El aeródromo es anterior a la Fuerza Aérea de Kenia por más de dos décadas. Según Wikipedia, la Unidad de Entrenamiento Operacional n.º 72 de la RAF se estaba instalando en la base aérea de Nanyuki a principios de abril de 1942, tras haberse trasladado desde Wadi Gazouza en Sudán, y operaba con aviones Bristol Blenheim, Martin Baltimore y Douglas Boston. Un archivo de los Archivos Nacionales citado por Wikipedia muestra que la base aérea de Nanyuki se utilizó para operaciones contra los Mau Mau entre 1953 y 1954.

La Fuerza Aérea de Kenia heredó su base principal, Eastleigh en Nairobi, de la RAF en 1964, pero Eastleigh era demasiado alta y su pista demasiado corta para los aviones a reacción: incluso la RAF había operado sus Hunters desde Embakasi. El 25 de febrero de 1974, la fuerza aérea inauguró la Base Aérea de Nanyuki como su principal aeródromo para cazas. La flota de Strikemaster se trasladó allí en junio de 1974, los seis Hawker Hunter adquiridos ese año tuvieron su base allí, y en 1978 llegó el Northrop F-5, según Wikipedia. El F-5 ha sido el caza de Kenia, y Laikipia su base, desde entonces.

El intento de golpe de Estado del 1 de agosto de 1982 comenzó en Nairobi, pero parte del plan dependía de Nanyuki. Según Wikipedia, el cabo Bramwel Injeni Njereman lideró un complot para bombardear la Casa de Gobierno y el cuartel general de la Unidad de Servicios Generales desde la base, y obligó a tres pilotos —el mayor David Mutua, el capitán John Mugwanja y el capitán John Baraza— a volar dos F-5E Tiger y un Strikemaster. Los pilotos arrojaron las bombas en el bosque del Monte Kenia y regresaron a Nanyuki.

El informe de UPI sobre el consejo de guerra de Njereman, el 24 de noviembre de 1982, expone la versión de la fiscalía: que el técnico de armamento de 27 años ordenó la preparación de cohetes para bombardear objetivos en Nairobi, los hizo cargar en aviones militares, obligó a un piloto a punta de pistola a realizar una misión de bombardeo en un avión de entrenamiento F-5 y distribuyó armas a otros hombres. Njereman declaró que no se había alistado voluntariamente, sino que había recibido órdenes de otros. Fue condenado a muerte; UPI señaló que su condena elevó a 656 el número de militares condenados por el intento de golpe de Estado. Tras el golpe, la base pasó a llamarse Base Aérea de Laikipia.

Laikipia se ha convertido en la escuela de la fuerza aérea, además de su base de cazas. El 7 de abril de 2022, el presidente Uhuru Kenyatta inauguró el Centro de Excelencia de Aviación de la Fuerza Aérea de Kenia, que, según DefenseWeb, prestaría servicio a las Fuerzas de Defensa de Kenia, otras agencias gubernamentales, empresas civiles y los estados vecinos de África Oriental. El Escuadrón de Entrenamiento de la base opera aviones turbohélice Grob G120TP —nueve de ellos estaban en servicio en septiembre de 2021— junto con los G120A-K de pistón entregados en 2013, que reemplazaron al Bulldog.

Los socios extranjeros también utilizan la base. DefenseWeb informó en 2020 que el Comando África de EE. UU. había incluido a Laikipia en 2015 como una ubicación de seguridad cooperativa, con equipo estadounidense preposicionado pero sin personal estadounidense permanente. Del 20 al 24 de agosto de 2019, unos 120 delegados de las fuerzas aéreas de Kenia, Estados Unidos, Burundi, Tanzania y Uganda se reunieron en Laikipia para el Vuelo de Asociación Africana de las Fuerzas Aéreas de EE. UU. en África, trabajando en la recuperación de personal, búsqueda y rescate en combate y atención a las víctimas.

Desde 2016, la base también alberga el cuartel general de la Unidad de Entrenamiento del Ejército Británico en Kenia (BATUK). La Organización de Infraestructura de Defensa del Reino Unido describió el lugar en julio de 2016 como “una antigua base de la RAF, ahora una base de la Fuerza Aérea de Kenia” e indicó que la construcción de un nuevo cuartel general de entrenamiento con alojamiento técnico y residencial había comenzado en abril de 2016, en terrenos arrendados directamente al Departamento de Defensa de Kenia. Los proyectos tenían un valor superior a 40 millones de libras esterlinas y se esperaba que estuvieran terminados para la primavera de 2018.

La DIO afirmó que el Ejército británico entrenaba a unos 10.000 soldados al año en la meseta de Laikipia. La presencia británica se basa en un acuerdo de aprovisionamiento en una base keniana: los aviones en la pista de aterrizaje son kenianos y las instalaciones británicas son un cuartel general de entrenamiento del ejército, no una unidad aérea.

El 27 de mayo de 2026, según Wikipedia, que cita a AP, la Casa Blanca anunció que Estados Unidos estaba construyendo una instalación en la base aérea de Laikipia para monitorear y poner en cuarentena a los estadounidenses expuestos al ébola. Al Jazeera la describió como una unidad de 50 camas en una base de la fuerza aérea en el condado de Laikipia. El presidente William Ruto dijo que la había aprobado tras una solicitud del presidente Donald Trump y la defendió como coherente con los acuerdos de cooperación en materia de salud entre Kenia y Washington; el secretario del Gabinete de Salud, Aden Duale, la calificó como parte de un esfuerzo más amplio para fortalecer la respuesta ante emergencias.

El Tribunal Superior suspendió el plan el 29 de mayo y el 2 de junio prorrogó sus órdenes y exigió al gobierno que revelara el acuerdo, tras las impugnaciones del Instituto Katiba, la Sociedad de Abogados de Kenia y el sindicato de médicos. Cientos de personas protestaron en Nanyuki el 1 de junio; Reuters, citada por Al Jazeera, informó de dos personas muertas por disparos, según un organizador de la protesta y una fuente de seguridad. Wikipedia registra que un estudiante de 17 años murió a tiros en nuevas protestas el 9 de junio y que el 22 de junio el Tribunal Superior declaró a Duale en desacato por permitir que continuara la construcción; Reuters informó el 23 de junio que el ministro había declarado que la construcción se había detenido.