بُنيت قاعدة باغرام بمساعدة سوفيتية في خمسينيات القرن الماضي، عندما لجأت أفغانستان بقيادة رئيس الوزراء داود إلى موسكو للحصول على الأسلحة. وتشير موسوعة ويكيبيديا الإنجليزية إلى أن الرئيس أيزنهاور هبط هنا عام ١٩٥٩، حيث استقبله الملك ظاهر شاه وداود نفسه، مما يُذكّر بأن القوتين العظميين تنافستا لسنوات قليلة على كابول. وبحلول سبعينيات القرن الماضي، أصبحت القاعدة مقرًا لفوج طائرات ميغ-٢١ التابع لسلاح الجو، الفوج ٣٢٢، وفيلق ضباط مُدرّبين سوفييتيًا.

قاد هذا الفيلق من الضباط ثورة ثور. ففي 27 أبريل/نيسان 1978، ووفقًا لموقع ويكيبيديا، غادر العقيد عبد القادر "بمروحية إلى قاعدة باغرام الجوية"، وتولى القيادة هناك، و"نظم غارات جوية على القصر الملكي"، بينما كانت الدبابات تهاجم كابول. وقُتل الضباط الذين قاوموا في المطار. وتوفي داود في الأرجنتين في تلك الليلة. وتختلف التقديرات حول عدد القتلى: إذ يذكر أنتوني هايمان أن 30 ضابطًا قُتلوا في باغرام وحدها، بينما كتب محمد نبي عظيمي أن حوالي 40 شخصًا فقط ربما لقوا حتفهم إجمالًا؛ وتشير تقديرات أخرى إلى أعداد أكبر بكثير.

بعد التدخل السوفيتي في ديسمبر 1979، أصبحت قاعدة باغرام إحدى المحاور الرئيسية للوحدة المحدودة. تشير ويكيبيديا إلى وجود فرقة المشاة الآلية 108 وفوج الحرس المحمول جواً 345 في القاعدة أو حولها، بالإضافة إلى فوج الطيران الهجومي 368 المزود بطائرات سو-25 من أكتوبر 1986 إلى نوفمبر 1987. وبقيت وحدات أفغانية إلى جانبها: فوج المقاتلات الجوية 322 وفوج الطيران 321، مع وجود ثلاث أسراب من طائرات ميغ-21 في باغرام عام 1990.

لم ينتهِ دور القاعدة في السياسة الأفغانية مع الانسحاب السوفيتي في فبراير 1989. فخلال محاولة الانقلاب الفاشلة في 6-7 مارس 1990، هاجم طيارون موالون لوزير الدفاع شاهنواز تاناي كابول، وسقطت ثلاثة صواريخ قرب القصر الرئاسي. وفي ظهيرة 7 مارس، وصل تاناي إلى باغرام وفرّ بطائرة هليكوبتر إلى بيشاور في باكستان. وفي الحرب الأهلية التي تلت ذلك، بحسب ويكيبيديا، سيطر كل من التحالف الشمالي وحركة طالبان على طرف من القاعدة منذ عام 1999، وكانت طالبان على مرمى المدفعية وقذائف الهاون من الطرف الآخر.

في أوائل ديسمبر/كانون الأول 2001، أمّنت وحدة الخدمة البحرية الخاصة البريطانية المطار، وتبعتها فرقة المشاة الجبلية العاشرة الأمريكية. وبحلول منتصف يونيو/حزيران 2002، كان أكثر من 7000 فرد من القوات الأمريكية والحليفة متواجدين هناك، وبحلول عام 2009، أصبحت القاعدة قادرة على استيعاب حوالي 10000 فرد. وتشير سجلات وكالة البحوث التاريخية التابعة للقوات الجوية إلى أن الجناح الجوي الاستكشافي 455 كان متمركزًا في باغرام منذ 26 يوليو/تموز 2002، حيث قام بتحليق طائرات من طراز A-10 وF-16 وF-15E وC-130 وMC-12 في مهام مكافحة الإرهاب في أوقات مختلفة؛ وتضيف ويكيبيديا الإنجليزية طائرات EA-6B منذ عام 2003 وطائرات MQ-9 منذ عام 2014.

كانت قاعدة باغرام أيضاً موقعاً للاحتجاز. تم نقل مركز احتجاز باروان، الذي اكتمل بناؤه في نوفمبر 2009 ويتسع لحوالي 3000 شخص، إلى السيطرة الأفغانية في عام 2012. وتعرضت القاعدة لهجمات متكررة: ففجر انتحاري نفسه عند البوابة خلال زيارة نائب الرئيس تشيني في فبراير 2007، مما أسفر عن مقتل 23 شخصاً، وفي نوفمبر 2016، قتل انتحاري آخر أربعة أمريكيين على الأقل. وفي أبريل 2013، تحطمت طائرة شحن من طراز بوينغ 747 أثناء الإقلاع، مما أسفر عن مقتل جميع أفراد طاقمها السبعة.

غادرت القوات الأمريكية قاعدة باغرام ليلة 1-2 يوليو/تموز 2021. وصرح قائدها الأفغاني الجديد، الجنرال مير أسد الله كوهستاني، لقناة الجزيرة بأن قواته لم تعلم بالأمر إلا في الصباح، وأن اللصوص نهبوا الثكنات قبل طردهم. وفي 15 أغسطس/آب 2021، مع انهيار الجمهورية الإسلامية، تراجعت القوات الأفغانية، واستولت حركة طالبان على القاعدة وأطلقت سراح السجناء المحتجزين فيها.

ثم أصبحت قاعدة باغرام رمزًا. في أغسطس/آب 2024، أحيت حركة طالبان الذكرى السنوية الثالثة لانتصارها هناك. وفي سبتمبر/أيلول 2025، صرّح الرئيس ترامب بأن الولايات المتحدة تسعى لاستعادة القاعدة، مُشيرًا إلى بُعدها عن المواقع النووية الصينية؛ وردّ المتحدث باسم طالبان، ذبيح الله مجاهد، بأن الأفغان لن يُسلّموا أرضهم لأحد. وفي 7 أكتوبر/تشرين الأول 2025، وصف اجتماع "صيغة موسكو" للقوى الإقليمية البنية التحتية العسكرية الأجنبية في أفغانستان بأنها غير مقبولة. وفي 1 مارس/آذار 2026، خلال الحرب الأفغانية الباكستانية، صرّح مسؤولون باكستانيون بأنهم دمّروا طائرات في المطار؛ بينما نفى مسؤولو طالبان وقوع أي أضرار. وأظهرت صور الأقمار الصناعية التي نشرتها صحيفة نيويورك تايمز تدمير حظيرة طائرات ومستودعين.