该基地始建于1937年末，但关于其正式启用日期，各方说法不一。两部当地航空史记载为1940年11月4日，英国皇家空军纪念飞行俱乐部则称1941年1月7日为正式启用日期，而英国皇家空军的基地网页上只写着1941年。由于各方说法不一，本文将启用日期统一为1940年11月4日至1941年1月7日。无论如何，康宁斯比基地最初是作为轰炸机司令部第5大队的基地启用的。.

第106中队于1941年2月下旬抵达，装备的是汉普顿轰炸机。该中队的首次作战行动是3月1日至2日对科隆的空袭，但开局不利：八架飞机投入使用，但只有五架升空。两天后，该基地损失了第一架飞机——汉普顿X3002号，机上四名机组人员全部遇难。第97中队随后于3月抵达，装备的是阿弗罗曼彻斯特轰炸机。这两个中队都在康宁斯比基地换装了兰开斯特轰炸机。.

盖伊·吉布森于1942年春季加入驻扎在康宁斯比的第106中队，并于4月22日驾驶兰开斯特轰炸机执行了他的首次曼彻斯特作战任务。该中队于1942年9月末至10月初（资料显示为9月30日和10月1日）前往皇家空军锡尔斯顿基地。康宁斯比基地随后于1942年9月至1943年8月期间实际上处于关闭状态，以便铺设三条硬质跑道，其中最长的跑道长1950码。.

重建后的机场于1943年8月30日接收了第617中队。9月14日至15日，该中队的兰开斯特轰炸机飞往多特蒙德-埃姆斯运河，但因天气原因被召回；大卫·马尔特比的飞机坠毁，几乎可以肯定是与一架蚊式战斗机相撞所致。第二天晚上，八架飞机再次尝试投掷12000磅炸弹，其中五架飞机被击落，包括新任指挥官乔治·霍尔顿。运河未受损。该中队于1944年1月迁至伍德霍尔温泉，从4月起，第83和第97中队作为第5大队的探路者，驻扎在科宁斯比，直至1946年。.

战后，该基地曾短暂使用过林肯飞机，1950 年 3 月之前使用过蚊式飞机，1950 年至 1953 年间使用过波音华盛顿飞机和英国皇家空军的 B-29 轰炸机，1953 年至 1961 年间使用过英国电气公司的堪培拉轰炸机。堪培拉轰炸机将喷气式轰炸带到了康宁斯比，但更持久的冷战遗产却位于围栏外，在一个名为黑洞（Black Holt）的地方。英国历史遗产委员会的记录显示，这里曾被选为英国原子武器的补充储存区之一。.

20世纪50年代初，布莱克霍尔特被改建为“蓝色多瑙河”原子弹的辅助储存区。“蓝色多瑙河”是英国第一枚投入使用的原子弹，长7.3米，重4吨。原子弹被储存在钢筋混凝土堆砌的建筑物内，裂变弹芯则单独存放。之后，英国又研制了其他类型的原子弹，直至“黄太阳”Mark 1型。英国历史遗产委员会统计，该基地共有24个储存舱，并与驻扎在康宁斯比的三个中队（共八架V型轰炸机）的核弹储存设施相关联。.

这些中队装备的是1962年交付的火神轰炸机。英国皇家空军博物馆关于火神XM598的记录显示，它于1963年9月4日交付给驻扎在康宁斯比的第12中队。1964年3月1日，第9、12和35中队合并为一个康宁斯比联队，并于1964年11月7日迁至科茨莫尔皇家空军基地，康宁斯比短暂的V型轰炸机部队时代就此结束。.

黑洞试验场比轰炸机存在的时间更长。20世纪80年代，随着重要机场加强核生化防御，其一座土丘状的试验建筑被改建为安全指挥所。该试验场于20世纪90年代关闭并转为私人所有。2020年2月24日，英国历史遗产委员会将其原试验建筑列为二级保护建筑。而康宁斯比皇家空军基地本身则一直保持开放。.

康宁斯比空军基地装备了麦克唐纳·道格拉斯“鬼怪”FGR2战斗机。1968年8月，第228作战转换部队在此成立，成为首个装备“鬼怪”战斗机的部队；随后，第6中队于1969年5月成立，第54中队于1969年9月成立，第41中队于1972年4月成立。康宁斯比的“鬼怪”战斗机最初执行对地攻击任务，在“美洲虎”战斗机接管对地攻击任务后，转而执行防空任务。.

“鬼怪”战斗机服役时期给该基地带来了和平时期最惨重的损失。1974年8月9日，由基地指挥官大卫·布吕克上校驾驶的第41中队“鬼怪”战斗机在诺福克上空与一架喷洒农药的飞机相撞，导致布吕克上校、他的领航员特伦斯·柯克兰中尉以及来自波尼的飞行员保罗·希克莫特（24岁）丧生。事故调查人员将事故归咎于缺乏协调军用和民用低空飞行的系统。.

据英国空军历史分部记载，防空型“旋风”战斗机于1984年以过渡型F2投入使用，首批“旋风”F3型战斗机于1986年7月抵达康宁斯比空军基地。当月，第229作战转换部队开始在那里训练F3型战斗机的机组人员，而作为首个作战型F3中队的第29中队于1987年4月在康宁斯比空军基地正式接收了该型战斗机。到1990年，共有五个中队装备了F3型战斗机，全部驻扎在英国。.

1990年8月伊拉克入侵科威特时，第5和第29中队的机组人员正在塞浦路斯进行武器训练，随即被派往达兰。空军历史分部统计，截至8月11日，达兰已有12架F-3战斗机，到9月22日则有18架。在“格兰比行动”期间，这支由多个基地抽调的F-3分遣队共执行了2666架次飞行任务，其中698架次是“沙漠风暴”行动期间的作战飞行任务。.

康宁斯比是第一个在前线使用’台风”战斗机的英国皇家空军基地。2003年重组的第29中队是第二个接收该型战机的英国皇家空军中队，而最早的“台风”部队于2005年从位于沃顿的BAE系统公司机场迁至康宁斯比。第3（战斗机）中队于2006年抵达，成为第一个在前线作战的“台风”中队，而第11（战斗机）中队则于2007年组建为一支多用途的“台风”中队。.

2007年6月29日，台风战斗机正式投入使用，第3（战斗机）中队从“旋风”F3战斗机手中接管了科宁斯比基地的快速反应警戒任务；当时已有43架台风战斗机交付该基地。科宁斯比基地负责该任务的南半部分，洛西茅斯皇家空军基地负责北半部分。2012年，英国皇家空军表示，其飞行员每月要值守一到两次24小时快速反应警戒轮班。.

英国国防部不公布确切的发射数据。2020年，国防部仅公布了英国快速反应警戒（QRA）飞机在两个基地合计发射的天数：2015年至2019年分别为12天、12天、6天、9天和14天。有些发射在地面上都能听到：2021年1月12日，康宁斯比基地的台风战斗机以超音速飞行，支援一架失去通讯的民用飞机，其轰鸣声传遍了伦敦和东部各郡。.

如今，英国皇家空军将第3战斗机中队和第11战斗机中队列为一线作战部队，第29中队负责训练台风战斗机飞行员。第12中队于2018年7月重组，成为英国皇家空军和卡塔尔埃米尔空军联合组建的台风战斗机中队，并于2020年在科宁斯比空军基地开始联合作战。第11战斗机中队因在台风战斗机首次作战中取得的“利比亚2011”战功而荣获该项荣誉。.

该飞行队于1957年7月11日在英国皇家空军比金山基地成立，最初名为英国皇家空军历史飞机飞行队，后更名为不列颠之战飞行队，并于1969年正式更名为现名。1959年至1965年间，该飞行队仅有一架喷火式战斗机（PM631）和一架飓风式战斗机（LF363），这两架飞机至今仍在服役。该飞行队于1976年3月1日从英国皇家空军科尔蒂肖尔基地迁至康宁斯比基地，并于2026年庆祝了该基地成立50周年。.

英国皇家空军列出的机队包括五架喷火战斗机、飓风战斗机LF363和PZ865、兰开斯特轰炸机PA474、达科他运输机ZA947以及两架花栗鼠运输机WG486和WK518。该飞行组织指出，目前世界上仅存12架可飞行的飓风战斗机和2架可飞行的兰开斯特轰炸机。其机库通过游客中心向公众开放，该中心近期与林肯郡议会合作进行了翻新。2018年，为庆祝英国皇家空军百年诞辰，该机库还展出了英国皇家空军博物馆的霍克台风战斗机MN235，这是该型号飞机唯一幸存的机型。.

1991年9月11日，飓风战斗机LF363与兰开斯特轰炸机和喷火战斗机编队从科宁斯比飞往泽西岛途中，凸轮轴发生故障。飞机在进近威特灵皇家空军基地时发动机熄火，坠毁在机场跑道上；飞行员仅脚踝骨折和轻微烧伤。飞机的修复工作耗时数年，飞行队不得不出售喷火战斗机PS853以支付部分费用。LF363于1998年9月29日再次飞行。.

英国皇家空军飞行队（BBMF）仅有一起致命事故。2024年5月25日，一架1944年制造的喷火式MK356战斗机在康宁斯比附近坠毁，造成43岁的中队长马克·朗遇难。据FlightGlobal报道，这是自1957年以来BBMF飞机发生的首起致命事故。事故发生后，该飞行队停飞。2025年3月，英国皇家空军在事故调查期间允许其喷火式和飓风式战斗机恢复飞行。.

现在负责测试“台风”战斗机战术的中队有着悠久的作战历史。该中队前身是英国皇家飞行队的第41中队，于1916年组建并派往法国。它曾驾驶“喷火”战斗机参与敦刻尔克大撤退和不列颠空战，当时英国皇家空军在不列颠空战中战绩最高的飞行员埃里克·洛克就曾在此服役。1944年，该中队在短短九周内摧毁了53枚V-1飞弹。.

该中队与康宁斯比的首次联系始于1972年4月1日，当时它在那里重新组建，装备的是F-4“鬼怪”FGR2战斗机。1974年8月，该中队指挥官驾驶的正是这架“鬼怪”战斗机，在诺福克上空发生了一起致命的碰撞事故。1977年，该中队换装了“美洲虎”战斗机，结束了在康宁斯比使用“鬼怪”战斗机的五年历史。它的座右铭是“搜寻并摧毁”。.

2006年，由于面临解散一线部队的命运，该部队改编为第41（预备役）中队，即快速喷气式战斗机和武器作战评估部队。2013年，该部队更名为第41（预备役）测试与评估中队，并接收了首架台风战斗机。如今，该部队更名为第41测试与评估中队，隶属于位于瓦丁顿皇家空军基地的空天作战中心。英国皇家空军称，该部队的主要任务是台风战斗机的性能和战术发展。.