كان المطار قاعدةً تابعةً لسلاح الجو الملكي البريطاني قبل وجود ماليزيا بفترة طويلة. تشير ويكيبيديا، نقلاً عن أسراب سلاح الجو الملكي البريطاني بقيادة جيفورد، إلى وجود قاذفات طوربيد من طراز فيكرز فيلدبيست التابعة للسرب رقم 36 في كوانتان من يوليو 1935 حتى ديسمبر 1941، وطائرات بلينهايم التابعة للسربين رقم 60 و62 هناك في عام 1941، وطائرات بوفورت التابعة للسرب رقم 100 في نهاية العام. عندما أنزل اليابانيون قواتهم في كوتا بهارو في 8 ديسمبر 1941، سحب السرب رقم 1 التابع لسلاح الجو الملكي الأسترالي طائراته من طراز هدسون إلى كوانتان في اليوم التالي.

لكن مكانة كوانتان في كتب التاريخ تعود إلى عملية إنزال لم تحدث قط. ففي تمام الساعة 00:50 من يوم 10 ديسمبر، تلقى الأدميرال توم فيليبس، الذي كان في عرض البحر على متن سفينتي "برينس أوف ويلز" و"ريبولس"، تقريرًا من رئيس أركانه في سنغافورة، الأدميرال آرثر باليسر، يفيد بإنزال ياباني في كوانتان. اتجه نحو الساحل دون الإشارة إلى نواياه؛ ولم تعثر المدمرة "إكسبرس" على شيء، وتبين أن "قوة الغزو" التي رُصدت في الساعة 05:15 كانت مجرد سفينة صيد تجرّ صنادل. ولم يُطلب أي غطاء جوي من المقاتلات فوق كوانتان.

عثرت قاذفات يابانية أرضية، كانت تبحث جنوبًا، على السفينتين في وقت لاحق من ذلك الصباح. غرقت السفينة "ريبولس" في الساعة 12:33 والسفينة "برينس أوف ويلز" في الساعة 13:18، على بعد حوالي 110 كيلومترات شرق كوانتان. تشير إحصائيات ويكيبيديا إلى مقتل 840 بريطانيًا مقابل تدمير 4 طائرات يابانية ومقتل 18 يابانيًا. لم يكن الالتفاف سببًا مباشرًا في غرق السفينتين، ولكنه جعلهما في متناول القاذفات.

أنشأت القوات الجوية الملكية الماليزية قاعدتها في كوانتان في 24 يونيو 1968، وفي وقت مبكر، وفقًا لموقع ويكيبيديا، انطلقت منها طائرات CL-41G تيبوان التابعة للسربين 3 و9. وشهدت القاعدة نموًا حقيقيًا مع ظهور طائرات سكاي هوك. في عام 1982، اشترت ماليزيا 80 هيكل طائرة مُجددة من طراز A-4C وA-4L من مخزونات الولايات المتحدة ضمن برنامج يُعرف باسم بيريستا؛ أعادت شركة غرومان بناء 40 منها وفقًا لمعيار خاص بماليزيا، وهو A-4PTM، بينما بقيت البقية في الولايات المتحدة كاحتياطيات وقطع غيار.

تم تسليم طائرات A-4PTM وTA-4PTM ذات المقعدين بين عامي 1984 و1985، وخدمت في السربين رقم 6 و9 في كوانتان. كان سجلها سيئًا: تشير ويكيبيديا إلى أنها عانت من مشاكل صيانة متكررة ومعدل حوادث مرتفع، يُعتقد أنه ساهم في تقصير عمرها التشغيلي. أُحيلت إلى التقاعد عام 1995 واستُبدلت بطائرات BAE Hawk؛ ويُشغّل السرب رقم 6 حاليًا طائرات Hawk من لابوان.

في عام ١٩٩٥، شهدت قاعدة كوانتان الجوية صفقةً غير متوقعة في تاريخ سلاح الجو الملكي الماليزي: طائرات ميغ-٢٩ روسية الصنع، وذلك لصالح قوة جوية مُدرَّبة من قِبَل دول الكومنولث. استلمت ماليزيا ١٦ طائرة ميغ-٢٩ إن أحادية المقعد، وهي النسخة التصديرية ٩.١٢ إس دي، بالإضافة إلى طائرتي تدريب ميغ-٢٩ يو بي، وألحقتها بالسرب رقم ١٩ "كوبرا" في كوانتان؛ كما تشير المقالة الأساسية في ويكيبيديا إلى وجود سرب رقم ١٧. ووفقًا لويكيبيديا، قدّمت طائرات الميغ التابعة للسرب عروضًا جوية تحت اسم فريق "سموكي بانديتس".

كانت صيانة هذه الطائرات مكلفة. فقدت طائرتان في حادثي تحطم منفصلين عامي 1998 و2004، وأُخرجت ست طائرات من الخدمة عام 2010 لخفض تكاليف الصيانة. أما الطائرات العشر المتبقية، فقد أُخرجت من الخدمة عام 2017، لتصبح طائرات سو-30 إم كيه إم في غونغ كيداك وطائرات هورنت في باتروورث هي المقاتلات الوحيدة في ماليزيا. ولا يظهر أي من السربين رقم 17 أو رقم 19 في القائمة الحالية للأسراب الجوية على البوابة الرسمية.

منذ عام ٢٠١٧، لم يعد في كوانتان سرب مقاتلات متمركز، لكنها لا تزال مطارًا قادرًا على استقبال الطائرات المقاتلة. تشير نشرة معلومات الطيران الماليزية إلى وجود مدرج واحد بطول ٢٧٤٣ مترًا، ١٨/٣٦، مزود بحواجز وكابلات إيقاف الطائرات العسكرية عند طرفيه، ويخضع لمراقبة الحركة الجوية التابعة لسلاح الجو الملكي الماليزي، ويُسمح بالتحليق الليلي فيه بتصريح، كما يُغلق مساره خلال صلاة الجمعة. ويذكر موقع ويكيبيديا أن مروحيات كاراكال EC725 التابعة للسرب رقم ١٠ تتمركز هنا.

أصبحت طائراتها النفاثة السريعة الآن زائرة. ففي 21 أغسطس/آب 2025، تحطمت طائرة من طراز إف/إيه-18 دي تابعة لسلاح الجو الملكي الماليزي بعد وقت قصير من إقلاعها من المطار، وذلك بسبب حريق في المحرك، وفقًا لموقع ويكيبيديا؛ وقد قفز الطياران بالمظلات. ولم يؤكد أي مصدر تم التواصل معه للحصول على هذه البيانات مكان تمركز طائرات إف إيه-50 إم المقاتلة الخفيفة الماليزية البالغ عددها 18 طائرة، والتي طُلبت في 23 مايو/أيار 2023.