Rota, İspanya'nın Amerika Birleşik Devletleri ile Soğuk Savaş döneminde yaptığı anlaşmanın bir sonucudur. Eylül 1953'te Madrid'de imzalanan anlaşmalar (Wikipedia ve çoğu kaynak 23 Eylül, GlobalSecurity ise 26 Eylül tarihini veriyor), Amerikalılara ekonomik ve askeri yardım karşılığında İspanyol askeri tesislerini geliştirme ve kullanma hakkı tanıdı. Metinde, ortak kullanılan alanların "her zaman İspanyol bayrağı ve komutası altında kalacağı" vurgulandı ve Rota o zamandan beri bu şekilde yönetiliyor: içinde bir Amerikan deniz üssü bulunan bir İspanyol deniz üssü.

ABD Donanması'nın kendi profiline göre Rota Deniz Üssü 1953'te kurulmuş ve inşaatına 1955'te başlanmıştır. İspanyolca Vikipedi, arazinin Rota ve El Puerto de Santa María kıyıları boyunca kamulaştırılmış olduğunu ve toplamda yaklaşık 2.400 hektar olduğunu belirtirken, ABD Donanması da yaklaşık 6.100 dönümden bahsetmektedir. Üssün komutanı bir İspanyol amiraldir (İspanyolca Vikipedi'ye göre tümamiral, GlobalSecurity'ye göre koramiral) ve kapıları İspanyol kuvvetleri korumaktadır.

Armada için bu üs, yeniden yapılanma fırsatıydı. İspanyol deniz havacılığı 1939'da yeni hava kuvvetlerine katılmış ve ancak 1954'te Vigo'ya üç Bell 47 helikopterinin indirilmesiyle yeniden faaliyete geçmişti. Armada'nın tarihçesine göre, helikopter grubu 1957'de o zamanlar hala inşaat halinde olan Rota'ya taşındı ve o zamandan beri de oradan ayrılmadı.

Rota, bir gemi sayesinde jet üssü haline geldi. Amerika Birleşik Devletleri, 1967'de İspanya'ya hafif uçak gemisi USS Cabot'u ödünç verdi ve Dédalo adıyla ilk olarak helikopter gemisi olarak kullanıldı. 8 Kasım 1972'de ahşap güvertesine bir Harrier indi ve İspanya, İngiltere ile ilişkiler doğrudan satın almayı zorlaştırdığı için bu uçağı ABD Donanması aracılığıyla sipariş etti. Aralık 1976'da, Armada kayıtlarına göre, Dédalo, İspanya'nın Matador adını verdiği ilk yedi AV-8A Harrier ile Rota'ya yanaştı; Wikipedia, 1976 yılında altı tek kişilik ve iki çift kişilik uçağın teslim edildiğini belirtiyor. O zamandan itibaren Hava Filosu, helikopter hizmetinin yanı sıra sabit kanatlı bir hizmet de oldu.

İkinci nesil 1987'de geldi: İspanya'nın ilk ihracat müşterisi olduğu AV-8B Harrier II. İspanyol Hava Kuvvetleri (Aeronaves Militares Españolas) hizmete girişini Ağustos 1987'ye, ilk uçağın gelişini ise 6 Ekim'e tarihlendiriyor. 1996 ve 1997 yıllarında, CASA (Armada'ya göre Sevilla'da) tarafından monte edilen sekiz yeni AV-8B Plus uçağı 9. Filo'ya katıldı ve eski uçaklar aynı standartta yeniden inşa edildi. Matadorlar Tayland'a satıldı.

Bugün 9. Filo, filonun hangarlarının en batısında yer alan 9 numaralı hangarda konuşlanmış durumda. Armada'nın kayıtlarında 12 adet AV-8B Plus ve bir adet TAV-8B bulunurken; Wikipedia ve Aeronaves Militares Españolas'ın kayıtlarında on artı bir adet olduğu belirtiliyor. Filo, 50.000'den fazla uçuş saati ve 100'den fazla personele sahip. Rota'da konuşlanmış olan Juan Carlos I gemisiyle denize açılıyor ve sipariş edilmiş bir halefi yok: F-35B'nin Ağustos 2025'te rafa kaldırıldığı bildirildi ve Aeronaves Militares Españolas, Mayıs 2026'da Savunma Bakanı'nın Harrier operasyonlarının 2032'de sona ereceğini doğruladığını bildiriyor.

Rota'nın İspanyol tarafındaki uçuşların çoğu döner kanatlı uçaklardan oluşuyor ve helikopter filosu üç yıl içinde neredeyse tamamen yenilendi. 1988'de kurulan 10. Filo, ilk altı SH-60B Seahawk helikopterini 22 Aralık 1988'de teslim aldı ve Santa María ve Álvaro de Bazán sınıfı fırkateynlerden ve amfibi gemilerden müfrezelere uçuş desteği sağlıyor; ayrıca Hint Okyanusu'nda korsanlıkla mücadele görevi için sürekli bir helikopter varlığı da bulunuyor. Kasım 2025'te 5. Filoyu ve altı SH-60F helikopterini bünyesine kattı ve SH-60B'lerin yerine sekiz MH-60R helikopteri teslim alması planlanıyor.

12. Filo, 6 Şubat 2023'te kuruldu ve ilk iki H135 helikopteri olan 1201 ve 1202 numaralı helikopterleri 11 Aralık 2023'te Albacete'deki Airbus'tan teslim aldı. Helikopter pilotlarını eğitiyor ve seçiyor, gemilere ve deniz piyadelerine destek veriyor ve operasyonel değerlendirmesini 2 Kasım 2024'te tamamladı. 23 Nisan 2024 tarihli bir kararnameyle kurulan 14. Filo, ilk iki NH90 MSPT helikopterini 24 Temmuz 2025'te teslim aldı; Donanma, amfibi ve özel operasyonlarda birlik taşımacılığı, arama kurtarma ve tıbbi tahliye için 2027 yılına kadar yedi adet helikopter planlıyor.

Sabit kanatlı destek birimi küçüktür. 21 Ekim 1964'te faaliyete geçen 4. Filo, deniz gözetimi, VIP taşımacılığı ve tıbbi tahliye için batı apronundan, yani platformdan üç Cessna Citation II ve bir Citation VII uçağı uçurmaktadır; 36 kişilik bu filo, 25 Ocak 1977'den 1992'ye kadar Piper Comanche uçaklarıyla uçmuştur. Rota'da olmayan tek insansız hava aracı filosu, 11. Filo'dur: Donanma, bu filoyu Cádiz yakınlarındaki Torregorda'daki filo tesislerine yerleştirmiştir.

Rota'daki ABD varlığı burada yalnızca yayınlanmış kaynaklardan aktarılmıştır. Soğuk Savaş döneminde en önemli unsurları uçaklar değildi. Vikipedi'ye göre, 16. Denizaltı Filosu, 28 Ocak 1964'ten itibaren Rota'da konuşlanmış ve Polaris ve daha sonra Poseidon balistik füze denizaltılarını desteklemiştir; 1976'da onaylanan bir anlaşma uyarınca Temmuz 1979'da geri çekilmiştir. Havaalanı, 1959'dan itibaren VQ-2 elektronik keşif filosuna ev sahipliği yapmıştır; GlobalSecurity, filonun 1 Eylül 2005'te altı uçak ve 450 denizciyle birlikte Washington, Whidbey Adası'na taşındığını kaydetmektedir. İngilizce Vikipedi ayrıca 1962'den 1993'e kadar bir C-130F lojistik filosunu (VR-22; İspanyolca Vikipedi VR-24 olarak adlandırıyor) listelemektedir.

Mevcut dönem, ABD Savunma Bakanı'nın NATO'nun füze savunmasının bir parçası olarak Rota'da dört Aegis destroyerinin konuşlandırılacağını duyurduğu 5 Ekim 2011'de başladı. İlki olan USS Donald Cook'un Şubat 2014 ortalarında geleceği açıklandı. Gemiler o zamandan beri rotasyona tabi tutuldu; ABD Donanması'nın Rota sayfaları, USS Oscar Austin'in 15 Ekim 2024'te Norfolk'tan Rota'ya geçişini tamamlayarak gemi sayısını beşe çıkardığını kaydediyor. İspanyolca Vikipedi, Mayıs 2023'te imzalanan ve Madrid'deki 2022 NATO zirvesinde varılan bir anlaşmayla sayının altıya çıkarıldığını kaydediyor; altıncı geminin gelişi bu sayfada doğrulanmadı.

Muhrip gemileri helikopter getiriyor. Wikipedia'ya göre Haziran 2016'dan beri aktif olan ABD Donanması'nın 79. Deniz Helikopter Saldırı Filosu, Rota'dan MH-60R Seahawk helikopterleri uçuruyor ve ileri konuşlandırılmış gemilere birlikler gönderiyor. Havaalanı ayrıca ABD Donanması ve ABD Hava Kuvvetleri uçakları için bir geçiş noktası görevi görüyor; ABD Donanması, istasyonun 40'tan fazla bağlı komutanlığı ve yaklaşık 7.000 Amerikalıyı desteklediğini, bunların arasında 3.500'den fazla aktif görevli personel, yaklaşık 3.000 aile üyesi ve 500'den fazla sivil çalışanın bulunduğunu belirtiyor.