ワティシャム空軍基地は、1939年4月5日に第107飛行隊と第110飛行隊、そして彼らが運用するブリストル・ブレンハイム爆撃機のための基地として開設された。1939年9月4日、宣戦布告から29時間後、ワティシャム基地の爆撃機は、ヴィルヘルムスハーフェンに停泊するドイツ軍艦艇に対するイギリス空軍初の攻撃へと飛び立った。.

事態は悪化した。ウィキペディアの第107飛行隊の歴史によると、出撃した5機のうち帰還したのは1機だけで、その1機も目標を発見できなかったため爆弾を積んだままだった。ハーバート・ライトラー少尉が操縦するブレンハイム爆撃機N6189は巡洋艦エムデンに墜落し、軽微な損傷を与えたものの、乗員11名が死亡、約30名が負傷した。この日撃墜された第107飛行隊の航法士、ジョージ・ブース軍曹は、第二次世界大戦における最初のイギリス人捕虜とされている。.

ブレンハイム爆撃機部隊は1942年まで駐留し、その後、同基地は1942年9月にアメリカ陸軍航空隊に貸与された。.

アメリカ軍の支配下で、ワティシャムは整備基地となり、正式にはヒッチャムと呼ばれた。ウィキペディアによると、1944年までにイギリス国内のすべてのアメリカ製戦闘機の整備を担当していたという。第479戦闘航空群は1944年5月15日頃にP-38ライトニングを携えて到着し、同月後半に初出撃を行った。.

同部隊は1944年9月10日から10月1日の間にP-51マスタングに機種転換した。8月18日と9月5日にフランスの飛行場で多数の航空機を撃墜し、9月26日にはミュンスター近郊での空中戦で活躍した功績により、殊勲部隊章を授与された。同部隊の2代目指揮官はヒューバート・「ハブ」・ゼムケ大佐で、17.75機の撃墜記録を持ち、パイロットの1人はロビン・オールズ少佐で、ドイツ軍機12機を撃墜し、地上で11.5機を破壊した記録を持つ。.

一行は1945年11月23日頃に出発し、イギリス空軍は1946年に帰還した。.

ワティシャムは冷戦中、イギリスの防空の最前線に位置し、他の基地と交代で戦闘機を即応態勢で待機させていた。第257飛行隊と第263飛行隊は1954年から1956年までハンターを運用していた。第111飛行隊は1958年6月18日にブラックアローズのハンターと共に到着した。ブラックアローズは1961年までイギリス空軍の最高の曲技飛行チームであり、1958年にファーンバラで22機のハンターによる編隊ループの世界記録を飛行した。同飛行隊はイングリッシュ・エレクトリック・ライトニングに機種転換し、1974年9月30日まで駐留した。第29飛行隊は1967年から1974年まで、第56飛行隊は1975年から1976年までライトニングを運用していた。.

続いてファントムが導入された。第23飛行隊は1976年2月25日から1983年3月30日までFGR2を運用し、第56飛行隊は1976年7月9日から1992年7月31日までFGR2を運用した。1984年10月19日からは、第74飛行隊がF-4J(UK)を運用した。これは、RAFで同飛行隊のみが運用する中古の米海軍ファントムである。第25飛行隊と第85飛行隊のブラッドハウンド地対空ミサイル部隊は、1983年から1991年までここに駐留していた。.

冷戦の終結は戦闘機時代の終焉を告げた。第74飛行隊は1992年10月1日に退役し、ワティシャム空軍基地は1992年10月31日に閉鎖された。これらの日付の出典であるウィキペディアの基地史は、ジェフォードやレイクなどの飛行隊史の印刷物に基づいている。.

陸軍は1993年9月にこの基地を引き継いだ。その年の夏、ドイツのゾーストから第3陸軍航空連隊が第653、第662、第663飛行隊と共に到着し、長年デトモルトに拠点を置いていた第4連隊は1990年代後半に続いた。2005年、各飛行隊はリンクスからライセンス生産されたAH-64DであるアパッチAH1への機種転換を開始し、2006年からは第16空挺旅団と共にアフガニスタンのヘルマンドでアパッチが運用され、2014年4月までに同地での作戦で5万時間の飛行時間を記録した。.

2011年、第4連隊第656飛行隊はアパッチ攻撃機を海上に配備した。6月4日、同飛行隊はHMSオーシャンから出撃し、リビアのブレガ近郊のレーダー施設と検問所を攻撃した。当時の国防大臣リアム・フォックスはこの作戦を、イギリス陸軍のアパッチ攻撃機による初の海上作戦任務と呼んだ。2019年4月15日、第3連隊第663飛行隊はワティシャム基地を出発し、3ヶ月間エストニアに派遣された。これはアパッチ攻撃機にとってエストニアへの初の配備となった。.

AH-64Eは2020年からAH1に取って代わりました。2022年1月までにワティシャムには14機の新型機が配備され、さらに36機が配備予定でした。ウィキペディアによると、2024年2月までに38機が2つの連隊に配備され、AH1は2024年3月に退役しました。国防装備支援局は2025年3月6日に50機目となる最後の機体を受領しました。この基地には2015年まで捜索救助用のシーキングを装備したRAF第22飛行隊B飛行隊も駐屯しており、2018年のウィキペディアによると、第3連隊と第4連隊には852人、REME第7航空支援大隊には429人が所属していました。.