بدأ أربعة طيارين من الكتيبة 854 لهندسة الطيران مسح هضبة الحجر الجيري في باتي بوينت في 13 نوفمبر 1944، بعد أربعة أشهر من استعادة القوات الأمريكية لغوام. وكانت الكتيبة، بقيادة العقيد هربرت إي. براون الابن، قد وصلت إلى الجزيرة في 9 أكتوبر قادمة من كواجالين. وقد تم حصر أعمالها في نورث فيلد لاحقًا بالكميات الفعلية: إزالة 847 فدانًا من الأدغال، ونقل 1,231,700 ياردة مكعبة من التربة، ووضع 828,000 ياردة مربعة من الخرسانة الإسفلتية، وبناء 181 كوخًا من نوع كونسيت، و902 مبنى خشبي.

وُضِعَت أول طبقة من الإسفلت في 17 يناير 1945، وأُعلن عن جاهزية المطار للعمليات في 3 فبراير، عندما هبطت طائرة من طراز C-87 تابعة للجناح 314 للقصف، وتبعها اللواء كورتيس ليماي على متن طائرة من طراز F-13A. تم تسوية شريطين متوازيين بطول 10,500 قدم وعرض 500 قدم، ثم رُصِفَا بطول 8,500 قدم وعرض 200 قدم مع مسارات إضافية بطول 1,000 قدم. المدرج الشمالي هو المدرج الحالي 06L/24R، والمدرج الجنوبي هو 06R/24L.

أحضرت السرب 314 أربع مجموعات من قاذفات بي-29 - المجموعات 19 و29 و39 و330 - وقصفت طوكيو لأول مرة في 25 فبراير 1945. وفي 12 أبريل، ألقى الرقيب أول هنري إي. إروين قنبلة فوسفورية مشتعلة من طائرته بيديه العاريتين، وحصل على وسام الشرف الوحيد الذي مُنح لعمليات بي-29. وفي 7 أكتوبر 1949، أُعيد تسمية القاعدة تكريمًا للعميد جيمس روي أندرسن، الذي فُقد مع الفريق ميلارد إف. هارمون في طلعة جوية فوق المحيط الهادئ في فبراير 1945.

في 18 يونيو 1965، انطلقت قاذفات بي-52 إف ستراتوفورتريس التابعة للجناحين السابع والثلاثمئتين للقصف من قاعدة أندرسن الجوية باتجاه قاعدة تابعة للفيت كونغ شمال سايغون، في أول مهمة من مشروع "آرك لايت". وتختلف الروايات حول عملية الإطلاق: إذ تشير شعبة الدعم التاريخي التابعة للقوات الجوية إلى مشاركة 27 طائرة، بينما تشير ملخصات أخرى للقوات الجوية إلى مشاركة 30 طائرة. اصطدمت اثنتان من القاذفات في سحابة على بعد حوالي 250 ميلاً من الشاطئ أثناء تحليقهما في مدار حول حاملات التزود بالوقود. وقُتل ثمانية من أفراد الطاقم قبل سقوط أي قنبلة.

أصبحت عملية "آرك لايت" أطول حملة قصف في تاريخ القوات الجوية، حيث نُفذت أكثر من 126 ألف طلعة جوية بين يونيو 1965 وأغسطس 1973، انطلاقاً من قاعدة أندرسن الجوية، وقاعدة يو تاباو في تايلاند، وقاعدة كادينا لفترة من الزمن. ارتفع معدل الطلعات الشهرية من حوالي 800 طلعة في منتصف عام 1967 إلى 1800 طلعة بحلول فبراير 1968، حين ألقت القاذفات ما يقارب 60 ألف طن من القنابل حول قاعدة مشاة البحرية في خي سان. نُفذت آخر مهمة من مهام "آرك لايت" في 15 أغسطس 1973.

امتلأت ساحة المطار خلال عملية "رصاصة" التي بدأت في فبراير 1972 مع استئناف قصف الشمال. أُرسل أكثر من 15,000 رجل إلى قاعدة أندرسن في مهمة مؤقتة خلال تسعين يومًا؛ ونفدت الثكنات، فسكنت الأطقم في خيام، وعملت ثمانين ساعة أسبوعيًا. وكانت النتيجة أكبر تجمع للقاذفات في أي مكان منذ عام 1945، حيث تراوحت الإحصاءات المنشورة في أندرسن بين 152 و155 طائرة من طراز B-52 متوقفة على امتداد حوالي خمسة أميال من المدرج.

استمرت مناورات لاينباكر الثانية من 18 إلى 29 ديسمبر 1972، مع توقفها في يوم عيد الميلاد. نفذت قاذفات بي-52 ما مجموعه 729 طلعة جوية فعالة من أصل 741 طلعة مُرسلة، وألقت حوالي 15,000 طن على منطقتي هانوي وهايفونغ، مستهدفةً 26 موقعًا لصواريخ إس إيه-2 ونحو 1,240 صاروخ أرض-جو. أطلق أندرسن 87 قاذفة في الليلة الافتتاحية. وتتراوح التقديرات لقوة القوات في غوام بين 152 و155 طائرة، مقابل 54 قاذفة بي-52 دي في يو-تاباو.

كانت الليلة الثالثة هي الأسوأ: ست من أصل 99 قاذفة أُرسلت لم تعد. استقر سلاح الجو الأمريكي في نهاية المطاف على إسقاط 15 قاذفة من طراز B-52، عشر منها سقطت في شمال فيتنام، وخمس وصلت إلى لاوس أو تايلاند أولاً، بينما تعرضت تسع قاذفات أخرى لأضرار بالغة في قاعدة يو تاباو الجوية حالت دون عودتها للطيران. هذا العدد محل خلاف. فقد أقرت تصريحات أمريكية مبكرة بإسقاط 16 قاذفة، بينما أُبلغت الصحافة بـ 17، ثم الكونغرس لاحقًا بـ 13، في حين أشار تحليل أجراه درينكوفسكي وغراو عام 2007 إلى أن العدد الإجمالي الحقيقي يتراوح بين 22 و27 قاذفة.

من بين طاقم الطائرة المفقودة البالغ عددهم 92 فرداً، تم استعادة 26، وأُسر 33، بينما قُتل 33 أو لم يُعثر عليهم، ويُصنفون عادةً إلى 25 مفقوداً و8 قتلى. وشملت الطائرات الأخرى التي فُقدت خلال الأيام الأحد عشر طائرتين من طراز F-111A، وثلاث طائرات من طراز F-4، وطائرتين من طراز A-7، وطائرتين من طراز A-6، وطائرة من طراز EB-66، وطائرة من طراز RA-5C، ومروحية من طراز HH-53. وُقّعت اتفاقيات باريس للسلام في 27 يناير 1973، وعاد 591 أسير حرب أمريكي إلى ديارهم في غضون ستين يوماً.

استمرت عملية "الحياة الجديدة" من 23 أبريل إلى 1 نوفمبر 1975، وجعلت من غوام نقطة استقبال لنزوح فيتنام الجنوبية. وكان نحو 2600 يتيم وطفل، نُقلوا جواً ضمن عملية "بابي ليفت"، قد عبروا الجزيرة بالفعل يومي 3 و4 أبريل. ويشير تقرير الجيش بعد العملية إلى أن عدد الفيتناميين الذين تم إيواؤهم ومعالجتهم في غوام بلغ 111,919، بينما يقول مكتب الشؤون العامة التابع لأندرسن إن العدد تجاوز 100,000، منهم أكثر من 39,000 تم إيواؤهم في القاعدة الجوية.

كانت طائرات النقل العسكرية من طراز C-141 ستارليفترز وC-130 هيركوليز تُفرغ حمولتها على مدرج قاعدة أندرسن على مدار الساعة. وتحولت مساكن العمال الفولاذية التي شُيدت عام 1966 إلى مخيم أطلق عليه الجميع اسم "مدينة الصفيح"، على أرض تشغلها الآن الحقول المحيطة بنادي "توب أوف ذا روك"؛ ولم يتبق منها سوى درج حجري. وكان يتم استقبال جميع اللاجئين تقريبًا المتجهين إلى البر الرئيسي الأمريكي عبر هذه القاعدة.

لم يكن أكبر مخيم في القاعدة الجوية. فقد نصب جنود البحرية خيامًا لخمسين ألف شخص في أوروت بوينت بقاعدة غوام البحرية، حيث بلغ عدد السكان ذروته عند 39,331 شخصًا. وبلغ عدد اللاجئين في الجزيرة ذروته عند 50,450 شخصًا في 13 مايو 1975، وأُغلقت المخيمات في 23 أكتوبر. لم يرحل الجميع: فقد أبحر 1,546 فيتناميًا من غوام في 16 أكتوبر على متن السفينة التجارية ثونغ تين 1، مطالبين بالعودة إلى فيتنام. وسُجن قبطانها لمدة اثني عشر عامًا.

تقع قاعدة أندرسن الجوية على هضبة ترتفع حوالي 600 قدم فوق سطح البحر، في واحدة من أكثر المناطق المائية عرضة للأعاصير على وجه الأرض. اجتاح الإعصار كارين غوام في 11 نوفمبر 1962. وسجل مقياس سرعة الرياح التابع للبحرية على تل نيميتز هبة رياح بلغت سرعتها 150 ميلاً في الساعة، وتراوحت التقديرات لما بعد العاصفة في جنوب الجزيرة بين 174 و183 ميلاً في الساعة. لقي أحد عشر شخصًا حتفهم، وتضررت أو دُمرت 95% من منازل غوام، وأصبحت مدارج مطار أندرسن غير صالحة للاستخدام.

وصل إعصار باكا في 16 ديسمبر 1997. وسجل مقياس سرعة الرياح ذو السلك الساخن في أندرسن هبة رياح بلغت سرعتها 205 عقدة، أي ما يعادل 236 ميلاً في الساعة، وهو ما كان سيُسجل رقماً قياسياً عالمياً؛ إلا أن تقييم هيئة الأرصاد الجوية الوطنية يُشير بوضوح إلى أن هذه القراءة لا تدعمها التحليلات اللاحقة. لم يُقتل أحد في غوام أو روتا، وتجاوزت الأضرار 600 مليون دولار. تبع ذلك إعصار بونغسونا الفائق في 8 ديسمبر 2002، حيث ظل الطرف الشمالي من الجزيرة داخل عين الإعصار لمدة ساعتين تقريباً.

كلّف إعصار بونغسونا أكثر من 700 مليون دولار، وأصاب 193 شخصًا وفقًا لإحصاءات وزارة الصحة في غوام، وتسبب في وفاة شخص واحد بشكل غير مباشر، وهي امرأة أصيبت بجروح من الزجاج المتطاير، ما أدى إلى إصابتها بنوبة قلبية قاتلة عندما لم تتمكن فرق الإنقاذ من الوصول إليها. تعطل رادار دوبلر في قاعدة أندرسن الجوية عند انقطاع التيار الكهربائي، ولم تتمكن المولدات الاحتياطية من توفير الطاقة. ضرب إعصار ماوار المنطقة كإعصار من الفئة الرابعة في 24 مايو 2023؛ وتم إجلاء الطائرات جوًا أو وضعها في حظائر الطائرات، ولم يُقتل أحد، وعاد المطار للعمل في غضون 48 ساعة.

كانت الأرض التي يشغلها أندرسن أرضًا تابعة لشعب تشامورو. بعد استعادة غوام في 21 يوليو 1944، استولى الجيش على حوالي 52,000 فدان من الأراضي المملوكة ملكية خاصة، وتجاوزت الحيازات في نهاية المطاف 85,000 فدان، أي ما يعادل 63% من مساحة الجزيرة. حُسبت التعويضات بناءً على قيم الأراضي لعام 1941، وطُبقت على عمليات الاستيلاء التي جرت عام 1948، دون أي تعديل لمراعاة التضخم. تشير موسوعة غوامبيديا إلى شراء 25 فدانًا مقابل 850 دولارًا، بعد أن كانت قد بيعت مقابل 750 دولارًا عام 1928.

استعادت بعض الأراضي. فقد نصّ قانون غوام للأراضي الفائضة لعام 1994 على توجيه إدارة الخدمات العامة بتسليم الممتلكات الفيدرالية غير المستخدمة إلى غوام مجانًا، وتم تسليم خمس عشرة وثيقة ملكية تغطي أكثر من 2767 فدانًا بحلول عام 2011. وتقوم لجنة أراضي الأجداد في غوام، التي أُنشئت عام 1999، بنقل ملكية الأراضي إلى أصحابها الأصليين أو ورثتهم. ولا تزال وزارة الدفاع تمتلك ما يقارب ربع مساحة الجزيرة، أي حوالي 36000 فدان، منها 14600 فدان مخصصة لأندرسن.

لم يكتمل التجهيز بعد. قاعدة مشاة البحرية كامب بلاز، التي تم افتتاحها في 1 أكتوبر 2020 وسُميت تيمناً بالعميد فيسنتي توماس جاريدو بلاز، هي أول قاعدة جديدة لمشاة البحرية منذ عام 1952؛ حيث ينتقل حوالي 5000 جندي من مشاة البحرية من أوكيناوا بتكلفة تقارب 8.7 مليار دولار، تدفع اليابان منها حوالي 3.1 مليار دولار. كما ستستضيف قاعدة أندرسن جزءاً من منظومة غوام الدفاعية، التي تضم 16 موقعاً في أغسطس 2024، على أن يتم تشغيل أول عنصر منها في السنة المالية 2027 وآخرها في عام 2032.