Námořní letecká skupina Kanoya byla zformována 1. dubna 1936 a podle anglické Wikipedie byla nejstarší jednotkou středních bombardérů v Císařském námořnictvu. Její dvoumotorové letouny Mitsubishi G3M vstoupily do boje v srpnu 1937, na začátku druhé čínsko-japonské války, a podnikaly dálkové nálety na čínské cíle. V září 1941 byla skupina přezbrojena na bombardér G4M, který měl vést pozemní leteckou válku námořnictva přes Pacifik.

Kanoyovy bombardéry byly součástí pozemní úderné síly námořnictva v úvodních měsících války v Tichomoří. Jejich historie patří k válečné historii na stránce JASDF a do bojové sekce stránky této služby; tato základní stránka se zabývá tím, co se stalo u Kanoyi samotné.

Na jaře roku 1945 se Kanoya stala hlavní operační základnou pro organizované sebevražedné útoky námořnictva proti americké flotile u Okinawy, operace Kikusui. Japonská Wikipedie uvádí 828 letců speciálních útočných jednotek, kteří během okinawské kampaně odletěli z Kanoyi.

Toto číslo pochází z článku na japonské Wikipedii a nebylo ověřeno s oficiálním seznamem; celkové počty za celou kamikadze kampaň se liší podle zdroje a nejsou uvedeny. Po kapitulaci jednotky americké páté letecké armády držely základnu od 3. září 1945 do listopadu 1948.

Poválečné námořnictvo se do Kanoyi vrátilo brzy. Národní policejní rezerva zde zřídila posádku 1. prosince 1950 a zdroje uvádějí pro JMSDF tři data: 1. prosince 1953 pro první leteckou jednotku, 1. července 1954 pro kontrolu JMSDF a 21. listopadu 1955 pro úplný přesun. Rozdíl odráží spíše postupné předání než jednorázovou událost.

První letecké křídlo flotily poté létalo téměř na všech typech japonských hlídkových letounů. P2V-7 Neptune létaly do 27. února 1971, poté, co 23. dubna 1970 začaly přilétat P-2J. Sledovací letouny S2F-1 z 11. perutě létaly od roku 1973 do 30. března 1984. P-3C dorazily 10. července 1989 a druhá peruť, 7., byla zformována 1. prosince 1987 a létala na P-2J až do května 1994. V červenci 2019 byla 1. peruť převedena na Kawasaki P-1.

Letadla, která Kanoya létala během studené války, vyprávějí příběh o tom, jak Japonsko přestavělo námořní letectvo. První protilodní letouny byly americké seřazené modely: JMSDF obdrželo v roce 1957 z amerických zásob 60 letounů Grumman S2F-1 Tracker a létalo s nimi až do roku 1984 pod názvem Aotaka, modrý jestřáb. V Kanoyi se 11. peruť 1. března 1973 připojila k Fleet Air Wing 1 se sledovacími letouny a byla rozpuštěna, když byl tento typ 30. března 1984 vyřazen z provozu.

Lockheed P2V-7 Neptune byl prvním hlídkovým letounem křídla pro dlouhé dolety. Japonsko jej místo nákupu nového typu přestavět: Kawasaki vyměnila pístové motory za turbovrtulové a 21. července 1966 vzlétla s prvním P-2J, celkem jich vyrobila 83. Kanoyova 1. letka je začala přijímat 23. dubna 1970 a poslední P2V-7 opustil základnu 27. února 1971. P-2J postupně ustoupil licenčně vyrobenému P-3C z roku 1989 a Orion japonsky navrženému P-1 v roce 2019, takže za padesát let se hlídková letka Kanoyové změnila z použitých amerických letadel na letadla navržená v Japonsku.

Muzeum letecké základny Kanoya bylo otevřeno v prosinci 1973 a do nové budovy se přestěhovalo v červenci 1993. Japonská Wikipedie čítá asi 5 500 položek, mezi nimiž je Zero Type 52 restaurovaný ze dvou nalezených draků letadel, hydroplán Imperial Navy H8K a poválečné typy včetně P-2, HSS-2B, SNJ-5 a P-3C. Muzeum uchovává památku na speciální útočné jednotky vedle památky poválečného námořnictva.

Americká letadla se v posledních letech vrátila. V červenci 2018 americká námořní pěchota oznámila výcvik tankerů KC-130 v Kanoyi a japonská Wikipedie uvádí americké drony MQ-9 nasazené zde od roku 2022; jeden z nich přejel ranvej 22. srpna 2023.