La Aurora comenzó como un espacio verde. Según la historia del aeropuerto publicada en la Wikipedia en español, la finca perteneció al presidente Manuel Lisandro Barillas y fue urbanizada por José María Reyna Barrios después de 1892 como zona recreativa, con planes para construir una estación de ferrocarril en lo que hoy es el Bulevar 30 de Junio. Tras el asesinato de Reyna Barrios en 1898, su sucesor, Manuel Estrada Cabrera, priorizó el pago de la deuda y los planes se estancaron.

La aviación llegó en la década de 1920. El 30 de junio de 1921, la Escuela Militar de Mecánicos de Aviación se trasladó formalmente a la finca La Aurora, con un Blériot XI-2, un Deperdussin y dos Avro 504K, según el artículo de la Wikipedia en español sobre la fuerza aérea; la Wikipedia en inglés atribuye a una misión militar francesa la apertura de una escuela de vuelo el año anterior. La fuerza aérea considera 1921 como su año de fundación. Bajo el mandato del presidente José María Orellana, la primera actividad de vuelo en La Aurora tuvo lugar en 1923, reemplazando al Campo de Marte como centro de aviación del país, y durante el resto de la década y hasta la década de 1930, una pista de hierba fue todo lo que necesitó.

La Wikipedia en español también registra la inauguración del edificio del aeropuerto en 1936 y la llegada de Pan American, que comenzó a operar en Guatemala en 1929. Desde entonces, la aviación civil y militar ha compartido el espacio aéreo.

La Segunda Guerra Mundial transformó La Aurora. Según la historia del aeropuerto en la Wikipedia en español, la primera pista pavimentada, de 2000 metros de longitud, se construyó en 1942 como parte del establecimiento de una base militar estadounidense. Ese mismo año, Guatemala recibió ayuda del programa de Préstamo y Arriendo; el artículo sobre la fuerza aérea menciona siete cazas Boeing P-26, aviones T-6 Texan armados, BT-13, PT-19 y Stearman entregados en 1943.

Tras la guerra, el aeródromo se convirtió en la escuela de la fuerza aérea, además de su cuartel general. La Escuela Militar de Aviación tuvo su base en el aeropuerto desde 1947 hasta 1989, cuando se trasladó a la nueva base sur en Retalhuleu. Durante ese período, La Aurora vio la llegada de los Mustangs a partir de julio de 1954, los primeros reactores T-33 en enero de 1963 y los A-37 Dragonfly en la década de 1970, aunque las fuentes consultadas no especifican qué tipos de aeronaves estuvieron basadas allí en cada momento.

En el ámbito civil, un DC-8 de Panavías, filial de Pan American, realizó el primer aterrizaje comercial a reacción en 1959 tras la ampliación de la pista, y una nueva terminal, cuya construcción comenzó en 1966, se terminó en 1968 bajo la presidencia de Julio César Méndez Montenegro.

Desde la reorganización de 2003, creada por el Acuerdo Gubernativo 312-2003 del 19 de mayo de 2003, La Aurora ha sido la sede del Comando Aéreo Central "General José Víctor Mejía", abarcando Guatemala, Baja Verapaz, sur de Alta Verapaz, Izabal, Zacapa, Jutiapa, Chiquimula, El Progreso, Chimaltenango, Sacatepéquez, Sololá, Totonicapán, la mayor parte de Quiché y Huehuetenango. En el mismo campo se encuentran la Comandancia de la FAG y la escuela técnica de aviación militar. El aeropuerto civil que los rodea se amplió en el marco del Plan Nueva Aurora lanzado el 14 de abril de 2005, y su pista y calle de rodaje fueron rehabilitadas en marzo de 2010.

Los recientes sucesos en la base demuestran la naturaleza actual de la fuerza aérea: una fuerza de transporte y helicópteros con funciones de seguridad. El 15 de diciembre de 2023, en el 102.º aniversario, el presidente Alejandro Giammattei entregó un Bell 429 al comandante Juan Carlos Ponce Valdez, según AGN. El 29 de diciembre de 2024, Infodefensa informó que un Bell 407GX, que había despegado del Comando Aéreo Central para apoyar a las fuerzas de seguridad, se estrelló contra líneas eléctricas sobre el río Chixoy, causando la muerte de ambos pilotos. A finales de mayo de 2026, un C-130 de la Guardia Nacional Aérea de Arkansas aterrizó en La Aurora con equipo para la FAG, presentado por ambos gobiernos como el restablecimiento de la cooperación tras décadas de suspensión.

El espectáculo aéreo con motivo del 103.º aniversario, el 8 de diciembre de 2024, también se celebró en instalaciones de la FAG, con vuelos en formación y saltos en paracaídas, según la AGN; no se especificó el lugar, y se presume que fue La Aurora, aunque no está confirmado.