ウェヌアパイは、ニュージーランドが独立空軍を創設した1937年に建設が始まった2つの大規模基地のうちの1つでした。NZHistoryではオハケアと並んでウェヌアパイが挙げられており、英語版ウィキペディアでは格納庫は1939年にビッカース・ウェリントン爆撃機用に建設されたとされています。オハケアと同様、爆撃機は結局来ませんでした。1939年に乗組員と共にイギリスへ送られたのです。ウェヌアパイは代わりに戦時中の訓練および輸送基地となり、1943年6月1日にはダグラスC-47とロッキード・ロードスターを装備した第40輸送飛行隊が編成されました。.

戦後、空軍は民間航空と滑走路を共有した。ウィキペディアによると、ウェヌアパイは1945年から1965年までオークランドの国際空港であり、その後マンゲレの新空港に取って代わられた。1953年から1954年の王室ツアーでは儀礼的な立ち寄りがあり、公式の旅程には1953年12月28日の朝、ウェヌアパイ空軍基地で国旗が授与されたと記載されている。1964年6月、ビートルズはNZHistoryがオークランドのウェヌアパイ空港と呼ぶ場所に着陸し、警察は彼らを待ち構えていた300人のファンから遠ざけるように急いで防空ゲートを通らせた。.

1965年に基地は再編された。1963年に予備部品を含めて1350万米ドルで購入された最初の3機のC-130Hハーキュリーズは、1965年4月にウェヌアパイに到着し、7月にはニュージーランド軍をベトナムへ輸送していたと空軍博物館は記している。さらに2機が1969年1月に続いた。1965年10月27日、NZ7003はニュージーランド空軍機による初の南極飛行を行った。同年、第5飛行隊はフィジーのラウカラ湾からウェヌアパイへ移動し、P-3オリオンを運用し始めた。また、同基地は行政上ホブソンビルと統合され、ニュージーランド空軍オークランド基地となった。.

ハーキュリーズは60年間運用された。2025年1月31日に全機が退役した際、RNZは総飛行時間を15万5000時間、着陸回数を10万回と発表。4機はウッドボーン基地に、NZ7001はウィグラム空軍博物館に運ばれた。後継機は2024年に納入された5機のC-130J-30である。2025年8月、米空軍のC-5MスーパーギャラクシーがC-130Jシミュレーターの部品を積んでウェヌアパイ基地に着陸し、少なくとも150人の見物客が集まったとRNZは報じた。.

ウェヌアパイのオリオンとハーキュリーズは、海と氷上における空軍の長距離攻撃部隊だった。ウィキペディアによると、1979年11月28日にニュージーランド航空901便がエレバス山に衝突した後、第40飛行隊は11月29日から12月12日の間に遺体回収支援のため南極へ飛行した。NZHistoryの記録によると、遺体を乗せた最初の飛行隊は1979年12月6日にウェヌアパイに到着し、病理チームが12月11日に2回目の飛行隊が到着するまでに114体の遺体を検査し、最終的に257人の犠牲者のうち213人が特定された。.

1985年7月10日、グリーンピースの船レインボー・ウォーリア号がオークランド港で爆破され、写真家のフェルナンド・ペレイラが死亡した。7月25日、第5飛行隊のP-3KオリオンNZ4203がウェヌアパイから出撃し、警察が事情聴取を希望していたヨット「ウベア」を捜索した。空軍博物館の記録によると、乗組員は空の救命いかだを発見したが、ヨットは見つからず、その後フランスの潜水艦とのランデブーの後、自沈したとされている。1985年11月、2人のフランス人工作員に懲役10年の判決が下された。1986年、フランスは謝罪し、ハオ環礁への移送という合意に基づき賠償金を支払った。.

過去 10 年間でウェヌアパイ基地は縮小した。RNZ によると、オリオン機は 2023 年 1 月に退役し、第 5 飛行隊はオハケアの新しい P-8A 複合施設に移転し、約 250 人の人員も一緒に移った。ウィキペディアによると、メイン滑走路と誘導路の 14 兆 3,000 万の改修は 2012 年に完了したが、残りの敷地の大部分は老朽化している。2025 年 11 月、国防施設に 14 兆 25 億を発表した国防副大臣のクリス・ペンク氏は、ある空軍基地の格納庫の扉が開かず、作戦が中断したと述べた。RNZ はその基地をオークランド基地と特定した。.

残るのは空輸部隊で、第40飛行隊のC-130J-30と2機の757（政府は2028年から2機のエアバスA321XLRに置き換える予定）、そして第6飛行隊のシースプライト（MH-60Rの購入が完了すればMH-60Rに置き換えられる予定）である。ウィキペディアには、空軍の宇宙作戦部隊である第62飛行隊もウェヌアパイに所在すると記載されている。.