابعة لسلاح الجو الأمريكي اضطراريًا في 29 أبريل 2025، أُغلق المطار لمدة 90 دقيقة تقريبًا، وعادت رحلة هانيدا أدراجها بعد إلغاء رحلة العودة، واحتجت كل من مدينة ميساوا ومحافظة أوموري، مشيرتين إلى أنهما طالبتا بتدابير استقرار مدني قبل أحد عشر يومًا.

خارج حدود القاعدة، يعتمد الاقتصاد على صيد الأسماك والزراعة. تُعد بحيرة أوغاوارا منطقةً غنيةً بتربية المحار، وعندما تسقط فيها أي شحنة من القاعدة، فإن الأموال المستحقة تكون يابانية: إذ يُموّل اتفاق وضع القوات وحزمة دعم الدولة المضيفة اليابانية التعويضات عبر طوكيو بدلاً من واشنطن. وبموجب اتفاقية التدابير الخاصة الموقعة في ديسمبر 2021 والممتدة لخمس سنوات ابتداءً من أبريل 2022، التزمت اليابان بتقديم حوالي 1.06 تريليون ين - أي ما يُقارب 9.33 مليار دولار - لدعم القوات الأمريكية في البلاد.

ضرب زلزال بقوة 9.0 درجات على مقياس ريختر، وقع في 11 مارس 2011، قاعدة ميساوا بعنف، مخلفًا أضرارًا طفيفة وانقطاعًا للتيار الكهربائي. أما تسونامي الذي دمر واجهة هاتشينوهي البحرية والساحل الجنوبي، فقد نجا من القاعدة نفسها. كان مركز عمليات الطوارئ في القاعدة يعمل ضمن مناورة استعداد عندما تحركت الأرض، ولذلك وردت تقارير الأضرار بسرعة. وفي غضون أيام، أصبحت ميساوا قاعدة عمليات متقدمة لقوات الإغاثة الأمريكية واليابانية، واستقبلت 14 مروحية لرحلات التوزيع.

أحدثت حالة الطوارئ النووية في محطة فوكوشيما دايتشي ما لم يفعله الزلزال. فقد سمحت وزارة الدفاع بالمغادرة الطوعية، وغادر ما بين 9000 و10000 فرد من عائلات الضحايا اليابان، منهم حوالي 7800 فرد بموجب أوامر ممولة من الجيش. وهبطت أول رحلة طيران مستأجرة تُعيد عائلات ميساوا إلى ديارها في 22 أبريل/نيسان 2011 وعلى متنها أكثر من 150 راكبًا. وعلى امتداد عملية توموداتشي، خصصت وزارة الدفاع 88.5 مليون دولار، ونحو 24000 فرد، و189 طائرة، و24 سفينة.

التغيير الجاري حاليًا هو تغيير الطائرات. أعلن البنتاغون في 3 يوليو 2024 أن أسطول طائرات إف-16 البالغ عددها 36 طائرة في قاعدة ميساوا الجوية سيُستبدل بـ 48 طائرة من طراز إف-35 إيه، وهي أول طائرات إف-35 أمريكية تتمركز بشكل دائم في منطقة المحيطين الهندي والهادئ، وثاني قاعدة جوية أمريكية من هذا النوع خارج الولايات المتحدة بعد قاعدة لاكنهيث التابعة لسلاح الجو الملكي البريطاني. انتقلت طائرات إف-16 المُطوّرة من قاعدة ميساوا إلى أوسان في كوريا الجنوبية أواخر يونيو 2025؛ وهبطت أولى طائرات إف-35 إيه في 28 مارس 2026 لصالح السرب المقاتل الثالث عشر، وكشف الجناح النقاب عن الأسطول في 24 أبريل 2026.