بدأ بناء المحطة في أواخر عام 1937، لكن المصادر تختلف حول تاريخ افتتاحها. يشير كتابان تاريخيان محليان للطيران إلى 4 نوفمبر 1940، بينما يذكر نادي الطيران التذكاري التابع لسلاح الجو الملكي البريطاني تاريخ 7 يناير 1941 كافتتاح رسمي، أما صفحة المحطة التابعة لسلاح الجو الملكي البريطاني فتكتفي بذكر عام 1941. لم يوفق أي من هذه المصادر في التوفيق بين التواريخ، لذا تُشير هذه الصفحة إلى الفترة ما بين 4 نوفمبر 1940 و7 يناير 1941. على أي حال، افتُتحت محطة كونينغسبي كمحطة تابعة للمجموعة الخامسة في قيادة القاذفات.

وصلت السرب رقم 106 بطائرات هامبدن في أواخر فبراير 1941. وكانت أولى عملياتها ضد كولونيا في 1-2 مارس بداية متعثرة: حيث تم تخصيص ثماني طائرات، ولم تقلع منها سوى خمس. وبعد ليلتين، فقدت القاعدة أول طائرة لها، هامبدن X3002، مع طاقمها المكون من أربعة أفراد. ولحق بها السرب رقم 97 في مارس بطائرات أفرو مانشستر، وقام كلا السربين بالتحول إلى طائرات لانكستر في كونينغسبي.

انضم غاي جيبسون إلى السرب رقم 106 في كونينغسبي ربيع عام 1942، حيث قام بأولى عملياته الجوية في مانشستر مع السرب في 22 أبريل، ثم نفذ أولى عملياته الجوية على متن طائرات لانكستر بحلول يوليو. غادر السرب إلى قاعدة سلاح الجو الملكي البريطاني في سايرستون في مطلع سبتمبر وأكتوبر 1942 (تشير المصادر إلى 30 سبتمبر و1 أكتوبر). أُغلقت كونينغسبي فعليًا من سبتمبر 1942 إلى أغسطس 1943 لإنشاء ثلاثة مدارج صلبة، أطولها بطول 1950 ياردة.

استقبل المطار المُعاد بناؤه السرب رقم 617 في 30 أغسطس 1943. وفي 14-15 سبتمبر، انطلقت قاذفات لانكستر التابعة للسرب نحو قناة دورتموند-إمس، ثم استُدعيت بسبب سوء الأحوال الجوية؛ وفُقدت طائرة ديفيد مالتبي، على الأرجح بعد اصطدامها بطائرة موسكيتو. وفي الليلة التالية، حاولت ثماني طائرات أخرى قصف القناة بقنابل زنة 12000 رطل، وفُقدت خمس منها، بما في ذلك قائدها الجديد، جورج هولدن. ولم تتضرر القناة. انتقل السرب إلى وود هول سبا في يناير 1944، ومنذ أبريل، حلّق السربان رقم 83 و97 من كونينغسبي كطائرات استطلاع تابعة للمجموعة الخامسة حتى عام 1946.

بعد الحرب، قامت المحطة بتشغيل طائرات لينكولن لفترة وجيزة، وطائرات موسكيتو حتى مارس 1950، وطائرات بوينغ واشنطن، وطائرات بي-29 التابعة لسلاح الجو الملكي البريطاني، من عام 1950 إلى عام 1953، وطائرات إنجلش إلكتريك كانبرا من عام 1953 إلى عام 1961. جلبت طائرات كانبرا القصف النفاث إلى كونينغسبي، لكن الإرث الأكثر ديمومة للحرب الباردة يقع خارج السياج مباشرة، في موقع يسمى بلاك هولت، والذي سجلته هيئة التراث الإنجليزي بأنه تم اختياره كواحد من مناطق التخزين التكميلية للأسلحة الذرية البريطانية.

في أوائل خمسينيات القرن العشرين، حُوِّلَت بلاك هولت إلى منطقة تخزين إضافية لقنبلة "بلو دانوب"، أول قنبلة ذرية بريطانية عاملة، يبلغ طولها 7.3 أمتار ووزنها أربعة أطنان. حُفِظَت القنابل في مبانٍ خرسانية مسلحة مُحصَّنة، بينما حُفِظَت النوى الانشطارية بشكل منفصل. وتوالت الأسلحة اللاحقة، وصولًا إلى قنبلة "يلو صن مارك 1". تُحصي هيئة التراث الإنجليزي 24 مخزنًا، وتربط هذا العدد بثلاثة أسراب من ثماني قاذفات قنابل من طراز V في كونينغسبي.

حلقت تلك الأسراب بطائرات فولكان، التي وصلت في عام 1962. ويشير سجل متحف سلاح الجو الملكي البريطاني لطائرة فولكان XM598 إلى أنها سُلمت إلى السرب رقم 12 في كونينغسبي في 4 سبتمبر 1963. وفي 1 مارس 1964، تم دمج الأسراب رقم 9 و12 و35 في جناح واحد في كونينغسبي، وفي 7 نوفمبر 1964 انتقل الجناح إلى قاعدة سلاح الجو الملكي البريطاني في كوتسمور، منهياً بذلك حقبة قوة V القصيرة في كونينغسبي.

صمدت قاعدة بلاك هولت بعد قصفها. ففي ثمانينيات القرن الماضي، ومع تحصين المطارات الرئيسية ضد الهجمات النووية والبيولوجية والكيميائية، تحول أحد مبانيها التجريبية المحصنة إلى مركز قيادة آمن. أُغلق الموقع في تسعينيات القرن الماضي وانتقل إلى ملكية خاصة، وفي 24 فبراير 2020، أدرجت هيئة التراث الإنجليزي مبنى الاختبارات السابق ضمن قائمة المباني التاريخية من الدرجة الثانية. أما قاعدة سلاح الجو الملكي البريطاني كونينغسبي، فقد ظلت مفتوحة طوال تلك الفترة.

أصبحت قاعدة كونينغسبي قاعدةً للمقاتلات مزودةً بطائرات ماكدونيل دوغلاس فانتوم FGR2. تشكلت وحدة التحويل العملياتي رقم 228 هناك في أغسطس 1968 كأول وحدة فانتوم، تلتها السرب رقم 6 في مايو 1969، والسرب رقم 54 في سبتمبر 1969، والسرب رقم 41 في أبريل 1972. بدأت طائرات فانتوم كونينغسبي في دور الهجوم الأرضي، ثم انتقلت إلى الدفاع الجوي بمجرد أن تولت طائرات جاغوار مهام الهجوم الأرضي.

شهدت سنوات طائرات فانتوم أسوأ خسارة للمحطة في زمن السلم. ففي 9 أغسطس 1974، اصطدمت طائرة فانتوم تابعة للسرب رقم 41، يقودها قائد المحطة، قائد المجموعة ديفيد بلوك، بطائرة رش محاصيل فوق نورفولك، مما أسفر عن مقتل بلوك، وملاحه، الملازم أول تيرينس كيركلاند، وطيار باوني، بول هيكموت، البالغ من العمر 24 عامًا. وألقى محققو الحادث باللوم على غياب أي نظام لتنسيق الطيران المنخفض العسكري والمدني.

بحسب فرع التاريخ الجوي، دخلت طائرة الدفاع الجوي تورنادو الخدمة في عام 1984 في شكلها المؤقت F2، ووصلت أولى طائرات تورنادو F3 إلى كونينغسبي في يوليو 1986. وبدأت وحدة التدريب العملياتي رقم 229 بتدريب أطقم F3 هناك في ذلك الشهر، واستلم السرب رقم 29، وهو أول سرب عملياتي من طراز F3، هذا النوع في الخدمة في كونينغسبي في أبريل 1987. وبحلول عام 1990، جهزت طائرات F3 خمسة أسراب، جميعها متمركزة في بريطانيا.

عندما غزا العراق الكويت في أغسطس 1990، كانت أطقم السربين 5 و29 في معسكر تدريب على الأسلحة في قبرص، وأُرسلت مباشرةً إلى الظهران. أحصى فرع التاريخ الجوي 12 طائرة من طراز F3 هناك بحلول 11 أغسطس، و18 طائرة بحلول 22 سبتمبر. وخلال عملية غرانبي، نفّذت فرقة طائرات F3، المُشكّلة من عدة قواعد، 2666 طلعة جوية، منها 698 طلعة قتالية خلال حرب الخليج.

كانت قاعدة كونينغسبي أول قاعدة تابعة لسلاح الجو الملكي البريطاني تُشغّل طائرات تايفون في الخطوط الأمامية. وكان السرب رقم 29، الذي أُعيد تشكيله عام 2003، ثاني سرب في سلاح الجو الملكي البريطاني يتسلم هذه الطائرات، وانتقلت وحدات تايفون الأولى من مطار شركة بي إيه إي سيستمز في وارتون عام 2005. ووصل السرب رقم 3 (المقاتل) عام 2006 كأول سرب تايفون في الخطوط الأمامية، وتشكل السرب رقم 11 (المقاتل) كسرب تايفون متعدد المهام عام 2007.

في 29 يونيو 2007، دخلت طائرات تايفون الخدمة الفعلية عندما تولى السرب رقم 3 (المقاتل) مهام الاستجابة السريعة في قاعدة كونينغسبي من طائرات تورنادو إف 3؛ وكان قد تم تسليم 43 طائرة تايفون إلى القاعدة بحلول ذلك الوقت. تتولى كونينغسبي النصف الجنوبي من المهمة، بينما تتولى قاعدة لوسيماوث الجوية الملكية النصف الشمالي. وفي عام 2012، أفاد سلاح الجو الملكي البريطاني أن طياريه يعملون بنظام مناوبات الاستجابة السريعة لمدة 24 ساعة مرة أو مرتين شهريًا.

لا تنشر وزارة الدفاع أرقامًا دقيقة لعمليات الإطلاق. ففي عام 2020، اكتفت الوزارة بذكر عدد الأيام التي أطلقت فيها طائرات الاستجابة السريعة البريطانية صواريخها، وذلك لكلا المحطتين معًا: 12، 12، 6، 9، و14 يومًا على التوالي خلال الفترة من 2015 إلى 2019. وقد سُمع دوي بعض عمليات الإطلاق على الأرض: ففي 12 يناير 2021، حلّقت طائرات تايفون كونينغسبي بسرعة تفوق سرعة الصوت للوصول إلى طائرة مدنية فقدت الاتصال بها، ووصل دوي الإطلاق إلى لندن والمقاطعات الشرقية.

تُصنّف القوات الجوية الملكية اليوم السربين رقم 3 (المقاتل) ورقم 11 (المقاتل) كوحدات خط المواجهة، بينما يتولى السرب رقم 29 تدريب طياري طائرات تايفون. أُعيد تشكيل السرب رقم 12 في يوليو 2018 كسرب مشترك بين القوات الجوية الملكية والقوات الجوية الأميرية القطرية، وبدأ عملياته المشتركة في كونينغسبي عام 2020. ويحمل السرب رقم 11 (المقاتل) شرف معركة ليبيا 2011، التي شهدت الظهور الأول لطائرة تايفون في القتال.

افتُتح سرب الطائرات التاريخية التابع لسلاح الجو الملكي البريطاني في 11 يوليو 1957 في قاعدة بيغين هيل الجوية، ثم أصبح سرب معركة بريطانيا، واتخذ اسمه الحالي في عام 1969. وبين عامي 1959 و1965، كان يضم طائرة سبيتفاير واحدة فقط، تحمل الرقم PM631، وطائرة هوريكان واحدة، تحمل الرقم LF363؛ ولا تزال كلتاهما في الخدمة. وصل السرب إلى كونينغسبي قادمًا من قاعدة كولتيشال الجوية في 1 مارس 1976، وفي عام 2026، احتفلت القاعدة بمرور 50 عامًا على وجودها فيها.

يضم أسطول سلاح الجو الملكي البريطاني خمس طائرات من طراز سبيتفاير، وهوريكان LF363 وPZ865، ولانكستر PA474، وداكوتا ZA947، وطائرتين من طراز تشيبمونك WG486 وWK518. وتشير مجلة "ذا فلايت" إلى أنه لم يتبق في العالم سوى 12 طائرة هوريكان صالحة للطيران وطائرتين لانكستر صالحتين للطيران. ويُفتح حظيرة الطائرات للجمهور من خلال مركز للزوار، تم تجديده مؤخرًا بالتعاون مع مجلس مقاطعة لينكولنشاير. وفي عام 2018، بمناسبة الذكرى المئوية لتأسيس سلاح الجو الملكي البريطاني، عرضت الحظيرة أيضًا طائرة هوكر تايفون MN235 التابعة لمتحف سلاح الجو الملكي البريطاني، وهي النموذج الوحيد المتبقي من هذا النوع.

في 11 سبتمبر 1991، تعرضت طائرة الهوريكان LF363، التي كانت تحلق ضمن تشكيل جوي مع طائرتي لانكستر وسبيتفاير من كونينغسبي إلى جيرسي، لعطل في عمود الكامات. توقف المحرك أثناء اقترابها من قاعدة سلاح الجو الملكي البريطاني في ويترينغ، وتحطمت الطائرة في المطار؛ ونجا قائدها بإصابة طفيفة في الكاحل وحروق بسيطة. استغرقت عملية إعادة بناء الطائرة سنوات، وباعت فرقة الطيران طائرة سبيتفاير PS853 للمساعدة في تمويلها. حلقت LF363 مرة أخرى في 29 سبتمبر 1998.

حادثة واحدة فقط من حوادث طائرات سلاح الجو الملكي البريطاني كانت مميتة. ففي 25 مايو/أيار 2024، تحطمت طائرة سبيتفاير MK356، المصنعة عام 1944، بالقرب من كونينغسبي، مما أسفر عن مقتل قائد السرب مارك لونغ، البالغ من العمر 43 عامًا. وذكر موقع فلايت غلوبال أن هذه الحادثة هي أول خسارة مميتة لطائرة من طراز سلاح الجو الملكي البريطاني منذ عام 1957. وتم إيقاف السرب عن الطيران. وفي مارس/آذار 2025، سمح سلاح الجو الملكي البريطاني لطائرات سبيتفاير وهوريكان بالتحليق مجددًا ريثما يستمر التحقيق.

يتمتع السرب الذي يختبر الآن تكتيكات طائرة تايفون بسجل قتالي حافل. تشكّل السرب في الأصل كسرب رقم 41 التابع لسلاح الجو الملكي البريطاني، وأُرسل إلى فرنسا عام 1916، حيث حلّقت طائرات سبيتفاير خلال معركة دونكيرك ومعركة بريطانيا، حين كان إريك لوك، الطيار صاحب أعلى رصيد من النقاط في سلاح الجو الملكي البريطاني خلال تلك المعركة، يخدم ضمن صفوفه. وفي عام 1944، دمّر السرب 53 قنبلة طائرة من طراز V-1 في غضون تسعة أسابيع.

كان أول ارتباط لها بقاعدة كونينغسبي في 1 أبريل 1972، عندما أعيد تشكيلها هناك على متن طائرات فانتوم FGR2. وكانت إحدى طائرات الفانتوم التابعة للسرب هي التي كان يقودها قائد القاعدة في حادث التصادم المميت فوق نورفولك في أغسطس 1974. وتحول السرب إلى طائرات جاغوار في عام 1977، منهيًا بذلك خمس سنوات من تحليق طائرات الفانتوم من كونينغسبي. وشعارها هو: البحث والتدمير.

في عام ٢٠٠٦، ونظرًا لتهديدها بالحل كوحدة قتالية في الخطوط الأمامية، أصبحت السرب رقم ٤١ (الاحتياطي)، وحدة تقييم العمليات للطائرات النفاثة السريعة والأسلحة. وفي عام ٢٠١٣، أصبحت السرب رقم ٤١ (الاحتياطي) للاختبار والتقييم، وتسلّمت أول طائرة تايفون. ويُعرف الآن باسم السرب رقم ٤١ للاختبار والتقييم، وهو تابع لمركز الحرب الجوية والفضائية، ومقره في قاعدة وادينجتون التابعة لسلاح الجو الملكي البريطاني، ويصف سلاح الجو الملكي البريطاني تركيزه الرئيسي بأنه تطوير قدرات وتكتيكات طائرات تايفون.