Ernest Failloubaz, titular de la licencia de piloto suiza número 1, voló de Avenches a Payerne en septiembre de 1910, y la Confederación arrendó terrenos a la ciudad en 1921 para construir un aeródromo. El ejército lo inauguró en 1925 y, durante la Segunda Guerra Mundial, se convirtió en el mayor aeródromo militar de la meseta suiza. Dado que Payerne se encontraba fuera del Réduit alpino, nunca fue una base subterránea; su protección provenía de refugios reforzados, zonas de dispersión y una calle de rodaje que conectaba con la autopista A1, construida como pista de emergencia y utilizada de nuevo para despegues y aterrizajes de F/A-18 en junio de 2024, el primer ejercicio de este tipo desde la Guerra Fría.

Payerne recibió los primeros Hornets fabricados bajo licencia en 1997 con el Escuadrón Aéreo 17 y desde entonces ha sido el centro de la aviación de combate suiza. El Servicio de Policía Aérea, que opera las 24 horas, alcanzó su plena capacidad el 31 de diciembre de 2020, con dos F/A-18 armados listos para despegar cada 15 minutos. La base emplea a más de 500 personas, forma a 32 aprendices al año, fue sede de los espectáculos aéreos Air04 y Air14 y de la fase de pruebas de vuelo de la competición Air2030 en 2019, y comparte su pista de 2,8 km con el parque aeroespacial civil Swiss Aeropole y Solar Impulse.

En el marco de la reorganización del ejército de 2026, los escuadrones aéreos 17 y 18 se fusionaron en el nuevo escuadrón aéreo 35, que será la primera unidad en equiparse con el F-35A cuando lleguen los aviones a partir de mediados de 2028. Se está construyendo un nuevo complejo de mantenimiento y refugio para el Lightning II, y RUAG trasladó aquí el mantenimiento de depósito del F/A-18.