ארבעה אנשי צוות מגדוד ההנדסה ה-854 החלו לסקור את רמת אבן הגיר בפטי פוינט ב-13 בנובמבר 1944, ארבעה חודשים לאחר שהכוחות האמריקאים כבשו מחדש את גואם. הגדוד, בפיקודו של קולונל הרברט א. בראון ג'וניור, הגיע לאי ב-9 באוקטובר מקוואג'ליין. עבודתו בשדה הצפוני נספרה לאחר מכן בכמויות גולמיות: 847 דונם של ג'ונגל נוקו, 1,231,700 יארד מעוקב של אדמה הוזזה, 828,000 יארד רבועים של בטון אספלט הונח, 181 בקתות קוונסט ו-902 מבני שלד הוקמו.

האספלט הראשון הונח ב-17 בינואר 1945 והשדה הוכרז פעיל ב-3 בפברואר, כאשר מטוס C-87 של כנף ההפצצה ה-314 נחת ומייג'ור גנרל קרטיס למיי הלך בעקבותיו ב-F-13A. שני רצועות מקבילות סוללו באורך 10,500 רגל על 500 רגל ונסללו באורך 8,500 על 200 רגל עם מסלולים מרוחקים של 1,000 רגל. הצפוני הוא מסלול ההמראה של היום 06L/24R; הדרומי הוא 06R/24L.

הרגימנט ה-314 הביא ארבע קבוצות של מטוסי B-29 - ה-19, ה-29, ה-39 וה-330 - והפציץ את טוקיו בפעם הראשונה ב-25 בפברואר 1945. ב-12 באפריל, סמל ראשון הנרי א. ארווין השליך פצצת זרחן בוערת ממטוסו בידיים חשופות וזכה במדליית הכבוד היחידה המוענקת עבור פעולות B-29. ב-7 באוקטובר 1949 שונה שמו של הבסיס על שם בריגדיר גנרל ג'יימס רוי אנדרסן, שאבד עם לוטננט גנרל מילארד פ. הרמון בטיסה באוקיינוס השקט בפברואר 1945.

ב-18 ביוני 1965, מטוסי B-52F סטרטופורטרס של כנפי ההפצצה ה-7 וה-320 טסו מאנדרסן לעבר אזור בסיס של הווייטקונג מצפון לסייגון, משימת Arc Light הראשונה. דיווחים על השיגור שונים: חטיבת התמיכה ההיסטורית של חיל האוויר אומרת ש-27 מטוסים היו במטוס, בעוד שסיכומים אחרים של חיל האוויר אומרים ש-30. שניים מהמפציצים התנגשו בענן כ-400 קילומטרים מהחוף בזמן שהקיפו סביב מכליות. שמונה אנשי צוות נהרגו לפני שפצצה אחת נפלה.

"ארק לייט" הפך למסע ההפצצה הארוך ביותר בתולדות חיל האוויר, עם יותר מ-126,000 גיחות בין יוני 1965 לאוגוסט 1973 שבוצעו מאנדרסן, או-טפאו בתאילנד ולמשך תקופה מסוימת מקדנה. הקצב החודשי טיפס מכ-800 באמצע 1967 ל-1,800 בפברואר 1968, כאשר המפציצים הציבו כ-60,000 טון סביב בסיס הנחתים בקה סאן. משימת "ארק לייט" האחרונה בוצעה ב-15 באוגוסט 1973.

הרמפה התמלאה במהלך מבצע "יריית כדור", שהחל בפברואר 1972 כאשר הפצצות הצפון חודשו. יותר מ-15,000 איש נשלחו לאנדרסן לתפקיד זמני תוך תשעים יום; הצריפים אזלו והצוותים גרו באוהלים, ועבדו שמונים שעות בשבוע. התוצאה הייתה הריכוז הגדול ביותר של מפציצים בכל מקום מאז 1945, כאשר ספירות שפורסמו באנדרסן נעו בין 152 ל-155 מטוסי B-52 שחנו לאורך כ-8 קילומטרים של מדרכה.

מטוס הליינבקר II פעל בין ה-18 ל-29 בדצמבר 1972, עם הפסקת פעילות ביום חג המולד. מטוסי B-52 ביצעו 729 גיחות יעילות מתוך 741 שנשלחו והטילו כ-15,000 טון על אזורי האנוי והייפונג, כנגד 26 אתרי SA-2 וכ-1,240 טילי קרקע-אוויר. אנדרסן שיגרה 87 מפציצים בליל הפתיחה. הכוח בגואם נספר בין 152 ל-155 מטוסים, כנגד 54 מטוסי B-52D ב-U-Tapao.

הלילה השלישי היה הגרוע ביותר: שישה מתוך 99 מפציצים שנשלחו לא חזרו. חיל האוויר הסתפק בסופו של דבר ב-15 מפציצים שהופלו, עשרה נפלו בצפון וייטנאם וחמישה הגיעו ללאוס או תאילנד תחילה, כאשר תשעה נוספים ניזוקו קשות מדי באו-טפאו מכדי שיוכלו לטוס שוב. המספר שנוי במחלוקת. הצהרות אמריקאיות מוקדמות הודו ב-16, לעיתונות נאמר 17 ולקונגרס מאוחר יותר 13, וניתוח משנת 2007 של דרנקובסקי וגראו טען כי המספר האמיתי נע בין 22 ל-27.

מתוך 92 אנשי הצוות שהיו על סיפון המטוס האבוד, 26 חולצו, 33 הפכו לשבויי מלחמה ו-33 נהרגו או לא נמצאו מעולם, כאשר המספרים מחולקים בדרך כלל כ-25 נעדרים ושמונה הרוגים. מטוסים אחרים שאבדו במהלך אחד עשר הימים כללו שני מטוסי F-111A, שלושה מטוסי F-4, שני מטוסי A-7, שני מטוסי A-6, EB-66, RA-5C ו-HH-53. הסכמי השלום של פריז נחתמו ב-27 בינואר 1973 ו-591 אסירים אמריקאים חזרו הביתה תוך שישים יום.

מבצע "חיים חדשים" נמשך בין ה-23 באפריל ל-1 בנובמבר 1975 והפך את גואם לנקודת קליטה ליציאת דרום וייטנאם. כ-2,600 יתומים וילדים שהוטסו במסגרת מבצע "בייבי ליפט" כבר עברו דרך האי ב-3 וב-4 באפריל. דו"ח הצבא לאחר המבצע מעריך את מספר הווייטנאמים ששוכנו וטופלו בגואם ב-111,919; משרד יחסי הציבור של אנדרסן עצמו אומר שיותר מ-100,000, מתוכם יותר מ-39,000 שוכנו בבסיס חיל האוויר.

מטוסי C-141 סטארליפטר ו-C-130 הרקולס פרקו את המטוסים על הרמפה של אנדרסן מסביב לשעון. מעונות פלדה שהוקמו ב-1966 הפכו למחנה שכולם קוראים לו "עיר הפח", על שטח שכיום נמצא על ידי השדות סביב מועדון "טופ אוף דה רוק"; גרם מדרגות אבן הוא בערך כל מה ששרד ממנו. כמעט כל פליט שהיה בדרכו ליבשת אמריקה טופל דרך הבסיס.

המחנה הגדול ביותר לא היה בבסיס חיל האוויר. "Seabees" הקימו אוהלים ל-50,000 איש באורוטה פוינט בבסיס חיל הים גואם, שם התפוסה הגיעה לשיאה ועמדה על 39,331. אוכלוסיית הפליטים באי הגיעה לשיאה ועמדה על 50,450 ב-13 במאי 1975 והמחנות נסגרו ב-23 באוקטובר. לא כולם המשיכו: 1,546 וייטנאמים הפליגו מגואם ב-16 באוקטובר על סיפון אוניית הסוחר ת'ונג טין 1, לאחר שדרשו להחזירם לווייטנאם. הקפטן שלה נכלא למשך שתים עשרה שנים.

אנדרסן ניצבת על רמה בגובה של כ-180 מטרים מעל פני הים, באחד מרצועות המים המועדות ביותר לטייפון על פני כדור הארץ. הסופר טייפון קארן חצה את גואם ב-11 בנובמבר 1962. מד הרוח של חיל הים בגבעת נימיץ מדד משב של 240 קמ"ש, וההערכות לאחר הסופה בדרום האי הגיעו ל-174 עד 183. אחד עשר בני אדם נהרגו, 95 אחוזים מבתי גואם ניזוקו או נהרסו, ומסלולי ההמראה באנדרסן נותרו בלתי שמישים.

פאקה הגיע ב-16 בדצמבר 1997. מד רוח באנדרסן תיעד משב של 205 קשר, כ-236 מייל לשעה, שהיה אמור להיות שיא עולם; הערכת השירות המטאורולוגי הלאומי קובעת במפורש שהקריאה אינה נתמכת על ידי ניתוח שלאחר מכן. איש לא נהרג בגואם או ברוטה והנזק עלה על 600 מיליון דולר. טייפון-על פונגסונה הגיע לאחר מכן ב-8 בדצמבר 2002, כאשר הקצה הצפוני של האי היה בתוך העין במשך כמעט שעתיים.

טייפון פונגסונה עלה יותר מ-700 מיליון דולר, פצעה 193 בני אדם לפי ספירת משרד הבריאות של גואם והרג אדם אחד בעקיפין - אישה שנחתכה מזכוכית מעופפת שסבלה מהתקף לב קטלני כאשר עזרה לא הצליחה להגיע אליה. מכ"ם הדופלר באנדרסן כשל כאשר החשמל נקטע וגנרטורים לגיבוי לא נשאו אותו. טייפון מאוואר פגע כקטגוריה 4 ב-24 במאי 2023; מטוסים הוטסו או הוצבו בהאנגר, איש לא נהרג, ושדה התעופה חזר לפעילות תוך 48 שעות.

השטח בו תפס אנדרסן היה אדמה צ'מורו. לאחר כיבוש גואם מחדש ב-21 ביולי 1944, הצבא תפס כ-52,000 דונם של אדמה בבעלות פרטית, ובסופו של דבר עברו את ה-85,000 דונם, כ-63% מהאי. הפיצוי חושב על סמך ערכי הקרקע משנת 1941 שהוחלו על רכישות שבוצעו בשנת 1948, ללא התאמה לאינפלציה. גואמפדיה מתעדת 25 דונם שנרכשו תמורת 850 דולר, ולאחר מכן החליפו ידיים תמורת 750 דולר בשנת 1928.

חלק מהשטח חזר. חוק עודפי האדמות של גואם משנת 1994 הורה למינהל השירותים הכלליים להעביר לגואם רכוש פדרלי מיותר ללא עלות, וחמישה עשר שטרי חוק המשתרעים על פני יותר מ-2,767 דונם נמסרו עד 2011. ועדת אדמות האבות של גואם, שנוסדה בשנת 1999, מעבירה את הקרקע לבעלים המקוריים או ליורשיהם. משרד ההגנה עדיין מחזיק כרבע מהאי, כ-36,000 דונם, שעליהם חלקו של אנדרסן הוא 14,600 דונם.

הבנייה טרם הסתיימה. בסיס חיל הנחתים בלייז, מחנה בלייז, שהופעל ב-1 באוקטובר 2020 ונקרא על שם בריגדיר גנרל ויסנטה תומאס גארידו בלייז, הוא בסיס חיל הנחתים החדש הראשון מאז 1952; כ-5,000 חיילי נחתים עוברים מאוקינאווה בעלות של קרוב ל-8.7 מיליארד דולר, מתוכם יפן משלמת כ-3.1 מיליארד. אנדרסן תארח גם חלק ממערכת ההגנה של גואם, שנספרה ב-16 אתרים באוגוסט 2024, כאשר האלמנט הראשון צפוי להיות בשנת הכספים 2027 והאחרון ב-2032.