Ernest Failloubaz, detentor da licença de piloto suíço nº 1, voou de Avenches para Payerne em setembro de 1910, e a Confederação arrendou terras da cidade em 1921 para construir um aeródromo. O exército o inaugurou em 1925, e durante a Segunda Guerra Mundial, ele se tornou o maior aeródromo militar do planalto suíço. Como Payerne ficava fora do Vale dos Alpes, nunca foi uma base subterrânea; sua proteção provinha de abrigos reforçados, dispersão e uma pista de táxi que ligava à autoestrada A1, construída como pista de emergência e usada novamente para decolagens e pousos de F/A-18 em junho de 2024, o primeiro exercício desse tipo desde a Guerra Fria.

Payerne recebeu os primeiros Hornets fabricados sob licença em 1997, pertencentes ao Fliegerstaffel 17, e desde então tem sido o centro da aviação de caça suíça. A Luftpolizeidienst, que opera 24 horas por dia, atingiu sua capacidade máxima em 31 de dezembro de 2020, com dois F/A-18 armados mantidos em prontidão de 15 minutos ininterruptamente. A base emprega mais de 500 pessoas, treina 32 aprendizes por ano, sediou os shows aéreos Air04 e Air14 e a fase de testes de voo da competição Air2030 em 2019, e compartilha sua pista de 2,8 km com o parque aeronáutico civil suíço Aeropole e o Solar Impulse.

De acordo com a organização do exército de 2026, os Fliegerstaffel 17 e 18 foram fundidos no novo Fliegerstaffel 35, que será a primeira unidade a se converter para o F-35A quando as aeronaves chegarem a partir de meados de 2028. Um novo complexo de manutenção e abrigo para o Lightning II está em construção, e a RUAG transferiu a manutenção de depósito do F/A-18 para cá em 2021.