Авиабаза Королевских ВВС Уоттишем открылась 5 апреля 1939 года как база для средних бомбардировщиков, базировавшаяся в 107-й и 110-й эскадрильях и их самолетах Bristol Blenheim. 4 сентября 1939 года, через 29 часов после объявления войны, бомбардировщики с Уоттишема вылетели в рамках первой атаки Королевских ВВС в этой войне против немецких военных кораблей в Вильгельмсхафене.

Всё пошло не так. В истории 107-й эскадрильи, опубликованной в Википедии, говорится, что из пяти отправленных самолётов вернулся только один, и этот один всё ещё нёс бомбы, потому что не достиг цели. Один из самолётов Blenheim, N6189, пилотируемый лётчиком Гербертом Лайтоллером, врезался в крейсер «Эмден», причинив незначительные повреждения, но убив 11 членов экипажа и ранив около 30. Сержант Джордж Бут, штурман 107-й эскадрильи, сбитый в тот день, упоминается как первый британский военнопленный Второй мировой войны.

Эскадрильи, базировавшиеся в Бленхейме, оставались там до 1942 года, после чего в сентябре 1942 года база была передана в аренду Военно-воздушным силам США.

Под руководством американцев Уоттишем стал ремонтной базой, официально называвшейся Хитчем, которая, согласно Википедии, к 1944 году отвечала за техническое обслуживание всех американских истребителей в Великобритании. 479-я истребительная группа прибыла примерно 15 мая 1944 года с самолетами P-38 Lightning и совершила свой первый боевой вылет в конце того же месяца.

Группа перешла на использование истребителей P-51 Mustang в период с 10 сентября по 1 октября 1944 года. Она получила Почетную награду подразделения за уничтожение многочисленных самолетов на французских аэродромах 18 августа и 5 сентября, а также за воздушный бой под Мюнстером 26 сентября 1944 года. Ее вторым командиром был полковник Юбер ‘Хаб’ Земке, на счету которого 17,75 воздушных побед, а одним из пилотов был майор Робин Олдс, на счету которого 12 сбитых немецких самолетов и 11,5 уничтоженных на земле.

Группа покинула страну примерно 23 ноября 1945 года, а Королевские ВВС вернулись в 1946 году.

В период холодной войны Уоттишем находился на передовой линии противовоздушной обороны Великобритании, поддерживая истребители в состоянии готовности к быстрому реагированию поочередно с другими базами. 257-я и 263-я эскадрильи летали здесь на истребителях Hunter с 1954 по 1956 год. 111-я эскадрилья прибыла 18 июня 1958 года вместе с истребителями Hunter из Black Arrows, ведущей пилотажной группы Королевских ВВС до 1961 года, чей мировой рекордный полет в строю из 22 истребителей Hunter был установлен в Фарнборо в 1958 году. Эскадрилья перешла на использование истребителей English Electric Lightning и оставалась здесь до 30 сентября 1974 года; 29-я эскадрилья летала здесь на Lightning с 1967 по 1974 год, а 56-я эскадрилья — с 1975 по 1976 год.

Затем последовал «Фантом». 23-я эскадрилья летала на FGR2 с 25 февраля 1976 года по 30 марта 1983 года, а 56-я эскадрилья — с 9 июля 1976 года по 31 июля 1992 года. С 19 октября 1984 года 74-я эскадрилья летала на F-4J(UK), подержанных американских «Фантомах» ВМС, которые были единственными самолетами этой эскадрильи на вооружении Королевских ВВС. Подразделения зенитно-ракетных комплексов «Бладхаунд» 125-й и 85-й эскадрилий находились здесь с 1983 по 1991 год.

Окончание холодной войны положило конец эре истребительной авиации. 74-я эскадрилья покинула базу 1 октября 1992 года, а база ВВС Уоттишем была закрыта 31 октября 1992 года. История базы, представленная в Википедии и являющаяся источником этих дат, основана на печатных историях эскадрилий, таких как Джеффорд и Лейк.

В сентябре 1993 года станция перешла под контроль армии. Летом того же года из Зоста (Германия) прибыл 3-й авиационный десантный полк в составе 653-й, 662-й и 663-й эскадрилий, а 4-й полк, долгое время базировавшийся в Детмольде, последовал за ним позже, в 1990-х годах. В 2005 году эскадрильи начали переходить с вертолетов Lynx на Apache AH1, лицензионную версию AH-64D, и с 2006 года вертолеты Apache использовались в провинции Гильменд, Афганистан, в составе 16-й воздушно-десантной бригады; к апрелю 2014 года они налетали там 50 000 часов.

В 2011 году 656-я эскадрилья 4-го полка вывела свои вертолеты Apache в море. 4 июня она вылетела с авианосца HMS Ocean для нанесения удара по радиолокационной установке и контрольно-пропускному пункту недалеко от Бреги в Ливии, что, по словам министра обороны Лиама Фокса, стало первой оперативной миссией британских армейских вертолетов Apache в море. 15 апреля 2019 года 663-я эскадрилья 3-го полка покинула Уоттишем и отправилась на три месяца в Эстонию, это было первое развертывание вертолетов этого типа в этой стране.

С 2020 года вертолет AH-64E заменил AH1. К январю 2022 года на базе Ваттишем находилось 14 новых вертолетов, еще 36 должны были поступить; по данным Википедии, к февралю 2024 года в двух полках находилось 38 вертолетов, а AH1 был снят с вооружения в марте 2024 года. 6 марта 2025 года компания Defence Equipment and Support приняла 50-й и последний вертолет. До 2015 года на базе также базировалась эскадрилья B 22-й эскадрильи Королевских ВВС, оснащенная поисково-спасательными вертолетами Sea King, а по данным Википедии за 2018 год, в 3-м и 4-м полках служило 852 человека, а в 7-м батальоне авиационной поддержки Королевских инженерных войск — 429 человек.