La Aurora começou como uma área verde. De acordo com a história do aeroporto na Wikipédia em espanhol, a propriedade pertencia ao presidente Manuel Lisandro Barillas e foi desenvolvida por José María Reyna Barrios após 1892 como uma área de lazer, com planos para uma estação ferroviária ao longo do que hoje é o Bulevar 30 de Junio. Após o assassinato de Reyna Barrios em 1898, seu sucessor, Manuel Estrada Cabrera, priorizou o pagamento da dívida e os planos foram paralisados.

A aviação chegou na década de 1920. Em 30 de junho de 1921, a Escuela Militar de Mecánicos de Aviación mudou-se formalmente para a fazenda La Aurora, com um Blériot XI-2, um Deperdussin e dois Avro 504K, de acordo com o artigo da Wikipédia em espanhol sobre a força aérea; a Wikipédia em inglês atribui a uma missão militar francesa a abertura de uma escola de aviação no ano anterior. A força aérea considera 1921 como seu ano de fundação. Sob a presidência de José María Orellana, a primeira atividade de voo em La Aurora ocorreu em 1923, substituindo o Campo de Marte como centro de aviação do país, e durante o restante da década e ao longo dos anos 1930, uma pista de grama foi suficiente.

A Wikipédia em espanhol também registra a inauguração do prédio do aeroporto em 1936 e a chegada da Pan American, que começou a operar na Guatemala em 1929. Desde então, voos civis e militares compartilham o aeroporto.

A Segunda Guerra Mundial transformou La Aurora. A história do aeroporto na Wikipédia em espanhol afirma que a primeira pista pavimentada, com 2.000 metros de comprimento, foi construída em 1942 como parte da instalação de uma base militar americana. No mesmo ano, a Guatemala recebeu ajuda do programa Lend-Lease; o artigo sobre a Força Aérea lista sete caças Boeing P-26, aviões armados T-6 Texan, BT-13, PT-19 e Stearman entregues em 1943.

Após a guerra, o campo tornou-se a escola da força aérea, bem como seu quartel-general. A Escuela Militar de Aviación esteve sediada no aeroporto de 1947 até 1989, quando se mudou para a nova base ao sul, em Retalhuleu. Nesse período, La Aurora viu a chegada dos Mustangs a partir de julho de 1954, dos primeiros jatos T-33 em janeiro de 1963 e dos A-37 Dragonflies na década de 1970, embora as fontes consultadas não especifiquem quais tipos de aeronaves estavam baseados ali em cada época.

No âmbito civil, um DC-8 da Panavias, subsidiária da Pan American, realizou o primeiro pouso de um jato comercial em 1959, após a extensão da pista, e um novo terminal, cuja construção começou em 1966, foi concluído em 1968 durante a presidência de Julio César Méndez Montenegro.

Desde a reorganização de 2003, criada pelo Acuerdo Gubernativo 312-2003 de 19 de maio de 2003, La Aurora tem sido a sede do Comando Aéreo Central "General José Víctor Mejía", cobrindo Guatemala, Baja Verapaz, sul de Alta Verapaz, Izabal, Zacapa, Jutiapa, Chiquimula, El Progreso, Chimaltenango, Sacatepéquez, Sololá, Totonicapán, a maior parte de Quiché e Huehuetenango. A Comandancia da FAG e a escola técnica de aviação militar estão no mesmo campo. O aeroporto civil ao seu redor foi ampliado no âmbito do Plano Nueva Aurora lançado em 14 de abril de 2005, e sua pista e pista de táxi foram reabilitadas em março de 2010.

Os eventos recentes na base mostram o que a força aérea representa atualmente: uma força de helicópteros e transporte com função de segurança. Em 15 de dezembro de 2023, no 102º aniversário, o presidente Alejandro Giammattei entregou um Bell 429 ao comandante, Juan Carlos Ponce Valdez, segundo a AGN. Em 29 de dezembro de 2024, a Infodefensa noticiou que um Bell 407GX, que havia decolado do Comando Aéreo Central para apoiar as forças de segurança, colidiu com linhas de transmissão de energia sobre o rio Chixoy, matando os dois pilotos. E no final de maio de 2026, um C-130 da Guarda Aérea Nacional do Arkansas pousou em La Aurora com equipamentos para a FAG, apresentado por ambos os governos como o retorno da cooperação após décadas de suspensão.

O show aéreo do 103º aniversário, em 8 de dezembro de 2024, também foi realizado nas instalações da FAG, com voos em formação e saltos de paraquedas, segundo a AGN; o local não foi divulgado, e presume-se que seja La Aurora, mas isso não está confirmado.