وُلدت صناعة الطيران العسكري المكسيكي في بالبوينا، في السهول الواقعة شرق المدينة القديمة، حيث تم إجراء أول رحلة طيران بمحرك فوق الأراضي المكسيكية في عام 1910، وحيث تم افتتاح مطار عسكري بخمسة مدارج في عام 1915. وبحلول نهاية الحرب العالمية الثانية، أصبح المطار صغيرًا جدًا بالنسبة للطائرات التي كانت القوات الجوية تحصل عليها: تشير ويكيبيديا الإسبانية إلى أن السرب 201، العائد من الفلبين في نوفمبر 1945، اضطر إلى الاستقرار في لاس باخاداس في فيراكروز لأن مدرج بالبوينا لم يكن كبيرًا بما يكفي لطائرات بي-47 ثندربولت الخاصة به.

كان الحل إنشاء قاعدة جديدة على أرض فضاء في ولاية المكسيك. تأسست قاعدة سانتا لوسيا عام ١٩٥٢ لنقل قاعدة بالبوينا، وافتُتحت رسميًا في ٢٤ نوفمبر ١٩٥٢، في عهد الرئيس ميغيل أليمان. كانت عملية النقل بطيئة: تشير ويكيبيديا إلى أن الطائرات استمرت في الانتقال من بالبوينا حتى عام ١٩٥٩. كان المدرج الجديد ضخمًا بمعايير ذلك الوقت، إذ بلغ طوله ٣٧٨٠ مترًا وعرضه ٧٥ مترًا، وسُمّي لاحقًا باسم الجنرال ألفريدو ليزاما ألفاريز، الذي قاد القاعدة من عام ١٩٦١ إلى عام ١٩٦٤.

على مدار معظم تاريخها، خاضت القوات الجوية المكسيكية معارك ضد المتمردين ومزارع المخدرات، ولم تحارب قوات جوية أخرى، وظل مخزونها من الطائرات النفاثة محدودًا. وجاءت عملية شراء الطائرات المقاتلة الحديثة الوحيدة في عام 1982، عندما طلبت المكسيك 12 طائرة من طراز نورثروب إف-5إي/إف تايجر 2. وتشير سجلات إنفوديفينسا إلى أن أول طائرتين وصلتا إلى القاعدة الجوية العسكرية رقم 1 في 10 أغسطس 1982. وشكّلتا السرب الجوي 401، أول وحدة أسرع من الصوت في الخدمة المكسيكية، والوحيدة حتى الآن.

بعد مرور ثلاثة وأربعين عامًا، كانت الطائرات نفسها لا تزال تشكل كامل قوة الاعتراض المكسيكية. في أغسطس/آب 2025، صرّح قائد القوات الجوية، الجنرال رومان كارمونا لاندا، للصحافة بأن تسع طائرات من طراز إف-5 لا تزال موجودة، ثلاث منها جاهزة للعمليات، وأن القوات الجوية بصدد تحديثها؛ وقد نوقش استبدالها لكن لم يتم تمويله. يشير الجدول الأساسي في ويكيبيديا الإنجليزية إلى أن السرب 401 متمركز في إكستبيك؛ بينما تشير تقارير إنفوديفينسا المستخدمة هنا إلى أن طائرات إف-5 متمركزة في قاعدة بام 1، ولم يتم تأكيد الموقع الحالي للسرب على صفحة رسمية.

في مارس/آذار 2018، اقترح المرشح الرئاسي أندريس مانويل لوبيز أوبرادور إما خصخصة مطار تيكسكوكو الذي كان قيد الإنشاء، أو توسيع قاعدة سانتا لوسيا الجوية لتصبح مطارًا دوليًا. وقد حُسم الأمر في مشاورات جرت في أكتوبر/تشرين الأول 2018، حيث أحصت ويكيبيديا الإسبانية حوالي 747 ألف صوت (69%) لصالح سانتا لوسيا مقابل 310,463 صوتًا (29%) لصالح تيكسكوكو. أُسند المشروع إلى مهندسي الجيش، وبدأ البناء في 17 أكتوبر/تشرين الأول 2019.

افتُتح مطار فيليبي أنخيليس الدولي في 21 مارس 2022، بعد إنفاق ما يُقدّر بـ 115,981 مليون بيزو بحلول ذلك التاريخ، وفقًا لموقع ويكيبيديا الإسبانية. وتم نقل وتوسيع المنشآت العسكرية القائمة، بما في ذلك المدرج وساحة وقوف الطائرات. المطار مملوك للحكومة وتديره هيئة الأمن البحري (SEDENA). وتختلف مقالات ويكيبيديا حول ما إذا كان سلاح الجو قد احتفظ بمدرج واحد (04R/22L، بطول 3500 متر، يعتمد على قواعد الرؤية فقط، في المقالة الإسبانية) أو مدرجين (بإضافة مدرج 04/22 بطول 3000 متر إلى الغرب، في المقالة الإنجليزية).

شهد المطار نموًا بطيئًا، إذ استقبل 7,079,040 مسافرًا في عام 2025، ليحتل بذلك المرتبة السابعة بين المطارات المكسيكية، وفقًا لموقع ويكيبيديا الإنجليزية. كما أسفرت أعمال التنقيب عن اكتشاف رفات ما لا يقل عن 200 ماموث، معروضة الآن في متحف سانتا لوسيا كيناميتزين لعلم الأحياء القديمة، إلى جانب متحف الطيران العسكري الذي يضم 50 طائرة.

خلف المطار، لا تزال القاعدة تمثل قلب القوات الجوية. في 4 يناير 2025، تولى الجنرال خوسيه أنطونيو سييرا أمادور قيادة الجناح الجوي الأول (BAM 1)، بينما تولى الجنرال كواوتيموك ديلغادو مونتياغودو قيادة الجناح الجوي الأول، وكلاهما في قاعدة سانتا لوسيا، وفقًا لبيانات إنفوديفينسا. تعمل أسراب النقل الجوي بجد من هنا: ففي 11 يناير 2025، غادرت طائرة من طراز L-100-30 هيركوليز، تحمل الرقم التسلسلي 3611، وطائرة من طراز C-27J تابعة للسرب الجوي 302 في حوالي الساعة 8:00 صباحًا وعلى متنها 74 من رجال الإطفاء والمسؤولين للتوجه إلى مواقع حرائق لوس أنجلوس.

استعراضٌ لحالة الطائرات القديمة. في 9 سبتمبر 2025، عادت الطائرة C295M 3201، وهي أول طائرة من طراز C295 استلمتها المكسيك عام 2010، من جولة تدريبية وهبطت على بطنها؛ لم يُصب أحد بأذى، ووصفت وكالة إنفوديفينسا الحادث بأنه الأول من نوعه خلال خمسة عشر عامًا من الخدمة في المكسيك. ومع توقع خروج جميع طائرات C-130 من الخدمة بحلول عام 2029، تم طلب طائرتين من طراز C-130J-30 سوبر هيركوليز، ومن المقرر استلام الأولى في نوفمبر 2028.