Военная авиация на базе Балыкесир началась во время Второй мировой войны. По данным агентства Anadolu (апрель 2024 г.), база была основана 22 июля 1942 года, когда 1-я разведывательная рота 5-го авиационного полка передислоцировалась из Чорлу во Фракии. Агентство сообщает, что подразделение было преобразовано в бригаду в 1951 году и, после поступления на вооружение учебно-тренировочного самолета Т-33, стало первой реактивной базой; свое нынешнее название, 9-я главная реактивная база (9'uncu Ana Jet Üs Komutanlığı), она получила в 1953 году.

В статье того же агентства 2013 года рассказывается история с точки зрения реактивной авиации, и в качестве года основания указывается 1951 год. В 1950 году ВВС решили приобрести реактивные самолеты, и 15 октября 1950 года восемь пилотов были отправлены в Соединенные Штаты для обучения управлению реактивными самолетами. Они вернулись 31 августа 1951 года, самолеты Т-33 базировались в Балыкесире, а 29 марта 1952 года прибыли восемь F-84G Thunderjet, первые реактивные истребители Турции. Эти две даты не столько противоречат друг другу, сколько отражают разные вещи: 1942 год для аэродромного подразделения, 1951 год для реактивной базы.

На сайте F-16.net добавлен более ранний слой информации, который не упоминается в отчетах Anadolu. Там указаны самолеты Filo № 191 и 192, сформированные в Балыкесире в 1947 году: первый с самолетами V-11, а второй с Hawker Hurricane Mk IIC. Оба самолета были переоборудованы в P-47D Thunderbolt в 1948 и 1949 годах и получили свои трехзначные номера в 1951 году. Это данные со специализированных сайтов, и они не подтверждены официальным турецким источником.

Старшей эскадрильей в Балыкесире является 191-я эскадрилья «Фило» с позывным «Кобра». Ее история представлена по-разному агентством Anadolu и сайтом F-16.net, и на сайте опубликованы обе версии. В отчете агентства за 2013 год эскадрилья была сформирована как 41-я авиагруппа (41. Tayyare Bölüğü) в Кютахье и последовательно передислоцировалась в Мерзифон, Эскишехир и Мюртед, прежде чем прибыть в Балыкесир в 1967 году. В 1956 году она перешла на F-86, получив позывной «Кугу» (Лебедь), а в 1964 году — на F-104, после чего стала называться «Кобра». В 1973 году она была переименована в 191-ю эскадрилью командования и получила F-16C/D в 1994 году.

На сайте F-16.net указано, что эскадрилья была сформирована в Балыкесире в 1947 году, эксплуатировала F-84G с 1952 года, F-84F с 1963 года, F-104G и F-104S Starfighter с 1969 по 1980 год и F-16 с 1990 года. Различия реальны: дата прибытия в Балыкесир (1947 или 1967 год), дата появления Starfighter (1964 или 1969 год) и дата переоборудования в F-16 (1990 или 1994 год). Данные Anadolu основаны на собственной версии турецких военных и используются здесь в качестве основного источника; ни одна из версий не была проверена по официальной истории подразделения.

Самая последняя глава истории эскадрильи зафиксирована только на сайте F-16.net: эскадрилья была расформирована после попытки государственного переворота 15 июля 2016 года, её самолёты перешли в состав 151-й эскадрильи «Фило», а в 2021 году она была вновь сформирована, что подтверждено её участием в учениях «Анатолийский орёл 2022». В отчёте агентства «Анадолу» от апреля 2024 года указано, что 191-я эскадрилья «Фило» находится на службе, выполняя задачи по обеспечению боевой готовности и борьбе с терроризмом. На сайте F-16.net эскадрилья использует самолёты Block 50 в многоцелевом режиме, для подавления противовоздушной обороны противника и нанесения ударов.

Вторая эскадрилья, 192-я эскадрилья "Фило Каплан" («Тигр»), имеет историю, охватывающую почти все западные истребители, на которых летала Турция. На сайте F-16.net указаны «Харрикейны» с 1947 года, P-47D с 1948 года, F-84G с 1952 года, F-84F с 1961 года, F-5A с 1970 года, F-104S Starfighter с 1976 года и F-104G с 1988 года, до переоборудования в F-16C/D блоков 40 и 50 в 1992 году. Ни одна из этих дат не была проверена по официальной истории подразделения.

Истребители F-16 из Балыкесира участвовали в операциях НАТО за рубежом. Согласно данным F-16.net, 192-я эскадрилья «Фило» была развернута в Геди на севере Италии на весь 1994 год для участия в операции «Дени Фейт» над Боснией и Герцеговиной, а затем снова с 22 декабря 1996 года по 31 декабря 1997 года для участия в операции «Преднамеренная охрана» в поддержку SFOR. 191-я эскадрилья «Фило» последовала за ней в Геди с 23 марта по 10 июня 1999 года для участия в операции «Союзная сила» против Сербии, которую агентство Anadolu называет операцией в Косово.

Статус эскадрильи оспаривается в источниках. Английская Википедия указывает, что 192-я эскадрилья «Фило» расформирована; F-16.net перечисляет её как действующую и сообщает о её участии в НАТО Tiger Meet 2023 года, где она получила награду за лучшую форму, а также о её самолётах на Teknofest в 2025 году. Более поздние даты делают F-16.net более актуальным источником, но официального заявления Турции о статусе эскадрильи не найдено, и здесь она рассматривается как действующая, но неподтвержденная.

Вторая функция Балыкесира — обучение. Пилоты ВВС Турции обучаются пилотированию в Чигли, недалеко от Измира, работая с самолетами SF-260D, KT-1T и T-38M; затем в Балыкесир прибывают те, кто отобран для полетов на истребителях. В отчете агентства Anadolu за апрель 2024 года, опубликованном ко Всемирному дню пилотов, описывается 193-я эскадрилья ’Фило», эскадрилья «Онджел» (Сапер), проводящая интенсивный восьмимесячный курс, в рамках которого выпускники, получившие квалификацию для полетов на реактивных самолетах, становятся пилотами F-16, в то время как 191-я эскадрилья «Фило» находится в состоянии боевой готовности.

193-я эскадрилья Фило — самая новая эскадрилья на базе. По данным F-16.net, она переняла традиции 153-й эскадрильи Фило в июле 2018 года и включает в себя истребители F-16C/D блоков 30 и 50. Командиром базы в апреле 2024 года был генерал-майор Джихангир Кемаль Юзчелик, который, по данным агентства, отметил Всемирный день пилота вместе с эскадрильями.

В репортаже агентства Anadolu за 2013 год рассказывается о пилотах, выходящих из этой системы подготовки. В нем представлен портрет первого лейтенанта Фарука Манты, пилота 191-й эскадрильи, три года служившего на F-16 и более двух лет в Балыкесире, налетавшего около 700 часов, из которых 450 — на F-16. В существовавшей тогда системе подготовки, как отмечает агентство, пилоты истребителей проходили подготовку на F-5 в Конье, прежде чем перейти к F-16. Манты сказал, что стал пилотом благодаря плакату, который увидел в средней школе, и назвал F-16 самым красивым самолетом в мире.

Агентство "Анадолу" возлагает на 9-ю основную авиабазу широкую зону ответственности: западное Черное море, Фракия, Мраморное море и Эгейское море. В своем отчете за 2024 год агентство называет ее крепостью Западной Анатолии (Batı Anadolu'nun kalesi). Эта база является одной из двух истребительных баз в провинции Балыкесир; другая находится в Бандырме на Мраморном море. Газета «Хюрриет» в 2009 году писала, что Балыкесир «является центром для турецких истребителей, которые часто вступают в бой с греческими военными самолетами в спорном воздушном пространстве над Эгейским морем»; турецкое и греческое правительства занимают противоположные официальные позиции по этому воздушному пространству.

В новостях отчетливо видна роль истребителей. 4 сентября 2016 года, согласно сообщению газеты Hürriyet Daily News, два F-16 взлетели с аэродрома Балыкесир, чтобы идентифицировать вертолет Bell 430, принадлежащий бизнесмену Али Агаоглу, который покинул остров Авша, не будучи обнаруженным диспетчерской службой; более поздние сообщения объясняли проблему плохим радиоприемом на малой высоте. 25 февраля 2016 года пара F-16 поднялась в воздух, следуя за неопознанным радиолокационным следом на болгарской границе, и один из них разбился, в результате чего погиб пилот.

Самая серьёзная потеря базы в Эгейском море произошла 8 октября 1996 года, когда двухместный F-16, взлетевший с Балыкесира для тренировок, разбился недалеко от Хиоса после столкновения с греческими Mirage 2000, в результате чего погиб капитан Наиль Эрдоган. Позиция Турции, изложенная в обвинительном заключении 2016 года, опубликованном газетой Hürriyet Daily News, заключается в том, что греческий пилот сбил самолёт; первоначально инцидент был зарегистрирован как воздушный бой и несчастный случай, а позже Министерство иностранных дел Греции предложило помощь в поисках. В прочитанных источниках не было найдено официального греческого отчета о столкновении, поэтому турецкое утверждение представлено как утверждение.

Взлетно-посадочная полоса используется совместно с гражданской авиацией. Управление государственных аэропортов указывает аэропорт Балыкесир Меркез (ICAO LTBF, IATA BZI) как гражданский и военный аэродром, работающий для гражданских рейсов с 1998 года, с терминалом площадью 6500 квадратных метров и только внутренними рейсами. На технической странице указана одна взлетно-посадочная полоса, 18L/36R, размером 2990 м на 45 м, с асфальтовым покрытием и высотой 340 футов; обозначения «левая» и «правая» указывают на параллельную военную взлетно-посадочную полосу, которая не указана в каталоге DHMİ.

DHMİ указывает, что аэропорт расположен в 4 км от центра города по координатам 39°37'10" с.ш., 27°55'34" в.д. На той же технической странице показан военный характер наземной планировки: несколько перронов и рулежная дорожка выполнены из бетона с классом огнестойкости PCN 110, что значительно превышает требования к гражданскому терминалу площадью 6500 квадратных метров, а сам аэропорт относится к пожарной категории 6. Независимая база данных OurAirports, используемая только для перекрестной проверки, указывает аэропорт как аэропорт Балыкесир и отмечает, что он также известен как авиабаза Балыкесир или центральный аэропорт Балыкесир.

Попытка государственного переворота 2016 года достигла Балыкесира. В статье для газеты Hürriyet Daily News Седат Эргин включил базу в Балыкесир в список тех, которые, наряду с Акинчи, Эркилетом, Инджирликом и Денизли-Чардаком, находились под контролем организаторов переворота в ночь на 15 июля и не подчинялись приказам Объединенного центра воздушных операций в Эскишехире. В ноябре 2016 года полиция задержала пилотов в восьми провинциях, в том числе в Балыкесире, по обвинению в связях с движением Гюлена, которое Анкара обвиняет в попытке переворота. Официальная информация о событиях на базе в ту ночь не была найдена и здесь не восстанавливается.