Quando a Aviação do Exército foi recriada em 3 de setembro de 1986, seu comando foi inicialmente estabelecido em Brasília. A Wikipédia, citando Falconi e Kuhlmann, registra que o quartel-general foi transferido para Taubaté em 1991 e que a escolha do local se deu justamente pela posição da cidade no que considera o núcleo central do país. O primeiro helicóptero havia sido entregue em 21 de abril de 1989.

A concentração se manteve. Os únicos batalhões diretamente subordinados ao comando, o 1º e o 2º, estão ambos aqui, juntamente com o Centro de Instrução de Aviação do Exército, o Batalhão de Manutenção e Suprimentos e a Base Aérea de Taubaté. O 3º Batalhão foi transferido gradualmente a partir de 2009 para Campo Grande, e o 4º surgiu de um destacamento em Manaus em 1992. Mesmo assim, Lucchesi e Leite, citados pela Wikipédia, constataram que cerca de 76% do efetivo da arma ainda estava em Taubaté em 2018.

O AIP brasileiro lista o aeródromo como Base de Aviação de Taubaté, um aeródromo militar administrado pelo Exército Brasileiro, localizado em 23°02'20"S 45°30'57"W e 580 m de altitude. Sua única pista, 08/26, tem 1.500 m de comprimento e 30 m de largura, é asfaltada, com a cabeceira da pista 08 deslocada em 400 m devido a obstáculos. Voos por instrumentos e voos visuais noturnos são reservados para aeronaves da Aviação do Exército. O AIP também indica uma posição de pátio fechada e um farol de aeródromo inoperante.

Uma pista de 1.500 m é suficiente para todos os helicópteros que o exército opera, mas não para aeronaves de transporte de qualquer porte, o que é necessário para um ramo das forças armadas que não possui aeronaves de asa fixa. Quando um decreto de 2 de junho de 2020 permitiu brevemente que o exército operasse aviões, com o C-23 Sherpa em vista, a autorização foi revogada dois dias depois. Ao lado da base fica o Aeroclube Regional de Taubaté, conforme observado pelo Poder Aéreo em 2012.

A frota de Taubaté conta a história da força. A tabela da Wikipédia de 2023 coloca 16 HA-1A Fennecs no centro de treinamento, 12 HA-1As e sete HM-4 Jaguars no 1º Batalhão, e 16 HM-1A Super Panteras e quatro HM-3 Cougars no 2º. Os Fennecs e Panteras, montados pela Helibras, foram modernizados sob contratos de 2009 e 2010 e redesignados em 2021. O Poder Aéreo noticiou em maio de 2017 que nove H225Ms haviam sido entregues ao exército, o primeiro deles ao 1º Batalhão.

A mais recente aquisição é o UH-60M. Os EUA aprovaram a compra de 12 unidades em 24 de maio de 2024, por 1.049.500 milhões de dólares, incluindo suporte, para substituir os quatro UH-60L em Manaus e os oito Cougars divididos entre Taubaté e Campo Grande. Vinte e dois militares foram treinados nos EUA em 2024. A primeira aeronave chegou no final de novembro de 2025 a bordo de um C-17A e foi formalmente apresentada ao Comando de Aviação do Exército em 15 de dezembro de 2025, segundo a Zona Militar. Doze H145M, fabricados pela Helibras, estão previstos para entrar em serviço a partir de 2028.

Taubaté é o berço da força aérea, mas a maior parte de sua história operacional ocorreu bem longe dali. Seu batismo de fogo, a Operação Traíra em 1991, levou helicópteros HA-1 e HM-1 daqui até a fronteira com a Colômbia, após guerrilheiros das FARC matarem três soldados em um posto do exército; alguns desses helicópteros nunca retornaram e, em 1992, integraram o destacamento da Amazônia em Manaus, o atual 4º Batalhão. Em 1997, quatro helicópteros foram enviados para a fronteira entre Equador e Peru com a Missão de Observação Militar, a primeira missão internacional da força aérea.

Desde então, o padrão tem sido o de transferir aeronaves de Taubaté para os comandos regionais: o 3º Batalhão para Campo Grande a partir de 2009 e dois Jaguars para Belém em 2022. Taubaté continua sendo o local onde as tripulações são treinadas e as aeronaves recebem manutenção. Helicópteros também já foram enviados da região para emergências no país — seis para as enchentes e deslizamentos de terra em São Paulo em 2023, segundo a Wikipédia. O patrono da força, o Tenente Ricardo Kirk, primeiro piloto do exército, morreu na Guerra Contestada em 1915, 71 anos antes da recriação da força.