A história da aviação militar em Eskişehir começa com a escola de aviação. Após a Guerra da Independência, a jovem República reagrupou suas unidades aéreas dispersas e, em 1925, duas companhias aéreas foram transferidas para Eskişehir, onde a escola de aviação foi reorganizada, de acordo com a Enciclopédia Türkiye Maarif. O artigo da Academia da Força Aérea na Wikipédia em inglês data a mudança para 1926 e menciona o Capitão Muzaffer Göksenin como o primeiro diretor; as fontes divergem em um ano, portanto, o início mais preciso seria entre 1925 e 1926.

A escola formou a geração que construiu a força aérea da República. A partir de 1932, os regimentos aéreos passaram a ser tratados como uma força de combate independente e treinavam seu próprio pessoal. Eskişehir abrigava o 1º Regimento de Aviação, e foi lá que Sabiha Gökçen, filha adotiva de Atatürk, fez um curso especial de onze meses na Tayyare Mektebi em 1936-1937, seguido por seis meses de treinamento de piloto de guerra com o regimento.

Gökçen é celebrada na Turquia como a primeira mulher piloto militar. Sua trajetória, porém, tem um lado sombrio que não deve ser omitido: em 1937, ela participou das operações em Dersim, uma campanha na qual um grande número de civis foi morto e pela qual o Estado turco pediu desculpas em 2011. O dossiê da Força Aérea Turca contém esse histórico completo.

As escolas de Eskişehir foram incorporadas à Academia da Força Aérea, que iniciou suas atividades em 1º de outubro de 1951 com 58 cadetes (Enciclopédia Turca Maarif). Seus primeiros 56 graduados receberam suas patentes em 30 de agosto de 1953. Em 17 de setembro de 1954, a academia foi transferida para Izmir e, em 4 de julho de 1967, para Yeşilyurt, em Istambul. O papel de Eskişehir mudou, passando de formar pilotos para combater ao lado deles.

Quando a Turquia ingressou na OTAN em 1952, a modernização de sua força aérea acelerou e suas unidades de combate foram agrupadas em forças aéreas táticas numeradas. Eskişehir tornou-se o quartel-general da 1ª Força Aérea Tática, posteriormente o 1º Comando da Força Aérea; o próprio artigo da Wikipédia sobre a cidade descreve a base como o centro de comando do primeiro quartel-general da Força Aérea Tática da Turquia no flanco sul da OTAN durante a Guerra Fria.

A OTAN também manteve um Centro de Operações Aéreas Combinadas (CAOC 6) em Eskişehir. O CAOC 6 foi um dos centros regionais de controle aéreo da aliança até 2013, quando sua responsabilidade passou para o CAOC em Torrejón, na Espanha, como parte da reforma da estrutura de comando da OTAN. O centro nacional turco, conhecido pela sigla em turco BHHM (Birleştirilmiş Hava Harekât Merkezi, Centro de Operações Aéreas Combinadas), permaneceu em Eskişehir e continuou a desenvolver o panorama aéreo do espaço aéreo turco.

Em 2014, as antigas forças aéreas numeradas foram fundidas. O Comando de Força Aérea de Combate e Defesa Antimíssil foi formado em 5 de agosto de 2014 para reunir as unidades de combate sob um único quartel-general, localizado em Eskişehir. Os artigos da Wikipédia em inglês divergem quanto aos detalhes: um afirma que ambos os comandos já estavam em Eskişehir, outro que o quartel-general foi transferido de Diyarbakır para lá após a tentativa de golpe de 2016. O que não se discute é que a base hoje é o centro operacional da força aérea de combate turca.

Essa função explica por que o 1º Comando Principal da Base Aérea de Jatos é mais do que uma estação de voo. O aeródromo, o centro de operações e a equipe de comando funcionam no mesmo local. Na noite de 15 de julho de 2016, essa concentração foi crucial: foi nos radares da Base Aérea de Jatos de Eskişehir que voos não contabilizados e descontrolados começaram a aparecer um após o outro, como Sedat Ergin escreveu posteriormente no jornal Hürriyet.

O Phantom chegou primeiro a Eskişehir. A infraestrutura da 1ª Base Aérea Principal foi modernizada, e o primeiro par de F-4E pousou em 30 de agosto de 1974, Dia da Vitória, semanas após a intervenção turca no Chipre. Mais seis aeronaves chegaram naquele ano. Em 5 de fevereiro de 1975, os Estados Unidos suspenderam as entregas devido ao embargo de armas imposto ao Chipre; as aeronaves restantes do primeiro lote chegaram somente após o levantamento do embargo, de acordo com o Relatório da Unidade.

Seguiram-se outros lotes: 32 F-4E e oito RF-4E entre 1978 e 1979, aeronaves de segunda mão da USAF e da Guarda Nacional Aérea na década de 1980, mais 40 após a Guerra do Golfo e RF-4E da Luftwaffe alemã a partir de 1992. No auge, oito esquadrões turcos operavam o modelo, três deles em Eskişehir: 111, 112 e 113 Filo, sendo o último uma unidade de reconhecimento com o RF-4E.

As aeronaves ainda em operação são os F-4E 2020 Terminator. A Israel Aerospace Industries ganhou um contrato em agosto de 1995, estimado em 600 milhões de dólares, para modernizar 54 aeronaves; os trabalhos começaram em janeiro de 1997, 26 fuselagens foram modificadas em Israel e 28 na Turquia, e as primeiras entraram em serviço em 27 de janeiro de 2000, com os números de série 111 e 171. Em 2006, o centro de revisão da Força Aérea em Eskişehir e a ASELSAN modernizaram outros 16 F-4E no âmbito do projeto Şimşek (Relâmpago).

Os últimos anos do Phantom foram difíceis. Seis militares morreram em acidentes com Phantoms turcos entre 24 de fevereiro e 5 de março de 2015, dois deles em um F-4E que havia decolado de Eskişehir. O RF-4E foi retirado de serviço em 12 de março de 2015. Hoje, apenas o 111º Esquadrão de Caça e o 401º Esquadrão de Testes operam o F-4E 2020, ambos em Eskişehir; o Relatório da Unidade prevê que o modelo permanecerá em serviço até cerca de 2030, quando será substituído pelo KAAN, F-16 Block 70 ou Eurofighter Typhoon.

O 401º Esquadrão de Testes Filo, apelidado de Rüya (Sonho), é o esquadrão de testes e avaliação da Força Aérea. A Wikipédia em inglês descreve sua função como testar armas e munições produzidas e desenvolvidas localmente, e um documentário da CNN Türk exibido em junho de 2019 mostrou o esquadrão integrando e testando novos sistemas de armas nacionais em caças. O site F-16.net lista o esquadrão operando F-16C/Ds dos Blocos 30 e 40; o Unit Report afirma que ele também opera o F-4E 2020.

O trabalho mais bem documentado do esquadrão é o programa GÖKTUĞ do TÜBİTAK SAGE, que produziu os mísseis ar-ar de longo alcance guiados por radar GÖKDOĞAN e de curto alcance guiados por infravermelho BOZDOĞAN. Em setembro de 2020, o Ministério da Defesa Nacional informou que voos de teste estavam sendo conduzidos pelo 401º Esquadrão de Testes com o apoio do 101º Esquadrão de Reabastecimento Aéreo. O projeto teve início em 2013 e era destinado ao F-16.

Eskişehir também é uma cidade industrial voltada para a aviação. O artigo da Wikipédia sobre a cidade a descreve como o local da primeira indústria aeronáutica da Turquia, o Centro de Manutenção e Suprimentos Aeronáuticos, o depósito da força aérea que posteriormente realizou a modernização do Şimşek Phantom. Ao lado, encontra-se a TEI (TUSAŞ Engine Industries), fundada em 1985 pela TUSAŞ, GE Aerospace, Fundação das Forças Armadas Turcas e Associação Aeronáutica Turca.

A TEI entregou seus primeiros motores e peças de motores em 1987 e hoje conta com mais de 3.600 funcionários e mais de 485 milhões de dólares em exportações anuais, trabalhando em módulos de motores para programas civis como o LEAP e o GE9X. Sua sede fica no anel viário de Eskişehir, no distrito de Tepebaşı, de modo que a cidade que outrora formou os pilotos da Turquia agora também fabrica peças dos motores que eles utilizam em seus voos.

A tentativa de golpe de 15 de julho de 2016 foi travada em parte por via aérea, e Eskişehir ficou do lado do governo. Os conspiradores tomaram o Centro de Operações da Força Aérea em Ancara e controlaram Akıncı, Kayseri Erkilet, İncirlik, Balıkesir e Denizli-Çardak. O Centro de Operações Aéreas Combinadas em Eskişehir, escreveu o colunista do Hürriyet, Sedat Ergin, permaneceu em grande parte nas mãos de oficiais leais à Constituição e ao Comandante da Força Aérea, General Abidin Ünal.

O próprio Ünal não estava livre. Ele foi feito refém sob a mira de armas no casamento da filha do General Mehmet Şanver, comandante do comando aéreo de combate de Eskişehir, no lado asiático de Istambul. Soldados golpistas chegaram em cinco helicópteros, fizeram os convidados reféns e levaram os comandantes para a base de Akıncı em Ancara, o quartel-general da tentativa, informou o jornal Hürriyet Daily News em 18 de julho de 2016.

Segundo a reconstrução de Ergin, uma instrução foi ditada por telefone para Eskişehir às 23h51 e repassada a todas as unidades: o Centro de Operações da Força Aérea havia sido tomado e todas as ordens deveriam vir do Comandante da Força Aérea através do Centro de Operações de Eskişehir. Durante a noite, os dois centros lutaram pelo espaço aéreo turco, com Eskişehir recusando autorizações e tentando bloquear os pousos de aviões-tanque e de transporte dos conspiradores.

Ergin descreve os diálogos daquela noite como uma luta entre o centro de operações em Ancara e o de Eskişehir pelo controle do espaço aéreo turco, com Ancara se esforçando para colocar aeronaves no ar e Eskişehir tentando obstruí-las. Na reorganização que se seguiu à tentativa de golpe, o F-16.net registra que o 113º Esquadrão de Caça de Eskişehir assumiu as tradições do 142º Esquadrão de Caça de Akıncı, que havia sido dissolvido.

O centro de operações de Eskişehir também serviu à diplomacia. Quando o cessar-fogo na Síria, mediado pela Turquia e pela Rússia, entrou em vigor em 30 de dezembro de 2016, o jornal Hürriyet Daily News noticiou que a Turquia o monitoraria a partir de um centro na principal base aérea de Eskişehir, e a Rússia a partir de Hmeimim, na Síria. Uma linha direta ligava os dois. Grupos listados como terroristas pelo Conselho de Segurança da ONU, incluindo o Estado Islâmico (EI) e a Al-Nusra, foram excluídos.

A linha foi testada em poucas semanas. Em 9 de fevereiro de 2017, um ataque aéreo russo perto de al-Bab matou três soldados turcos e feriu 11. De acordo com a declaração turca citada pelo jornal Hürriyet Daily News, a base de Eskişehir, o centro de coordenação designado, identificou em 8 de fevereiro que um foguete havia sido lançado contra forças amigas. Em 17 de fevereiro, o jornal noticiou que a Turquia estava retransmitindo as coordenadas atualizadas de suas tropas através da linha direta Eskişehir-Hmeimim para evitar que o incidente se repetisse.

Em outubro de 2025, a base recebeu um tipo diferente de visitante. Como parte das medidas de fomento da confiança entre a Turquia e a Grécia, uma delegação da 111ª Ala de Combate da Força Aérea Helênica, sediada em Nea Anchialos, visitou a 1ª Base Aérea Principal de Jatos em Eskişehir nos dias 20 e 22 de outubro, conforme noticiado pelo jornal Hürriyet Daily News. Ambos os governos apresentam essas visitas como parte do degelo pós-2023; suas posições sobre as disputas no Mar Egeu, no entanto, permanecem inalteradas.