لم تُبنَ قاعدة سان أنطونيو دي لوس بانوس لصالح كوبا. تشير ويكيبيديا، بالاستناد إلى وكالة البحوث التاريخية التابعة لسلاح الجو الأمريكي، إلى أن البناء اكتمل عام ١٩٤٢، وأن القوات الأمريكية استخدمت القاعدة لأول مرة في ٢٩ أغسطس ١٩٤٢، وأن طائرات سلاح الجو التابع للجيش الأمريكي وصلت في ١٦ أكتوبر ١٩٤٢. في ذلك الوقت، كانت الغواصات الألمانية تُغرق السفن في منطقة البحر الكاريبي، وكانت القاعدة تُستخدم لتسيير دوريات مضادة للغواصات؛ وفي وقت لاحق من الحرب، درّبت أطقم قاذفات بي-٢٩ سوبر فورترس، التي تُفسّر مدارجها الطويلة حجم القاعدة الحالي.

غادر الأمريكيون في 30 أبريل 1946، وانتقلت القاعدة إلى الحكومة الكوبية. في عهد فولغينسيو باتيستا، الذي استولى على السلطة بانقلاب عام 1952، حملت القاعدة اسمه: يذكر موقع ويكيبيديا أنها كانت تُعرف باسم قاعدة باتيستا الجوية من عام 1953 إلى عام 1959. وعندما سقط النظام في 1 يناير 1959، ورثتها الحكومة الثورية مع بقية القوات الجوية.

قبل يومين من إنزال خليج الخنازير، انطلقت ثماني قاذفات من طراز B-26 يقودها منفيون كوبيون من نيكاراغوا، تحمل علامات القوات الجوية الكوبية، لتدمير سلاح الجو التابع لكاسترو على الأرض. وكانت سان أنطونيو دي لوس بانوس إحدى الأهداف الثلاثة، إلى جانب سيوداد ليبرتاد في هافانا وأنطونيو ماسيو في سانتياغو. وتشير ويكيبيديا إلى أن المهاجمين دمروا ثلاث قاذفات من طراز B-26 تحمل علامات القوات الجوية الكوبية، وطائرة سي فيوري واحدة، ودبابة تي-33 واحدة في سان أنطونيو.

لم يكن ذلك كافيًا. يُلخص تقرير مكتبة جون إف. كينيدي أن القاذفات "أخطأت العديد من أهدافها وتركت معظم سلاح الجو التابع لكاسترو سليمًا"، وبمجرد انكشاف الطائرات المُعاد طلاؤها على أنها مدعومة من الولايات المتحدة، ألغى الرئيس كينيدي الضربة الثانية. هاجمت طائرات سي فيوري وبي-26 وتي-33 المتبقية - وكانت طائرات تي-33 هي الطائرات النفاثة الوحيدة لدى كوبا - أسطول الإنزال بدءًا من 17 أبريل، وأغرقت السفينة ريو إسكنديدو وألحقت أضرارًا بالسفينة هيوستن. استسلم اللواء في 19 أبريل.

جاء الرد السوفيتي في صناديق خشبية. يصف رافائيل ليما، في مقال له في مجلة "الجو والفضاء"، وصولها إلى سان أنطونيو في يونيو 1961، حاملةً طائرات ميغ-15 وميغ-19. وتقدم جمعية تاريخ الطيران في لوس أنجلوس (LAAHS) التفاصيل: وصلت 20 طائرة مقاتلة من طراز ميغ-15 وأربع طائرات تدريب في نهاية مايو، وبدأ التجميع في 6 يونيو 1961، وقام إنريكي كاريراس، أحد قدامى المحاربين في خليج الخنازير، بأول رحلة تجريبية لطيار كوبي في 24 يونيو. تبع ذلك وصول ثماني طائرات ميغ-19 في نوفمبر 1961، وتم تجميعها هنا في ديسمبر؛ إلا أن الطيارين الكوبيين وجدوها "غير مستقرة ومعقدة ومثيرة للمشاكل"، فتم الاستغناء عنها بحلول عام 1966.

في عام ١٩٦٢، أرسلت موسكو فوجًا كاملًا. تشير المقالة الأساسية في ويكيبيديا إلى أن فوج الطيران المقاتل الثاني والثلاثين للحرس نشر طائراته من طراز ميغ-٢١ إف-١٣ هنا، وخدم في كوبا تحت رقم الفوج ٢١٣؛ بينما يرقمه سجل تاريخ الطيران في ليما (LAAHS) بالفوج ٢٣١، ويضع ليما طائرات ميغ-٢١ في سانتا كلارا بدلًا من ذلك. خلال أزمة أكتوبر، كانت سان أنطونيو مقرًا للقوات الجوية الثورية الكوبية. في ٢٦ أكتوبر، وبحسب رواية ليما، أرسل رافائيل ديل بينو أمرًا مشفرًا إلى سان أنطونيو وسانتا كلارا وهولغين: "أطلقوا النار على الهنود". لم يقم الطيارون الكوبيون، الذين لم يكن لديهم رادار، بالتحرك إلا مرة واحدة خلال الأزمة. ترك الفوج السوفيتي طائراته في كوبا وعاد إلى الوطن في عام ١٩٦٣.

ظلت القاعدة مركزًا للطيران المقاتل الكوبي طوال فترة الحرب الباردة. وتشير سجلات جمعية لوس أنجلوس التاريخية للطيران (LAAHS) إلى وصول 45 طائرة مقاتلة قاذفة من طراز ميغ-23BN وطائرتين تدريبيتين من طراز ميغ-23UB في سبتمبر 1978، وتمركزت في سان أنطونيو. ويذكر موقع ويكيبيديا الإنجليزية أفواج المقاتلات التابعة للمنطقة الجوية الغربية في هذه القاعدة، ويصفها بأنها اليوم موطن لمقاتلات ميغ-29 وميغ-23؛ إلا أن الحكومة الكوبية لا تنشر هيكلها القتالي.

ما الذي يمكن للقاعدة أن تُشغّله جوًا بعد الآن أمرٌ مشكوك فيه. أحصى موقع فلايت غلوبال خمس طائرات كوبية من طراز ميغ-29 عاملة في عام 2022؛ أما دليله لعام 2026، الذي يستثني الطائرات غير المستخدمة يوميًا، فلا يُدرج أي مقاتلة كوبية على الإطلاق. ويُشير جدول جرد ويكيبيديا الإنجليزية إلى أن جميع طائرات ميغ-29 وميغ-23 وميغ-21 غير عاملة. أما الخرسانة التي وُضعت لطائرات بي-29 في عام 1942، فهي الآن تنتظر طائرات لا تستطيع دولة تعاني من نقص الوقود تشغيلها.

كانت أبرز أعمال الأسطول ذات طابع سياسي لا عسكري. ومن بين طائرات ميغ-29 الكوبية، التي تشير إليها ويكيبيديا الإنجليزية في هذه القاعدة، طائرة ميغ-29UB التي أسقطت طائرتين من طراز سيسنا 337 تابعتين لمنظمة "الإخوة للإنقاذ" في 24 فبراير 1996، ما أسفر عن مقتل أربعة رجال. وقد خلص تحقيق منظمة الطيران المدني الدولي (إيكاو) إلى أن الطائرتين دُمرتا في المجال الجوي الدولي، بينما زعمت كوبا أنهما انتهكتا مجالها الجوي مرارًا وتكرارًا وتلقتا تحذيرات. كما كانت طائرة ميغ-23BN، وهي الطائرة التي وصلت إلى هنا عام 1978، هي نفسها التي انشق بها الرائد أوريستيس لورينزو بيريز إلى كي ويست في 20 مارس 1991؛ ولم تُذكر القاعدة التي أقلع منها في المصادر.