Letiště předchází keňské letectvo o více než dvě desetiletí. Podle Wikipedie se 72. operační výcviková jednotka RAF zřizovala na základně RAF Nanyuki začátkem dubna 1942, poté, co se přesunula z Wadi Gazouza v Súdánu, a létala na letounech Bristol Blenheim, Martin Baltimore a Douglas Boston. Soubor Národního archivu, na který Wikipedie odkazuje, ukazuje, že RAF Nanyuki byla v letech 1953–54 použita k operacím proti Mau Mau.

Keňské letectvo zdědilo v roce 1964 po RAF svou hlavní základnu Eastleigh v Nairobi, ale Eastleigh byl příliš vysoko a jeho ranvej příliš krátká pro tryskáče: dokonce i RAF létalo se svými Huntery z Embakasi. Dne 25. února 1974 letectvo otevřelo leteckou základnu Nanyuki jako své hlavní stíhací letiště. Flotila Strikemasterů se tam přesunula v červnu 1974, šest Hawkerů Hunterů zakoupených v témže roce tam sídlilo a v roce 1978 dorazil Northrop F-5, jak uvádí Wikipedie. F-5 je od té doby keňským stíhacím letounem a Laikipia jeho domovem.

Pokus o převrat 1. srpna 1982 začal v Nairobi, ale část plánu závisela na Nanyuki. Podle Wikipedie vedl desátník Bramwel Injeni Njereman spiknutí s cílem bombardovat budovu státu a velitelství generální služby ze základny a donutil tři piloty – majora Davida Mutuu, kapitána Johna Mugwanju a kapitána Johna Barazu – pilotovat dva letouny F-5E Tiger a jeden Strikemaster. Piloti bomby shodili v lese Mount Kenya a vrátili se do Nanyuki.

Zpráva agentury UPI o Njeremanově vojenském soudu z 24. listopadu 1982 uvádí obžalobu: 27letý zbrojní technik nařídil připravit rakety k bombardování cílů v Nairobi, nechal je naložit do vojenských letadel, pod pohrůžkou zbraně donutil pilota létat bombardovací misi v cvičném letounu F-5 a vydal zbraně dalším mužům. Njereman uvedl, že se do armády nepřipojil dobrovolně, ale přijímal rozkazy od jiných. Byl odsouzen k trestu smrti; agentura UPI poznamenala, že jeho odsouzení zvýšilo počet vojáků odsouzených za pokus o převrat na 656. Po převratu byla základna přejmenována na leteckou základnu Laikipia.

Laikipia se stala školou letectva i jeho stíhací základnou. Dne 7. dubna 2022 zde prezident Uhuru Kenyatta uvedl do provozu Letecké centrum excelence keňských vzdušných sil, které podle defenceWebu mělo sloužit keňským obranným silám, dalším vládním agenturám, civilním společnostem a sousedním východoafrickým státům. Výcviková letka na základně létá s turbovrtulovými motory Grob G120TP – do září 2021 jich bylo v provozu devět – a také s pístovými G120A-K dodanými v roce 2013, které nahradily Bulldog.

Základnu využívají i zahraniční partneři. Server defenceWeb v roce 2020 informoval, že americké africké velitelství v roce 2015 zařadilo Laikipii mezi místa pro spolupráci v oblasti bezpečnosti s předem rozmístěným americkým vybavením, ale bez stálého amerického personálu. Ve dnech 20. až 24. srpna 2019 se v Laikipii sešlo přibližně 120 delegátů letectva z Keni, Spojených států, Burundi, Tanzanie a Ugandy v rámci partnerského letu amerických vzdušných sil v Africe, kde pracovali na záchraně personálu, pátrání a záchraně v boji a péči o zraněné.

Od roku 2016 se na základně nachází také velitelství výcvikové jednotky britské armády v Keni (BATUK). Britská organizace pro obrannou infrastrukturu (Defense Infrastructure Organization) v červenci 2016 popsala toto místo jako “bývalou stanici RAF – nyní základnu keňského letectva” a uvedla, že výstavba nového výcvikového velitelství s technickým a bytovým vybavením začala v dubnu 2016 na pozemku pronajatém přímo od keňského ministerstva obrany. Hodnota projektů přesahovala 40 milionů liber a jejich dokončení se očekávalo do jara 2018.

DIO uvedlo, že britská armáda cvičí na náhorní plošině Laikipia přibližně 10 000 vojáků ročně. Britská přítomnost je uspořádána na základě ubytovacího uspořádání na keňské základně: letadla na letištní dráze jsou keňská a britská zařízení slouží jako armádní výcvikové velitelství, nikoli jako letecká jednotka.

Dne 27. května 2026, podle zprávy Wikipedie s odvoláním na AP, Bílý dům oznámil, že Spojené státy staví zařízení na letecké základně Laikipia pro monitorování a karanténu Američanů vystavených ebole. Stanice Al Jazeera jej popsala jako jednotku s 50 lůžky na letecké základně v okrese Laikipia. Prezident William Ruto uvedl, že jej schválil na žádost prezidenta Donalda Trumpa a obhajoval jej jako v souladu s partnerstvím Keni s Washingtonem v oblasti zdravotnictví; ministr zdravotnictví Aden Duale jej označil za součást širšího úsilí o posílení reakce na mimořádné události.

Nejvyšší soud pozastavil plán 29. května a 2. června prodloužil svá nařízení a požadoval, aby vláda dohodu zveřejnila, a to po námitkách ze strany Katiba Institute, Právnické společnosti v Keni a odborů lékařů. Stovky lidí protestovaly 1. června v Nanyuki; agentura Reuters, citovaná Al Jazeerou, informovala o dvou zabitých střelnými zbraněmi s odvoláním na organizátora protestu a bezpečnostní zdroj. Wikipedie uvádí, že 9. června byl při dalších protestech zastřelen 17letý student a že 22. června Nejvyšší soud shledal Dualeho obviněným z pohrdání soudem za to, že povolil pokračování stavby; agentura Reuters 23. června informovala, že ministr uvedl, že stavba byla zastavena.