Donanma 1950'lerde hava kuvvetlerini yeniden kurduğunda, bunları yerleştirecek bir yer bulamamıştı. Deniz Havacılığı Müdürlüğü 4 Ağustos 1952'de yasa ile yeniden oluşturuldu ve CIAAN'a dönüşen hava eğitim merkezi, 27 Mayıs 1955 tarihli 37.398 sayılı Kararname ile Rio de Janeiro'nun merkezinde kuruldu. Portekizce Wikipedia'ya göre, ilk helikopterleri Avenida Brasil'in 11. kilometresindeki bir helikopter pistinden kalkmıştı.

6 Aralık 1960'ta hizmete giren ve 1961'den itibaren Brezilya'da bulunan Minas Gerais uçak gemisinin gelişi, gerçek bir havaalanına ihtiyaç duyulmasını gerektirdi. Donanmanın CIAAN'ın kendi tarihçesi, üssün São Pedro da Aldeia'ya taşınmasını 23 Kasım 1961 olarak belirtirken, Portekizce Wikipedia'daki üs hakkındaki makale 1962 yılını veriyor. Rio'nun doğusundaki Araruama lagününde ve Arraial do Cabo ile Cabo Frio limanlarına yakın olan bu yer, Wikipedia'nın ifadesiyle, bir hava üssü için stratejik bir konum olarak seçildi.

Portekizce Vikipedi, Hava Üssü'nün resmi olarak 1966'da faaliyete geçtiğini ve Hava Kuvvetleri komutasının üsse taşınmasının 1971 yılında gerçekleştiğini, CIAAN'ın da aynı yıl bu üsse bağlandığını belirtiyor. O zamandan beri üs, Brezilya'nın deniz filolarının tek merkezi olmuştur; sadece dört bölge helikopter filosu Belém, Rio Grande, Ladário ve Manaus'ta konuşlanmıştır.

Yeni üs, 1950'lerin sonlarından 1965'e kadar süren bir anlaşmazlığın ön cephesiydi: Minas Gerais'in uçaklarını Deniz Kuvvetleri mi yoksa Hava Kuvvetleri mi uçurmalıydı? İngilizce Wikipedia'ya göre, 1963 boyunca Deniz Kuvvetleri, Hava Kuvvetlerinin onayı olmadan, 1. Eğitim Hava Filosu için altı adet Pilatus P-3 eğitim uçağı ve ikinci bir sabit kanatlı birlik için altı adet North American T-28 Trojan teslim aldı.

12 Haziran 1963'te Tribuna da Imprensa gazetesi, bir FAB uçağının São Pedro da Aldeia'daki deniz hava üssü üzerinde uçarken Deniz Kuvvetleri tarafından neredeyse makineli tüfekle vurulduğunu bildirdi. Başkan João Goulart deniz uçuşlarını askıya aldı. Eylül ayında Deniz Kuvvetleri Bakanı Sílvio Mota üssü ziyaret etti ve protesto amacıyla deniz havacılarının toplu kalkışı olan "Revoada" ile karşılandı; uçuş yasağı sona erdi. Portekizce Vikipedi'nin üs hakkındaki makalesi, olayı ve Revoada'yı bir yıl öncesine, 1962'ye yerleştiriyor; buradaki tarihler, gazete haberini kaynak gösteren İngilizce Vikipedi'yi takip ediyor.

Anlaşmazlık, Aralık 1964'te Rio Grande do Sul'daki Tramandaí'de doruk noktasına ulaştı; burada hava kuvvetleri askerleri, kalkış yapmasını engellemek için bir Donanma HU-1 helikopterine ateş açtı; Havacılık Bakanı Nelson Lavanère-Wanderley istifa etti. 26 Ocak 1965 tarihli 55.627 sayılı Kararname ile bu durum sona erdi: Donanma uçak gemisini ve helikopterlerini elinde tuttu, sabit kanatlı uçaklar FAB'a (Federal Hava Üssü) geçti ve São Pedro da Aldeia sonraki 33 yıl boyunca bir helikopter üssü oldu.

8 Nisan 1998 tarihli 2538 sayılı Kararname, Donanmaya sabit kanatlı uçaklarını geri verdi. Donanmanın VF-1 sayfasında, 30 Nisan 1998'de Kuveyt'ten 20 adet tek kişilik A-4KU ve üç adet çift kişilik TA-4KU Skyhawk uçağının satın alındığı kaydediliyor; bu uçaklar 5 Eylül 1998'de deniz yoluyla Porto do Forno'daki Arraial do Cabo'ya ulaştı ve üsse taşındı. Donanmanın başlangıçta Brezilya Hava Kuvvetleri, Arjantin Donanması ve ABD Donanması'nın yardımıyla eğitilmiş dokuz nitelikli pilotu vardı.

Skyhawk'ların güvertesi pek gelişmemişti. 2000-2001 yıllarında Minas Gerais'ten, daha sonra da uzun süre onarımda kalan São Paulo'dan uçuşlar gerçekleştirdiler; İngilizce Wikipedia'ya göre bu gemiden toplamda yaklaşık 600 kalkış yapıldı. Embraer, 14 Nisan 2009'da bu uçakları modernize etmekle görevlendirildi ve Portekizce Wikipedia'ya göre Nisan 2022'ye kadar beş AF-1B ve iki AF-1C teslim edildi.

Filo için en kötü gün, 26 Temmuz 2016'da, bir AF-1B'nin saldırı eğitimi sırasında Saquarema açıklarında denize düşmesiyle yaşandı; pilotu asla bulunamadı. Jetler uçmaya devam etti: Poder Naval, Mayıs 2024'te VF-1 uçaklarının USS George Washington'a yaklaşma tatbikatı yaptığını ve Mayıs 2025'te Fernando de Noronha açıklarında devriye gezdiğini bildirdi. Poder Naval tarafından Haziran 2026'da yayınlanan 12 Eylül 2022 tarihli bir ABD Donanması görüntüsü, diğerlerinin üste açıkta depolandığını ve haleflerinin seçilmediğini gösteriyor.

Üs, ömrünün büyük bölümünde helikopter üssü olarak kullanılmıştır. Denizaltı karşıtı filo HS-1, 1970'ten itibaren Sea King helikopterleri kullanmıştır; 1996'da Minas Gerais gemisi, altı adet elden geçirilmiş eski ABD Donanması SH-3D helikopterini (SH-3B olarak yeniden adlandırıldılar) ve iki adet yedek helikopteri almak üzere Pensacola'ya gitmiş ve Poder Naval'e göre Haziran 1996'da São Pedro da Aldeia'ya ulaşmıştır. 2012'den itibaren yerlerine Sikorsky SH-16 Seahawk helikopterleri geçmiştir.

Üs, Deniz Kuvvetlerini insansız hava araçları alanına da taşıdı. 1. Uzaktan Kumandalı Uçak Filosu (QE-1), 27 Haziran'daki ilk fırlatmanın ardından 5 Temmuz 2022'de altı ScanEagle ile burada faaliyete geçti. 2025'ten itibaren HI-1, Jet Ranger'larının yerini almak üzere H125 (IH-18) eğitim uçaklarını almaya başladı ve 6 Aralık 2019'da üste bir deniz hava bakım grubu (GAerNavMan) kuruldu.