Bagram byl postaven se sovětskou pomocí v 50. letech 20. století, kdy se Afghánistán za premiéra Daúda obrátil na Moskvu se žádostí o zbraně. Anglická Wikipedie uvádí, že prezident Eisenhower zde v roce 1959 přistál a byl přivítán králem Záhirem Šáhem a samotným Daúdem – což připomíná, že po několik let se obě supervelmoci dvořily Kábulu. V 70. letech 20. století se na letišti nacházel 322. pluk MiG-21 a sovětsky vycvičený důstojnický sbor.

Tento důstojnický sbor uskutečnil saurskou revoluci. Dne 27. dubna 1978 se podle Wikipedie plukovník Abdul Qadir "vrtulníkem přesunul na leteckou základnu v Bagramu", ujal se tam velení a "organizoval letecké údery na královský palác", zatímco tanky útočily v Kábulu. Důstojníci, kteří se na letišti bránili, byli zabiti. Daoud zemřel té noci v Argu. Počet obětí je sporný: Anthony Hyman uvádí 30 důstojníků zabitých jen v Bagramu, zatímco Mohammad Nabi Azimi napsal, že celkem mohlo zemřít jen asi 40 lidí; jiné odhady jsou mnohem vyšší.

Po sovětské intervenci v prosinci 1979 se Bagram stal jedním z hlavních center Omezeného kontingentu. Wikipedie uvádí 108. motostřeleckou divizi a 345. gardový výsadkový pluk na základně nebo v jejím okolí a 368. útočný letecký pluk se Su-25 od října 1986 do listopadu 1987. Afghánské jednotky zůstaly po boku: 322. stíhací letecký pluk a 321. letecký pluk, přičemž v roce 1990 v Bagramu stále byly tři letky MiGů-21.

Role základny v afghánské politice neskončila stažením Sovětů v únoru 1989. Během neúspěšného puče 6. a 7. března 1990 zaútočili piloti loajální ministrovi obrany Šahnavázovi Tanaiovi na Kábul; tři rakety dopadly poblíž Prezidentského paláce. Odpoledne 7. března Tanai dorazil do Bagramu a vrtulníkem uprchl do Péšávaru v Pákistánu. V následující občanské válce, jak uvádí Wikipedie, držely Severní aliance a Taliban od roku 1999 každý jeden konec základny, zatímco Taliban byl na dostřel dělostřelectva a minometů druhé strany.

Začátkem prosince 2001 zajistila letiště britská speciální lodní služba a následovala ji americká 10. horská divize. Do poloviny června 2002 se na základně nacházelo více než 7 000 amerických a spojeneckých příslušníků a do roku 2009 mohla základna pojmout asi 10 000 lidí. Agentura pro historický výzkum letectva (Air Force Historical Research Agency) uvádí, že 455. letecké expediční křídlo v Bagramu létalo od 26. července 2002 v různých časech na protiteroristických misích s letouny A-10, F-16, F-15E, C-130 a MC-12; anglická Wikipedie dodává z roku 2003 EA-6B a z roku 2014 MQ-9.

Bagram byl také místem zadržení. Zařízení Parwan, dokončené v listopadu 2009 s kapacitou pro přibližně 3 000 lidí, bylo v roce 2012 předáno pod afghánskou kontrolu. Základna byla opakovaně napadena: sebevražedný atentátník zabil u brány 23 lidí během návštěvy viceprezidenta Cheneyho v únoru 2007 a další v listopadu 2016 zabil nejméně čtyři Američany. V dubnu 2013 se při vzletu zřítil nákladní Boeing 747, při kterém zahynulo všech sedm členů posádky.

Americké síly opustily Bagram v noci z 1. na 2. července 2021. Její nový afghánský velitel, generál Mir Asadullah Kohistini, řekl televizi Al Jazeera, že se jeho jednotky o tom dozvěděly až ráno a že rabovači před jejich vyhnáním vyplenili kasárna. Dne 15. srpna 2021, když se Islámská republika zhroutila, afghánské jednotky ustoupily a Tálibán základnu obsadil a osvobodil tam držené vězně.

Bagram se poté stal symbolem. V srpnu 2024 si Tálibán připomněl třetí výročí svého vítězství na tomto místě. V září 2025 prezident Trump prohlásil, že se Spojené státy snaží základnu získat zpět, s odkazem na její vzdálenost od čínských jaderných zařízení; mluvčí Tálibánu Zabihulláh Mudžahid odpověděl, že Afghánci nikdy nikomu svou půdu nedají, a 7. října 2025 schůzka regionálních mocností v moskevském formátu označila zahraniční vojenskou infrastrukturu v Afghánistánu za nepřijatelnou. Dne 1. března 2026, během afghánsko-pákistánské války, pákistánští představitelé uvedli, že na letišti zničili letadla; představitelé Tálibánu uvedli, že nevznikla žádná škoda. Satelitní snímky, o kterých informoval The New York Times, ukázaly zničený hangár a dva sklady.