El aeródromo comenzó siendo una base de mantenimiento francesa: en 1953, durante la guerra contra el Viet Minh, la Fuerza Aérea Francesa instaló aquí un centro de revisión para sus F8F Bearcat. El 1 de junio de 1955 se convirtió en una base de apoyo logístico para la nueva Fuerza Aérea de la República de Vietnam, con una única pista de aterrizaje de tablones de acero perforados de unos 1737 metros de longitud, según la Wikipedia en inglés.

La era estadounidense comenzó discretamente. En octubre y noviembre de 1961, llegó el destacamento de avanzada y posteriormente el Destacamento 9 del programa Farm Gate de la USAF, oficialmente para entrenar a tripulaciones survietnamitas; los primeros cuatro B-26 Invader llegaron a finales de diciembre. Para 1963, el destacamento volaba cuatro SC-47, cuatro B-26 y ocho T-28. El mismo mes en que llegaron los B-26, diciembre de 1961, la empresa contratista RMK-BRJ comenzó la construcción de una pista de hormigón apta para aviones a reacción, una inversión que determinó el futuro de la base.

El 5 de agosto de 1964, días después de los incidentes del Golfo de Tonkín, se ordenó el despliegue de 36 bombarderos B-57B Canberra desde la base aérea de Clark en Filipinas. La llegada fue desastrosa: uno se estrelló durante la aproximación y dos se salieron de la pista empapada por la lluvia. Tres meses después, el 1 de noviembre de 1964, artilleros del Viet Cong dispararon un bombardeo de mortero de 30 minutos contra los aviones estacionados, destruyendo cinco B-57, tres A-1H y un helicóptero HH-43, dañando otros 13 B-57 y causando la muerte de cuatro estadounidenses y dos vietnamitas.

El 19 de febrero de 1965, los B-57 realizaron lo que Wikipedia denomina la primera misión de bombardeo de combate de la USAF en la guerra, contra bases del Viet Cong. Tres meses después, se produjo el peor día en la historia de la base. El 16 de mayo de 1965, una bomba explotó accidentalmente en la pista de aterrizaje y desencadenó una reacción en cadena que destruyó diez B-57, dos A-1E y un F-8 de la Armada estadounidense, dañó 25 A-1 de la RVNAF, causó la muerte de 28 estadounidenses y seis vietnamitas, e hirió a más de 100. Entre los fallecidos se encontraba el mayor Robert G. Bell, quien en 1959 había sido uno de los 32 finalistas para el primer grupo de astronautas de la NASA.

Desde el 8 de noviembre de 1965, la 3.ª Ala de Caza Táctica fue la unidad anfitriona, y sus F-100D Super Sabre realizaron misiones de apoyo aéreo cercano en el sur hasta que el ala fue desactivada aquí el 15 de marzo de 1971. La base también puso a prueba nuevas ideas: en octubre de 1965, el 4503.er Escuadrón de Caza Táctico llevó el F-5A a la guerra bajo la evaluación Skoshi Tiger y realizó alrededor de 1500 salidas para finales de diciembre, perdiendo un avión por fuego antiaéreo.

Los ataques nunca cesaron. El 12 de mayo de 1967, 53 cohetes y más de 150 proyectiles de mortero y fusil sin retroceso dañaron o destruyeron 49 aeronaves estadounidenses y survietnamitas. Cuando comenzó la Ofensiva del Tet, el Viet Cong y las tropas del norte irrumpieron en el perímetro el 31 de enero de 1968 y los pilotos de F-100 realizaron un ataque aéreo controlado sobre su propio aeródromo. Wikipedia indica que las bajas estadounidenses fueron de cuatro muertos, uno fallecido por un ataque al corazón y 26 heridos, mientras que las de los atacantes fueron de 137 muertos y 25 capturados; un A-37 y un F-100 fueron destruidos y 17 aeronaves resultaron dañadas. El Smithsonian, que exhibe un F-100D de Biên Hòa en el Centro Udvar-Hazy, afirma que el ataque fue repelido en menos de un día.

El 15 de abril de 1975, un pelotón de zapadores del norte voló el depósito de municiones y cuatro cañones de 130 mm comenzaron a bombardear el aeródromo. El 30 de abril, los últimos defensores survietnamitas, los Rangers del 81.º Regimiento, marcharon hacia Saigón para rendirse, y el Ejército Popular de Vietnam tomó la base (Wikipedia en inglés). Vietnam denomina a este hecho la liberación del Sur; antiguos survietnamitas y numerosas fuentes occidentales lo llaman la caída de Saigón.

Actualmente, Biên Hòa es una base de Su-30MK2. El periódico del servicio describió al Regimiento 935 de la División 370 preparando una misión de entrenamiento en agosto de 2026 y afirmó que el regimiento había realizado más de 700 misiones desde enero, tanto de día como de noche, incluyendo entrenamiento de interceptación marítima. Su comandante declaró al periódico que el regimiento se centraba en la calidad del entrenamiento y la seguridad de vuelo. El 30 de abril de 2025, el desfile aéreo conmemorativo del 50.º aniversario de la reunificación —siete Su-30MK2, seis Yak-130 y diez helicópteros portando las banderas del Partido y la bandera nacional— despegó desde aquí.

Durante la guerra, el Agente Naranja se almacenó y manipuló en Biên Hòa, y el suelo y los cursos de agua de los alrededores quedaron gravemente contaminados con dioxinas. En 2019 se inició una limpieza que duraría diez años; Wikipedia indica que el compromiso de USAID en 2019 fue de 183 millones de dólares estadounidenses, y ProPublica informó en marzo de 2025 que los dos gobiernos habían acordado más de 430 millones de dólares estadounidenses desde 2019 y que se excavarían aproximadamente medio millón de metros cúbicos.

El proyecto estuvo a punto de paralizarse en 2025. ProPublica informó que las órdenes de suspensión de obras emitidas a finales de enero detuvieron los trabajos a mediados de febrero, que los contratos se cancelaron el 26 de febrero y se restablecieron aproximadamente una semana después, y que los contratistas trabajaban con personal mínimo. El 23 de septiembre de 2026, el Ministerio de Defensa Nacional de Vietnam y la Embajada de Estados Unidos firmaron nuevos acuerdos para el proyecto; el periódico del servicio informó que para mayo de 2026 se habían excavado 238.829 metros cúbicos de suelo y sedimentos, de los cuales 106.788 metros cúbicos con una concentración superior a 1.000 ppt de TEQ se sometieron a tratamiento térmico, y que se había confirmado que unas 41 hectáreas estaban libres de contaminación.