Эрнест Файлубаз, обладатель швейцарской пилотской лицензии № 1, совершил перелет из Авенша в Пайерн в сентябре 1910 года, а в 1921 году Конфедерация арендовала у города землю для строительства аэродрома. Армия открыла его в 1925 году, и во время Второй мировой войны он превратился в крупнейший военный аэродром на швейцарском плато. Поскольку Пайерн находился за пределами Альпийского Редюита, он никогда не был базой в пещерах; его защита обеспечивалась укрепленными укрытиями, рассредоточением и рулежной дорожкой, соединяющей его с автомагистралью А1, которая была построена как аварийная взлетно-посадочная полоса и снова использовалась для взлетов и посадок F/A-18 в июне 2024 года — это были первые подобные учения со времен холодной войны.

Первые истребители Hornet, выпускавшиеся по лицензии, поступили в Пайерн в 1997 году в составе 17-й истребительной эскадрильи, и с тех пор база является центром швейцарской истребительной авиации. 31 декабря 2020 года здесь на полную мощность была запущена 24-часовая служба воздушной полиции, в ходе которой два вооруженных F/A-18 находились в состоянии 15-минутной готовности круглосуточно. На базе работает более 500 человек, ежегодно проходят обучение 32 стажера, в 2019 году здесь проводились авиашоу Air04 и Air14, а также этап летных испытаний конкурса Air2030. Взлетно-посадочная полоса длиной 2,8 км используется совместно с гражданским швейцарским аэропарком Aeropole и компанией Solar Impulse.

В рамках структуры армии 2026 года 17-я и 18-я истребительные эскадрильи были объединены в новую 35-ю истребительную эскадрилью, которая станет первым подразделением, перешедшим на F-35A после поступления этих самолетов в середине 2028 года. В настоящее время ведется строительство нового комплекса технического обслуживания и укрытия для Lightning II, а в 2021 году компания RUAG перевела сюда ремонтную базу для F/A-18.