チェコスロバキアの軍用航空はクベリで誕生した。基地の公式記録によると、プラハ北東端のクベリ、レトニャニ、ヴィソチャニに挟まれた高地にあるこの場所は、独立から数週間後の1918年11月に選ばれた。冬が来る前にいくつかの仮設建物とキャンバス製の格納庫が建てられ、1918年12月にはチェコスロバキアの「航空航法」の最初の航空機がこの飛行場から離陸した。.

常設飛行場は1920年代に拡張された。1920年の春には、かつてオーストリアのヘプにあった飛行場からワグナー式格納庫6棟が移設された。そのうちいくつかは現存し、現在は博物館の展示物として利用されている。その後、兵舎や近代的な鉄筋コンクリート製の格納庫が管制塔を中心に緩やかな弧を描くように配置され、1928年には頂上に警告灯と航行灯を備えた「マヤク」（灯台）と呼ばれる給水塔が基地のランドマークとなった。.

クベリはプラハの民間空港でもあった。1923年の春、新設されたチェコスロバキア国営航空を支援するため、第1航空連隊から軍用航空輸送部隊が編成され、同年10月には同航空会社初の定期便がクベリからブラチスラバに向けて出発した。この飛行場は1937年にルズィニェが開港するまで独占状態を維持した。1938年初頭、戦争が迫る中、アヴィアB-534戦闘機を擁する第4航空連隊と、アエロAb-101およびアヴィアB-71爆撃機と偵察機を擁する第6航空連隊が移駐してきた。.

空軍は1938年に動員されたものの、戦闘には参加しなかった。1939年3月、クベリはドイツ軍が占領した最初の軍事拠点の1つとなり、基地の歴史記録によると、ドイツ軍は飛行場と近隣の工場に大規模な修理施設を設置した。そのため、プラハの飛行場は攻撃の標的となった。ウィキペディアにまとめられた記述によると、1945年3月25日、イタリアから飛来した約650機の米軍爆撃機がクベリ、レトニャニ、チャコヴィツェ、そしてヴィソチャニのČKD工場を攻撃し、プラハで235人が死亡した。.

解放後、クベリは軍事輸送の本拠地となった。1945年7月には、ソ連とイギリスから供給されたC-47輸送機と鹵獲機を用いて軍事航空輸送群が編成され、1946年4月には航空輸送連隊が編成され、1947年にクベリに移転した。この連隊は、アメリカとイギリスの余剰装備で一部再装備された。1952年までに、C-47輸送機2個飛行隊、Li-2輸送機1個飛行隊、グライダー飛行隊を擁するようになり、1953年12月には輸送および空挺連隊となった。.

1956年、国防省のVIP専用機である国防省第7飛行隊が分離され、連隊自体が1959年8月にプロスチェヨフに移転した後もクベリに留まった。Mi-1とMi-4ヘリコプターは1956年に到着し、Il-14は1966年からAn-24に置き換えられ、最初のL-410は1977年に、Mi-17は1983年に到着し、Yak-40、Tu-134、Tu-154ジェット機が要人を輸送した。1989年12月31日に第3航空輸送連隊が再編成され、1990年5月5日に初代大統領TGマサリクの名が付けられた。.

冷戦のほとんどの期間、政府所有のジェット機は空軍ではなく内務省航空局に属していた。内務省は1972年から1979年の間にYak-40を8機購入し、空軍は1981年に2機を受領した。チェコスロバキアの分裂後、内務省は要人輸送の役割を維持したが、1998年に政府はNATOの慣行に従うことを決定した。国家航空局は1998年12月31日に解散され、基地の歴史によれば、1999年1月1日からクベリ基地は人員を「増やすことなく」すべての政府高官を輸送するようになった。.

基地は、1996年に新しい管制塔を建設し、1995年から1998年にかけて5000万コルナをかけて格納庫47を旅客ターミナルに改修し、1998年には精密進入システムを導入するなど、任務に備えて準備を進めた。移管に伴い移管されたカナディアCL-601チャレンジャーは、1992年9月24日にヴァーツラフ・クラウス首相をニュルンベルクまで運ぶという初の公式飛行を行い、2022年8月16日まで5105として運用され、7,692時間の飛行時間を記録し、現在はクベリ博物館に展示されている。.

2機のYak-40は2020年9月2日にクベリで最後の飛行を行った。最初のエアバスA319CJ、シリアル番号2801は2007年1月30日に機体に加わり、2機目、3085がそれに続いた。この部隊は2003年7月1日に第24航空輸送基地と改称され、現在では第241輸送飛行隊がエアバスを運航している。小規模な代表団は2機のサロン付きL-410ターボレットで移動するが、これらは2022年にクベリの滑走路が修理のために閉鎖された際にエアバスと共にルズィニェに移った。.

戦術輸送機部隊は、2007年に第241輸送・特殊飛行隊から分離した第242輸送・特殊飛行隊に所属している。2010年には、An-26の後継機として、シリアル番号0452から0455までのC-295Mが4機到着し、2021年にはシリアル番号0481と0482のC-295MWが2機続いた。2026年1月までに、6機は約23,000サイクルで約25,400時間の飛行を行った。同飛行隊は2013年から、多国籍軍監視団とともにシナイ半島に1機を配備している。同飛行隊は、航空測量やレーザースキャンに使用される2機のL-410FG写真測量機を含むL-410ターボレットも運用している。.

これらのフライトの中には避難を目的としたものもあった。2014年7月31日、民兵同士の戦闘がリビアの首都トリポリに迫る中、C-295M 0452はクベリからトリポリへ飛行し、パレルモで給油した後、チェコ大使とスイス大使館職員11名を含む21名を帰還させた。2021年8月には、第241飛行隊のA319CJ 3085がバクー経由でカブールへ3回飛行し、195名をクベリへ輸送した。.

最も珍しい貨物は野生の馬です。プラハ動物園とともに、C-295はプルツェワルスキーウマを中央アジアに輸送してきました。2011年から2019年の間にモンゴル西部のグレートゴビB保護区に34頭、そして2024年からはカザフスタンのアルティンダラ保護区に輸送されています。C-295M 0455は2026年5月31日から6月4日の間に3回目の輸送で8頭を運び、合計55頭となりました。.

第243ヘリコプター飛行隊は、ポーランド製のPZL W-3AソコルとMi-17を運用しており、陸軍の募集サイトによると、同飛行隊には19機のヘリコプターが配備されている。ソコルは1996年末に到着し、そのうち11機はチェコ共和国に残っていたMiG-29戦闘機10機と交換でポーランドから入手した。最初の大きな任務は、1997年のモラヴィア地方の大洪水だった。6機は航空救助用に改造され、20年間で27,300時間の飛行時間を記録し、11,600人以上の患者を搬送した。.

ソコルは老後を楽に過ごせたわけではない。2024年2月、国防省は、唯一の入札額が2億5000万コルナの見積もりに対して8億5000万コルナだったため、近代化計画を中止し、アップグレードは非経済的であると判断した。この機種は2028年12月31日に退役する予定である。ソコルは今も活躍している。2026年5月2日から5日の間に、クベリ基地のMi-17とクベリ基地およびリーニェ基地のW-3Aが、ボヘミアン・スイス国立公園の火災に対して596回の放水を行い、1023トンの水を運搬した。これは全放水の3分の1以上である。.

クベリはサロンヘリコプターも操縦した。Mi-8S VIPバージョンは1989年1月に到着し、チェコ空軍は5機を保有したが、6機目の0837は連邦が分裂した際にスロバキアに移管された。2021年時点で3機が残っており、2023年から2025年の間に退役し、標準的な旅客仕様のMi-17 2機に置き換えられる予定だった。そのうちの1機、0829は2001年10月28日にアメリカ人宇宙飛行士ユージン・サーナンを乗せて墜落し、事故については「インシデント」の項で説明されている。.

古い格納庫には、1968年に設立されたプラハ軍事史研究所のクベリ航空博物館が入っています。博物館自身の集計によると、所蔵機は275機で、そのうち約100機が屋内展示、25機が屋外展示、155機が保管庫に、10機が飛行可能な状態です。同博物館は、ヨーロッパ最大級の航空博物館の一つであると自称しています。2026年4月25日に開幕した58シーズン目には、1926年にヴィレム・スタノフスキー大尉と整備士のフランティシェク・シメクが23カ国を1万5000キロメートル以上飛行したアエロAb-11の復元機が公開されました。.

飛行場自体も常に変化している。2022年5月と6月には、2,000mの滑走路06/24が3,400万コルナ以上の修理のため閉鎖された。A319CJとサロン・ターボレットはルズィニェに、CASAとL-410はチャースラフに移ったが、ヘリコプターはクベリから飛び続けていた。チェコの航空情報出版物（AIP）では、クベリは24時間営業の軍用飛行場として記載されており、現地時間21時から5時までの間は他の航空機の離着陸が禁止されている。.

数十年来最大の変化は、2026年7月16日にエンブラエルがクベリで2機のC-390ミレニアム輸送機のうち最初の1機を正式に引き渡した時に起こった。契約は2024年10月25日に付加価値税抜き113億コルナで締結され、機体番号0520の機体はブラジルから飛来し、2機目は2027年12月に納入予定である。空軍司令官は、この機体は自然災害、避難、大規模火災の際にも市民の役に立つだろうと述べた。.