Základna Anápolis byla postavena pro protivzdušnou obranu Brasílie, která se stala hlavním městem v roce 1960. Anglická a portugalská Wikipedie, čerpající z historie samotné základny, datuje zahájení výstavby na 9. února 1970 a zahájení provozu na 23. srpna 1972. Byla to první brazilská základna postavená pro nadzvukové stíhačky a nachází se na náhorní plošině vysoké více než 1100 metrů s hlavní ranvejí dlouhou 3300 metrů.

Stíhačky byly francouzské. Brazílie koupila 16 jednomístných Mirage IIIEBR a čtyři dvoumístné IIIDBR, dodávané od roku 1972 a označené jako F-103E a F-103D. Nejprve s nimi létalo 1. křídlo protivzdušné obrany, 1ª ALADA, které bylo 19. dubna 1979 vyřazeno a nahrazeno 1. skupinou protivzdušné obrany, 1º GDA, přezdívané Jaguar. V roce 1984 přibyly dva bývalé francouzské letouny, aby se nahradily nehody, a po roce 1989 flotila obdržela protiletadlové letouny typu Canards a novější avioniku.

Mirage III zůstaly ve výzbroji až do roku 2005. Byly nahrazeny 12 použitými Mirage 2000 z Francie, které letectvo vyřadilo v prosinci 2013, tedy ve stejném měsíci, kdy si vláda vybrala Gripeny. Mezi Mirage 2000 a Gripeny létaly Jaguary s modernizovanými F-5EM; do roku 2022 zbýval v letce pouze jeden F-5M.

Brazílie podepsala v říjnu 2014 smlouvu na 36 stíhaček Gripen E/F a Anápolis měl být jejich domovem navždy. V červenci 2022, jak uvádí titulky Poder Aéreo, došlo k otevření nové budovy pro 1. skupinu protivzdušné obrany a dodání podpůrného a výcvikového vybavení Gripenů. Do listopadu 2023 dokončilo ve Švédsku konverzi čtrnáct operačních pilotů, uvádí Diário Oficial, jak informoval Poder Aéreo, a všichni sloužili u 1. GDA.

Skutečným milníkem nastal 24. února 2026, kdy Gripeny zahájily pohotovost protivzdušné obrany pro Planalto Central z Anápolisu. Společnost Poder Aéreo na základně napočítala deset letadel a zaznamenala, co se předtím dělo: certifikaci pro doplňování paliva ve vzduchu za KC-390, ostrou střelu dlouhého doletu Meteor a první střelbu z děla na brazilském území. Návrh rozpočtu na rok 2027, zveřejněný v září 2026, počítal s 12 dodanými Gripeny.

V polovině roku 2026 se šest stíhaček F-39E z letky Jaguar poprvé vydalo do zahraničí na mezinárodní cvičení Salitre v chilské poušti Atacama po boku Argentiny, Chile, Kolumbie, Spojených států a Paraguaye. Domů se vrátily 12. července 2026, přičemž let z Antofagasty do Anápolisu, vzdálený přibližně 2 382 km, trval dvě hodiny a padesát minut.

V Anápolisu se nacházejí také letadla s nejdál dohledem. Eskadra Guardião, 2. letka 6. letecké skupiny, zde působí od roku 2000 s palubním varovným letounem E-99 a letounem dálkového průzkumu Země R-99, oba postavené společností Embraer na draku letounu EMB 145. Portugalská Wikipedie uvádí, že se k nim v roce 2017 připojily letouny Learjet průzkumné letky Carcará.

Dne 4. září 2019 dodala společnost Embraer v Anápolisu první letoun KC-390 Millennium 1. skupině pro přepravu vojsk. Letectvo mělo tehdy objednáno 28 kusů; objednávka byla od té doby snížena na 19. Cisternová přepravní souprava doplnila palivo do Gripenů na základně a později byly dodávky odeslány do Galeão v Rio de Janeiru.

Základna má i civilní roli v nouzových situacích. V únoru 2020 si ji vláda vybrala k umístění do karantény 25 Brazilců a čtyř čínských příbuzných, kteří byli přivezeni domů z Wu-chanu dvěma letouny Embraer VC-2, na dobu 14 až 21 dnů.

Anápolis byl také dlouho zastávkou na cestě sem. Když byly v březnu 1975 z Palmdale přepraveny první tři stíhačky F-5B, vzpomíná Poder Aéreo, zastavily se v Belému a Anápolisu, než 12. března přistály v Galeão. V roce 2006 se na základně konalo třetí mnohonárodní cvičení CRUZEX, kterého se podle anglické Wikipedie zúčastnily Brazílie, Francie, Venezuela a Argentina; každé další cvičení směřovalo do Natalu. Základna otevírá své brány veřejnosti během dnů otevřených dveří, přičemž poslední byl ohlášen na 13. září 2026 s Gripeny, KC-390 a eskadrou Smoke Squadron.