La historia soviética de Ayni es la parte más escasa de su relato. La Wikipedia en inglés solo menciona que sirvió como base militar soviética durante la Guerra Fría y que se deterioró tras la retirada de Afganistán en 1989; no se encontró información verificable sobre qué regimientos operaron desde allí ni cuándo abrió sus puertas, y esta página no hace conjeturas al respecto. Lo que sí se acepta es que, a finales de la década de 1990, según ThePrint, se encontraba en estado ruinoso.

El interés de la India surgió a raíz de la situación en Afganistán. Antes de 2001, Nueva Delhi apoyaba a la Alianza del Norte, contraria a los talibanes, y el diario indio Tribune informó en noviembre de 2003 que un acuerdo firmado durante la visita del primer ministro Atal Bihari Vajpayee preveía el despliegue de personal del ejército y la fuerza aérea indios en una base tayika, entonces llamada Farkhor. Según ThePrint, en 2021 el proyecto Ayni comenzó entre 2001 y 2002 bajo la dirección del ministro de Defensa George Fernandes, con el capitán de grupo Naseem Akhtar encargado de iniciar las obras y el Ministerio de Asuntos Exteriores costeándolas.

La obra fue de gran envergadura. La pista se amplió a 3200 m; se añadieron hangares, instalaciones de mantenimiento y repostaje de aeronaves; y un equipo de la Organización de Carreteras Fronterizas, al mando de un brigadier, se encargó de gran parte de la construcción. En su momento de mayor actividad, había unos 200 indios trabajando en el lugar, según ThePrint. Su primer comandante, una vez operativo, a finales de 2005, fue el capitán de grupo BS Dhanoa, quien posteriormente ascendió a mariscal del aire y jefe de la Fuerza Aérea India.

Cuando el gobierno tayiko declaró finalizada la renovación en septiembre de 2010, con un desfile militar y la visita del presidente, la pregunta que se hacían todos los periodistas era quién la usaría. RFE/RL informó que India había pagado 140.000 millones de dólares estadounidenses y que algunos expertos esperaban que India ganara el derecho a usarla, mientras que otros dudaban que Tayikistán pusiera en riesgo sus relaciones con Pakistán.

Según informes, Rusia fue la primera en la lista. De acuerdo con RFE/RL, los medios rusos informaron en agosto de 2008 que los presidentes Dmitry Medvedev y Emomali Rahmon habían acordado que Rusia desplegaría aviones Su-25 y helicópteros en Ayni; el portavoz del Ministerio de Defensa tayiko, Faridun Muhammadaliev, desestimó los informes por infundados. El subsecretario de Estado estadounidense, Robert Blake, negó que Washington quisiera acceso, y también se informó sobre una propuesta para trasladar aeronaves francesas desde el aeropuerto de Dushanbe hasta allí. La postura oficial era que Ayni pertenecía a la fuerza aérea y la defensa aérea tayikas.

La versión oficial y la práctica divergieron. Posteriormente, ThePrint describió el aeródromo como administrado conjuntamente por India y Tayikistán durante casi dos décadas, e informó sobre un despliegue temporal de cazas indios Su-30MKI, que Wikipedia fecha a partir de 2014. No se encontró ninguna declaración oficial india ni tayika que confirmara el despliegue de cazas en las fuentes consultadas.

La base demostró su valía para la India en una ocasión, y de forma notable. Cuando los talibanes tomaron Kabul en agosto de 2021, los C-17 y C-130J de la Fuerza Aérea India utilizaron Gissar como punto de escala para evitar la congestión en el aeropuerto de Kabul. Según ThePrint, un C-17 esperó allí la autorización estadounidense, el personal de la embajada fue evacuado el 17 de agosto y un C-130J transportó a 87 indios de Kabul a Tayikistán, con la participación también de aeronaves de Air India.

El mismo colapso eliminó la razón de ser de la base. El acuerdo bilateral expiró —en 2021, según una columna de ThePrint de octubre de 2025, y en 2022, según Wikipedia— y no se renovó. A finales de octubre de 2025, los medios indios informaron que la retirada se había completado. La columna de ThePrint, escrita por Swasti Rao, atribuyó la decisión de Tayikistán a la presión rusa y china sobre un “actor no regional”; el sitio web educativo indio Drishti IAS, en cambio, señaló el fin de las alianzas de la India con Afganistán. Ninguna de las explicaciones fue confirmada por los gobiernos de la India, Tayikistán, Rusia o China en las fuentes consultadas, y ninguna se adopta aquí.