Foggia werd gekozen vanwege het weer en het terrein. De Tavoliere is vlak, droog en groot, en in de herfst van 1943 maakten de geallieerden er een complex van vliegvelden van waaruit zware bommenwerpers doelen konden bereiken die buiten het bereik van Engeland lagen. Amendola was er een van, en het vliegveld raakte snel vol: de P-47 Thunderbolts van de 57th Fighter Group vanaf 27 oktober 1943, de B-25 Mitchells van de 321st Bombardment Group vanaf 20 november, en vanaf 16 januari 1944 de B-17's van de 97th Bombardment Group, die er tot oktober 1945 bleven.

De 97e had een bijzondere staat van dienst. Op 17 augustus 1942 opende het squadron de Amerikaanse strategische bombardementscampagne in Europa, toen de B-17's de rangeerterreinen van Rouen bombardeerden tijdens de eerste zware bommenwerpermissie van de Army Air Forces uit Engeland. Vanuit Amendola voerde het squadron de langeafstandsmissies uit waarvoor de Vijftiende Luchtmacht was opgericht, en het ontving onderscheidingen voor uitmuntende prestaties voor Steyr op 24 februari 1944 en voor Ploiesti op 18 augustus 1944. De 2e Bombardementsgroep, die ook Amendola gebruikte, had op 1 mei 1945 al 412 missies gevlogen.

Ook de Britten waren hier. Wellington X'en van 330 Wing vlogen tussen februari en juli 1944 vanaf Amendola, en Liberators van 240 Wing van 4 juli 1944 tot 25 augustus 1945. Het vliegveld werd tevens een basis van de Balkan Air Force, de gemengde geallieerde formatie die Joegoslavische en Griekse partizanen bevoorraadde en ondersteunde, en waartoe ook vliegtuigen en bemanningen van de Italiaanse luchtmacht behoorden, die voor de kant vlogen die ze achttien maanden eerder nog hadden gebombardeerd.

De omvang van het geheel is nu gemakkelijk te onderschatten. Tijdens het laatste offensief van 9 tot 18 april 1945 zette de Vijftiende Luchtmacht 1.233 bommenwerpers in vanaf de vliegvelden van Foggia ter ondersteuning van het Amerikaanse Vijfde Leger en het Britse Achtste Leger dat oprukte naar Noord-Italië. De landingsbaan en de opstelplaatsen van Amendola werden gebouwd voor dat vliegverkeer, wat een belangrijke reden is waarom het vliegveld nu zo groot is.

Op 15 maart 1950 landden drie de Havilland Vampires op Amendola. Het waren de eerste straalvliegtuigen die de Aeronautica Militare ooit bezat, en de keuze voor dit vliegveld was eerder praktisch dan ceremonieel: Amendola was lang, ruim en had goed weer, en er was niemand in de buurt die over het lawaai zou klagen. North American F-86 Sabres volgden, en de kern van de ombouw ontwikkelde zich tot de geavanceerde straaljagerschool van de luchtmacht.

De volgende veertig jaar was Amendola de plek waar Italiaanse gevechtspiloten leerden snel te vliegen. De school vloog onder andere met de Fiat G.91T en werd in 1986 gereorganiseerd tot de 60e Brigade van de Luchtmacht. Het is een periode die vaak overgeslagen wordt, omdat trainingsbases geen krantenkoppen halen, maar een generatie Starfighter- en Tornado-bemanningen passeerde deze landingsbaan voordat ze ergens anders heen gingen.

De school sloot haar deuren op 1 juli 1993. Het 32e Stormo, dat in september 1967 in Brindisi-Casale was heropgericht en eerst met de Fiat G.91R en later de G.91Y vloog, verhuisde met het 13e Gruppo naar Amendola, nam de twee vliegende squadrons van de brigade over en ontbond deze. Amendola hield op een school te zijn en werd een operationele basis, wat het sindsdien is gebleven.

De ombouw volgde direct. De G.91Y werd in 1995 buiten dienst gesteld en de eenheid werd omgebouwd tot de AMX, het kleine Italiaans-Braziliaanse aanvalsvliegtuig; de 101° Gruppo werd op 31 juli 1995 de operationele ombouweenheid. Gedurende de gehele Italiaanse carrière van het type vloog de AMX-vloot ongeveer 240.000 uur, waarvan zo'n 18.500 operationeel, voordat de laatste vier toestellen in april 2024 vanuit Istrana werden uitgefaseerd.

De AMX was ontworpen als aanvalsvliegtuig voor een Europese oorlog die nooit uitbrak, en zijn eerste gevechtsmissie vond plaats in Kosovo. Tijdens de NAVO-operatie Allied Force in 1999 was de Italiaanse bijdrage, die onder de nationale naam Ghibli vloog, gestationeerd in Amendola, met negentien AMX'en op het platform en ongeveer tien die te allen tijde paraat stonden.

De vliegtuigen kwamen van de 13e, 14e, 103e en 132e Gruppi, met piloten afkomstig van de omscholingseenheid van de 101e Gruppo in Amendola. De 13e Gruppo, onder commando van luitenant-kolonel Gustavo Cicconardi, voerde het grootste deel van de vluchten uit. De missies vonden meestal overdag plaats, met ongeveer twee sorties per dag per bemanning, waarbij luchtsteun werd verleend en offensieve aanvallen werden uitgevoerd met Opher infraroodgeleide bommen, Mk 82-raketten en, later in de campagne, GBU-16 lasergeleide bommen.

De Italiaanse AMX vloog 252 missies tijdens de Kosovo-campagne. Waar het toestel goed in was, was het minder glamoureuze aspect: het was nauwkeurig, goedkoop in gebruik en kon lang genoeg boven een doelgebied blijven. Een Italiaanse piloot vertelde later dat een Amerikaan hem had gezegd: "We hebben alleen AMX'en en A-10's nodig om deze oorlog te winnen" – een compliment over het uithoudingsvermogen en de laadcapaciteit, niet over de prestaties.

Afghanistan was de langste oorlog waarin dit toesteltype actief was. Tussen 2009 en 2014 vloog de Italiaanse AMX bijna 10.000 uur tijdens zo'n 3.000 missies, voornamelijk verkennings- en bewapende bewakingsmissies. Het type werd ook ingezet boven Libië in 2011 en in de vanuit Koeweit opgezette strijd tegen IS in 2016. De vloot beëindigde haar carrière in Istrana, maar Amendola is de plaats waar het toestel voor het eerst in een oorlog werd ingezet.

Italië kocht in 2002 zes General Atomics Predators. Deze werden vanaf 2004 geleverd, in januari 2005 in gebruik genomen en vanaf Amendola gevlogen door een op 1 maart 2002 opgerichte groep voor onbemande vliegtuigen, die op 1 februari 2005 de naam en tradities van de 28° Gruppo overnam. Op dat moment beschikte vrijwel niemand in Europa, met uitzondering van het Verenigd Koninkrijk, over een bewapend, middelhoogvliegend gevechtsvliegtuig.

Het squadron werd vrijwel direct operationeel. Italiaanse Predators vlogen boven Irak tijdens Operatie Antica Babilonia vanaf 2005, boven Afghanistan vanaf 2007 – waar ze tegen het einde van dat jaar meer dan 6000 vlieguren hadden gemaakt – boven Kosovo en boven Libië tijdens Operatie Unified Protector in 2011. De grotere MQ-9 Reaper, in Italiaanse dienst Predator B genoemd, arriveerde vanaf 2010 en sinds 2014 is er een detachement gestationeerd op Ali Al Salem in Koeweit.

De politieke ontwikkelingen verliepen trager dan de vliegactiviteiten. De Italiaanse Reapers opereerden jarenlang onbewapend, terwijl de kwestie van bewapening tussen Rome en Washington werd besproken; de twee extra MQ-1C ER-toestellen die op 22 december 2015 werden geleverd, waren deels aangeschaft ter vervanging van een toestel dat in 2010 verloren was gegaan. De oorspronkelijke Predator-vloot werd uiteindelijk op 19 december 2022 uit de vaart genomen, waardoor de Reaper het enige toestel van het squadron werd.

Amendola zorgde ook voor de groei van de institutionele kant van de organisatie. Het Centro di Eccellenza APR, het expertisecentrum voor onbemande vliegtuigen van de luchtmacht, was hier gevestigd tot het op 15 juni 2026 naar Frosinone verhuisde om de kern te vormen van het nieuwe 66° Stormo. Wat in Amendola achterblijft, is het operationele squadron, het onderdeel dat daadwerkelijk boven andere landen vliegt.

Op 12 december 2016 landden twee F-35A's op Amendola, werden geassembleerd in Cameri en naar de 13e Gruppo gevlogen. Geen enkele andere Europese basis beschikte over dit type toestel. Italië had zich al vroeg en fors aan het programma verbonden, had de enige assemblagelijn buiten de Verenigde Staten gebouwd en had besloten dat het eerste squadron naar de basis zou gaan met de langste ervaring in de introductie van nieuwe vliegtuigtypen.

De mijlpalen volgden elkaar snel op. Vanaf 1 maart 2018 begonnen de F-35A's bij te dragen aan de nationale luchtverdediging. Op 30 november 2018, tijdens de mediadag van de Tactical Leadership Programme-cursus 18-4 in Amendola, verklaarde de luchtmacht de initiële operationele capaciteit van het 13e Gruppo. Tien F-35A's waren geleverd; acht bevonden zich bij het squadron in Block 3F-uitvoering en twee stonden op Luke Air Force Base voor training. Daarmee werd Italië de eerste luchtmacht in Europa die een vijfde-generatie vliegtuig operationeel verklaarde.

Daarna volgden de uitzendingen. In oktober 2019 brachten zes F-35A's van Amendola drie weken door in Keflavik voor de IJslandse luchtbewakingsmissie van de NAVO. Het was de eerste keer dat een bondgenoot de F-35 voor NAVO-luchtbewaking had ingezet. Italië keerde in 2020 terug en opnieuw in 2022, toen het detachement eind april werd gecertificeerd voor 24-uurs inzet. Amendola is ook de locatie voor Falcon Strike, de multinationale oefening met de vijfde generatie gevechtsvliegtuigen; in juni 2021 vlogen Israëlische F-35I Adirs vanaf hier samen met Italiaanse, Amerikaanse en Britse vliegtuigen.

De komst van de F-35B leidde tot discussie. Italië bestelde 90 toestellen, 60 A's en 30 B's, en verdeelde de B's in vijftien delen over de luchtmacht en vijftien delen over de marine – een verdeling waar de marine niet blij mee was. De voormalige stafchef, admiraal Luigi Binelli Mantelli, betoogde publiekelijk in La Stampa dat de variant met korte start- en landingsbanen te duur was en op zee thuishoorde. De luchtmacht voerde als argument de landingsbanen aan: voor elke landingsbaan die bruikbaar is voor een conventioneel gevechtsvliegtuig, zijn er wellicht tien kortere banen die een STOVL-vliegtuig zou kunnen gebruiken. De eerste F-35B arriveerde op 22 februari 2020 in Amendola en op 1 juli 2025 werd de 101e Gruppo opnieuw geactiveerd voor dit type.