База расположена на земле, когда-то называвшейся Потрерос Сан-Висенте, принадлежавшей семье Мартинес до тех пор, пока правительство не выкупило её в 1934 году за 280 000 боливаров, согласно испаноязычной Википедии, которая опирается на исторические труды Карабальо Гусмана, Паредеса и других авторов. Почти два десятилетия на этой территории ничего не строилось. Строительство началось в 1952 году со строительства диспетчерской вышки, во время наращивания военной мощи, финансируемого за счёт нефти, в годы правления Переса Хименеса, когда ВВС закупали свои первые реактивные самолёты у Великобритании и США.

9 декабря 1955 года, в честь 35-летия военно-воздушных сил, генерал Маркос Перес Хименес лично торжественно открыл базу, а подполковник Альберто Дельгадо Онтиверо стал её первым командиром. В испаноязычной Википедии зафиксировано изменение названия резолюцией А-57 от 2 декабря 1958 года, после гибели Переса Хименеса; прежнее название в проверенных источниках не указано. С 1962 года была создана промышленная зона для проведения тяжелых ремонтных работ, а в 1964 году — театр-часовня.

На протяжении этих десятилетий на базе базировалась основная часть реактивного и транспортного флота FAV: F-86 Sabre, бомбардировщики Canberra, Vampire и Venom, затем Canadair VF-5 и Mirage, а также транспортные самолеты C-47D, C-123B, C-130 и G.222. В 1980 году база была активирована как автономная и модернизирована, получив новую сеть связи, электрическую подстанцию и перестроенную диспетчерскую вышку, как раз к появлению F-16.

В 1981 году Венесуэла закупила у General Dynamics 24 новых F-16: 18 одноместных F-16A и шесть двухместных F-16B, отказавшись от предложенных Вашингтоном ранее F-16/79, которые были модернизированы. Как вспоминает Infodefensa, 16-я авиагруппа (Grupo Aéreo de Caza 16) была сформирована в Эль-Либертадоре 31 августа 1983 года, а первые шесть самолетов прибыли 16 ноября 1983 года. Министерство обороны говорит о 60 “первопроходцах”, которые ввели систему в строй, и до сих пор называет кризис в Венесуэльском заливе 1987 года с Колумбией, когда F-16 совершали низкие пролеты над корветом Кальдас, историческим событием в истории группы.

Упадок истребителей начался с политических интриг в Вашингтоне. Запланированное на 2005 год обновление в середине жизненного цикла с участием бельгийских и израильских компаний сорвалось под давлением США, а в мае 2006 года США запретили продажу оружия Венесуэле, что прекратило поставки запасных частей. Российские Су-30, базировавшиеся в Барселоне, стали передовыми истребителями; количество всё ещё пригодных к полетам F-16 на авиабазе Эль-Либертадор так и не было опубликовано.

Министерство обороны до сих пор чествует это подразделение. 31 августа 2026 года новый министр, главнокомандующий Густаво Гонсалес Лопес, отметил 43-ю годовщину группы в Эль-Либертадоре и назвал её копьём, выкованным для защиты родины. Её девиз — Tutor et Ultor, “защитник и мститель”.

Попытка государственного переворота в феврале 1992 года, возглавленная Уго Чавесом, была делом рук армии. Вторая попытка, 27 ноября 1992 года, частично возглавлялась офицерами ВВС, и в её основе лежала операция «Эль Либертадор». В испаноязычной Википедии сообщается, что утром с базы вылетели истребители OV-10 Bronco, пилотируемые офицерами повстанцев, для нанесения ударов по целям по всей стране; в англоязычной Википедии среди целей, подвергшихся бомбардировкам с самолетов повстанцев, упоминаются штаб-квартира DISIP в Хеликоиде, дворец Мирафлорес, полицейский участок и собственная база ВВС Ла-Карлота.

Пилоты F-16, лоялисты, взлетели и оказали сопротивление. Английская Википедия утверждает, что один из них сбил OV-10 над Баркисимето, а данные о потерянных самолетах повстанцев различаются в разных статьях Википедии: два OV-10 и один Tucano от F-16 и еще два Bronco от огня с земли в одной статье, четыре Bronco в другой. К середине дня повстанцы потеряли контроль над воздушным пространством и улетели в Икитос в Перу на двух C-130. Википедия сообщает о 172 погибших за день.

Сегодня венесуэльское государство называет 27 ноября “героическим подвигом”, а военно-воздушные силы ежегодно отмечают эту дату; правительство Карлоса Андреса Переса, против которого она была направлена, назвало это государственным переворотом. Оба описания приводятся здесь как собственные заявления партий.

В последнее время большая часть новостей El Libertador посвящена возвращению самолетов после длительных простоев. 20 апреля 2026 года Infodefensa сообщила, что F-16B с серийным номером 9583 вернулся на взлетно-посадочную полосу после 15 лет и 10 месяцев простоя, отремонтированный собственными техниками ВВС; на церемонии присутствовал командующий генерал, генерал-майор Ройман Эрнандес Брисеньо.

Два месяца спустя, 10 июня 2026 года, Infodefensa сообщила, что один самолет Shaanxi Y-8F-200W был возвращен в строй службой технического обслуживания ВВС и эскадрильей технического обслуживания 6-й транспортной авиационной группы в присутствии министра обороны. Венесуэла закупила восемь самолетов Y-8 в марте 2011 года; первые два прибыли в ноябре 2012 года, а тренажер был открыт в марте 2014 года. Infodefensa утверждает, что все восемь принадлежат транспортной группе в Эль-Либертадоре; сколько самолетов находится в эксплуатации, не публикуется.