Аэродром изначально назывался Ороку и был открыт в 1933 году на низменности к юго-западу от Нахи. Во время битвы за Окинаву он был захвачен американскими войсками, и 16 августа 1945 года здесь разместился американский авиабазовый склад, согласно английской Википедии. Под управлением США на Окинаве он стал авиабазой Наха, а с 1954 года — гражданским аэропортом острова.

На протяжении четверти века Наха была американской истребительной базой. В Википедии указано, что 51-я истребительная группа и 16-я истребительная эскадрилья базировались на F-80 с 1947 года, 4-я истребительная (всепогодная) эскадрилья — на P-61 и F-82, а с 1 августа 1954 года — 51-е истребительно-перехватное крыло, 16-я истребительно-перехватная эскадрилья которого летала на F-86, а затем на F-102 Delta Dagger до 31 мая 1971 года, когда контроль со стороны ВВС США прекратился.

Окинава вернулась под японское управление в 1972 году, и ВВС Японии последовали за американцами на эту территорию. Источники расходятся во мнениях относительно даты передачи самого военного аэродрома: в статье о авиабазе Наха указан 1979 год, в статье об аэропорте Наха — 1982 год. Обе статьи взяты из Википедии; ни одна из дат не была подтверждена на официальной странице, поэтому данные указывают на период пребывания ВВС Японии с 1972 года без указания даты передачи.

Первыми истребителями ВВС Японии на Окинаве были F-104J Starfighter; последнее подразделение F-104J на вооружении, 207-я эскадрилья, было расформировано в Нахе в 1986 году, согласно японской Википедии. Истребители F-4EJ Phantom 302-й эскадрильи прибыли из Титосэ 26 ноября 1985 года и более 23 лет находились в состоянии боевой готовности на Окинаве.

9 декабря 1987 года эти «Фантомы» вошли в историю. Советский бомбардировщик Ту-16 пересек японское воздушное пространство над Окинавой, и F-4EJ дважды произвели предупредительные выстрелы — первые предупредительные выстрелы, когда-либо произведенные Силами самообороны Японии, согласно описанию эскадрильи в английской Википедии.

13 марта 2009 года 302-я эскадрилья поменялась местами с 204-й эскадрильей с Хякури, оснащенной истребителями F-15, в результате чего Окинава получила «Орла». По мере роста активности Китая одной эскадрильи стало недостаточно: в январе 2016 года 304-я эскадрилья прибыла с Цуики, и они образовали 9-е авиационное крыло. В июле 2017 года само региональное командование было модернизировано: из Юго-западного объединенного авиационного дивизиона оно было преобразовано в Юго-западные силы противовоздушной обороны, согласно данным Сил самообороны Японии.

Объединенный штаб публикует данные о вылетах по регионам, и юго-западный регион лидирует по этому показателю уже десять лет. В 2025 финансовом году ВВС Японии совершили 595 вылетов по радиосвязи, что меньше пикового значения в 1168 вылетов в 2016 финансовом году; Юго-западные силы ПВО совершили 348 вылетов, против 165 на севере, 46 на западе и 36 в центре. Около 61 процента вылетов были совершены против китайских самолетов и 36 процентов против российских. В апреле-июне 2026 года общее число вылетов возросло до 181, 106 из них — с юго-запада, а доля китайских самолетов увеличилась примерно до 77 процентов.

Острова, на которые указывают эти цифры, являются предметом спора. 13 декабря 2012 года самолет китайского правительства вошел в воздушное пространство над островами Сенкаку, которые находятся под управлением Японии, что стало первым подобным нарушением со стороны китайского самолета с момента начала ведения статистики в 1958 году; согласно английской Википедии, Япония подняла в воздух восемь истребителей F-15 и самолет раннего предупреждения. Позиция Японии заключается в том, что территориальных споров не существует; на них претендуют как Китайская Народная Республика, которая называет острова Дяоюй, так и Китайская Республика на Тайване, которая называет их Тяоюйтай.

Объединенный штаб также фиксирует инциденты, которые повлияли на работу базы с тех пор. В декабре 2025 года китайский авианосец впервые совершил вылет к востоку от Окинавы, и его истребители J-15 обстреляли радаром истребители F-15 ВВС Японии; в том же месяце китайские и российские бомбардировщики совершили совместный полет из Восточно-Китайского моря между Окинавой и Мияко в Тихий океан. 27 июня 2026 года китайские бомбардировщики H-6 и российские Ту-95 совершили еще один длительный совместный полет.

Наха — это гражданско-военный аэропорт, и это заметно. На базе базируются 13 подразделений Сил самообороны Японии, представляющих все три рода войск, включая истребители F-15, T-4, самолеты раннего предупреждения E-2C и E-2D, спасательные вертолеты UH-60J, поисковые самолеты U-125A и вертолеты CH-47J. Вокруг них курсируют пассажирские самолеты одного из самых загруженных внутренних аэропортов Японии.

На протяжении десятилетий обе авиакомпании использовали одну общую взлетно-посадочную полосу. Вторая, длиной 2700 м и шириной 60 м, открылась в марте 2020 года, рядом с первоначальной полосой длиной 3000 м. Английская Википедия описывает, насколько тесной могла быть эта совместная эксплуатация: 3 июня 2015 года Boeing 737 авиакомпании All Nippon Airways прервал взлет из-за того, что перед ним пролетел вертолет ВВС Японии. Никто не пострадал.