Historie letectví v Čitose začíná jediným letem v roce 1926, sponzorovaným hokkaidskými novinami, uvádí anglická Wikipedie. Japonské císařské námořnictvo převzalo letiště v roce 1939 a využívalo ho po celou dobu války v Tichomoří. Americké síly jej obsadily v roce 1945; v zimě 1945–1946 odtud létala 3. letecká komandová skupina a od února 1946 do dubna 1948 49. stíhací skupina.

Korejská válka a studená válka udělaly z Čitose základnu v frontové linii. 6163. letecké křídlo bylo aktivováno v roce 1951, kdy společnost Japan Airlines zahájila pravidelné lety na toto pole, a v září 1954 dorazila 4. stíhací skupina USAF s letouny F-86 Sabre. Byla deaktivována 1. července 1957 a základna se 31. prosince 1957 vrátila pod japonskou kontrolu.

Oficiální historie JASDF zaznamenává, že 2. letecké křídlo zahájilo pohotovostní službu s F-86F 28. dubna 1958 a že v témže roce služba poprvé vzlétla. Čitose zůstalo společným civilně-vojenským letištěm až do roku 1988, kdy se letecký provoz přesunul na sousední nové letiště Čitose.

2. letecké křídlo bylo první, které převzalo F-104J. 201. peruť byla zformována v Čitose v březnu 1963 a 203. 25. června 1964, přičemž 203. převzala pohotovost od F-86D Sabre ze 103. perutě. 1. října 1974 byla 201. peruť rozpuštěna a její místo zaujaly F-4EJ nové 302. perutě.

Éra F-15 začala 24. března 1984, kdy se 203. peruť přestavěla na letoun Eagle vyrobený společností Mitsubishi; 302. se v listopadu 1985 přesunula do Nahy a 19. března 1986 byla 201. peruť přeformována na F-15. Její emblém hnědého medvěda pochází z medvědů z Hokkaida. Obě perutě od té doby létají na letounech F-15 z Čitose a obě se podle anglické Wikipedie objevily ve filmu Nejlepší kluk z roku 1990.

Schéma jejich práce se změnilo. Společný štáb napočítal ve fiskálním roce 2025 165 vzletů a pádů Severních sil protivzdušné obrany, což představuje asi 28 procent z celkového počtu v zemi, a v období duben–červn 2026 pouze 20, oproti 106 na jihozápadě.

Dne 6. září 1976 vzlétl poručík Viktor Belenko ze sovětských sil protivzdušné obrany z Čugujevky v Přímořském kraji v letounu MiG-25 do Hakodate v jižním Hokkaidu. Podle údajů z japonské Wikipedie, které tato služba použila, ho pozemní radar JASDF ztratil při klesání do velmi nízké hladiny a dva letouny F-4EJ 302. perutě, které vzlétly z Čitose kolem 13:20, ho nedokázaly v pozemním ruchu zachytit. Přistál kolem 13:50.

Podle anglické Wikipedie byl MiG-25 25. září přepraven americkým letounem C-5 Galaxy z Hakodate do Hjakuri, prozkoumán a 15. listopadu 1976 v 30 bednách odeslán zpět z přístavu Hitači. Belenko odjel do Spojených států.

Pro Čitoseho byla ponaučením mezera v nízkoúrovňovém radarovém krytí, kterou vlastní radar Fantomů nedokázal uzavřít. JASDF reagovala nákupem letounů včasné výstrahy E-2C Hawkeye, které podle Wikipedie vstoupily do služby v Misawě v lednu 1987.

Čitose je také domovem vládních letadel. Skupina pro speciální leteckou přepravu, složená z velitelství, 701. perutě a údržbářské perutě, přepravuje premiéra, císařskou rodinu a státní hosty; letadla pilotují a posádky zajišťuje personál JASDF.

První dva Boeingy 747-400 byly dodány na podzim roku 1991 a podle anglické Wikipedie poprvé přepravily do Spojených států premiéra Kiičiho Mijazawu v roce 1993. Nahradily je dva Boeingy 777-300ER, které dorazily do Čitose 17. srpna a 11. prosince 2018 a do služby vstoupily v dubnu 2019. Skupina ohlásila svůj 400. misi 9. srpna 2024.