San Antonio de los Baños nebylo postaveno pro Kubu. Wikipedie s odkazem na Agenturu pro historický výzkum amerického letectva uvádí, že výstavba byla dokončena v roce 1942, že americké síly poprvé využily letiště 29. srpna 1942 a že letadla amerického armádního letectva dorazila 16. října 1942. Německé ponorky tehdy potápěly lodě v Karibiku a letiště létalo jako protiponorkové hlídky; později během války se zde cvičily posádky bombardérů B-29 Superfortress, jejichž dlouhé ranveje vysvětlují dnešní velikost základny.

Američané odešli 30. dubna 1946 a letiště přešlo pod kubánskou vládu. Za Fulgencia Batisty, který se v roce 1952 ujal moci převratem, neslo jeho jméno: Wikipedie jej v letech 1953 až 1959 uvádí jako Batistovu leteckou základnu. Když režim 1. ledna 1959 padl, zdědila jej revoluční vláda spolu se zbytkem letectva.

Dva dny před vyloděním v Zátoce sviní vzlétlo z Nikaraguy osm bombardérů B-26 kubánských exulantů s označením FAR, aby zničily Castrovo letectvo na zemi. San Antonio de los Baños byl jedním ze tří cílů, Ciudad Libertad v Havaně a Antonio Maceo v Santiagu. Wikipedie uvádí, že nájezdníkům připisují zničení tří bombardérů FAR B-26, jednoho Sea Fury a jednoho T-33 v San Antoniu.

To nestačilo. Knihovna Johna F. Kennedyho shrnuje, že bombardéry "minuly mnoho svých cílů a většinu Castrova letectva nechaly nedotčenou", a jakmile se ukázalo, že přelakované letouny jsou podporovány Amerikou, prezident Kennedy zrušil druhý útok. Přeživší Sea Fury, B-26 a T-33 – T-33 byly jediné kubánské tryskáče – útočily na vyloďovací flotilu od 17. dubna, potopily Rio Escondido a poškodily Houston. Brigáda se 19. dubna vzdala.

Sovětská odpověď přišla v dřevěných bednách. Rafael Lima v článku pro Air & Space popisuje jejich přílet do San Antonia v červnu 1961 s MiGy-15 a MiGy-19 uvnitř. LAAHS uvádí podrobnosti: 20 stíhaček MiG-15 a čtyři cvičné letouny dorazily koncem května, montáž začala 6. června 1961 a Enrique Carreras, veterán ze Zátoky sviní, provedl první let kubánského pilota 24. června. V listopadu 1961 následovalo osm MiGů-19, které zde byly v prosinci smontovány; kubánští piloti je shledali "nestabilními, složitými a problematickými" a do roku 1966 byly vyřazeny.

V roce 1962 Moskva vyslala celý pluk. Základní článek Wikipedie uvádí, že 32. gardový stíhací letecký pluk zde nasadil své MiGy-21F-13, které sloužily na Kubě jako 213. pluk; LAAHS jej eviduje jako 231. pluk a Lima umisťuje MiGy-21 do Santa Clary. Během říjnové krize bylo San Antonio velitelstvím kubánského revolučního letectva. 26. října, podle Limova vyprávění, Rafael del Pino vyslal do San Antonia, Santa Clary a Holguínu kódovaný rozkaz: "Střílejte na Indiány". Kubánští piloti bez radaru během krize vzlétli do vzduchu pouze jednou. Sovětský pluk zanechal svá letadla na Kubě a v roce 1963 se vrátil domů.

Základna zůstala centrem kubánského stíhacího letectva i během studené války. LAAHS zaznamenává, že v září 1978 dorazilo 45 stíhacích bombardérů MiG-23BN a dva cvičné letouny MiG-23UB, které byly rozmístěny v San Antoniu. Anglická Wikipedie zde uvádí stíhací pluky Západní letecké zóny a popisuje dnešní základnu jako domov stíhaček MiG-29 a MiG-23; kubánská vláda nezveřejňuje jejich bitevní rozkaz.

Je nejisté, co základna ještě dokáže vynést do vzduchu. Společnost FlightGlobal napočítala v roce 2022 v provozu pět kubánských MiGů-29; její adresář z roku 2026, který vynechává letadla, která nejsou v každodenním provozu, neuvádí vůbec žádné kubánské stíhačky. Tabulka inventáře anglické Wikipedie označuje všechny MiGy-29, MiG-23 a MiG-21 jako neoperabilní. Beton položený pro B-29 v roce 1942 nyní čeká na letadla, která země s nedostatkem paliva nemůže létat.

Nejznámější činy flotily byly spíše politické než vojenské. Mezi kubánské MiGy-29, které anglická Wikipedie umisťuje na tuto základnu, patří MiG-29UB, který 24. února 1996 sestřelil dva Cessny 337 z organizace Brothers to the Rescue a zabil čtyři muže; vyšetřování ICAO zjistilo, že letadla byla zničena v mezinárodním vzdušném prostoru, zatímco Kuba uvedla, že opakovaně narušila její vzdušný prostor a byla varována. MiG-23BN, typ, který sem dorazil v roce 1978, byl také letadlem, ve kterém major Orestes Lorenzo Pérez 20. března 1991 přeběhl na Key West; základna, ze které vzlétl, není v pramenech uvedena.