A Base Aérea de Anápolis foi construída para a defesa aérea de Brasília, que se tornou a capital em 1960. As versões em inglês e português da Wikipédia, baseadas na própria história da base, datam o início da construção em 9 de fevereiro de 1970 e o início das operações em 23 de agosto de 1972. Foi a primeira base brasileira construída para caças supersônicos e está situada em um planalto a mais de 1.100 metros de altitude, com uma pista principal de 3.300 metros de comprimento.

Os caças eram franceses. O Brasil comprou 16 Mirage IIIEBR monoposto e quatro IIIDBR biposto, entregues a partir de 1972 e designados F-103E e F-103D. Eles foram operados inicialmente pela 1ª Ala de Defesa Aérea, a 1ª ALADA, que foi desativada em 19 de abril de 1979 e substituída pelo 1º Grupo de Defesa Aérea, o 1º GDA, apelidado de Jaguar. Duas aeronaves ex-francesas chegaram em 1984 para compensar acidentes, e após 1989 a frota recebeu canards e aviônicos mais modernos.

Os Mirage III permaneceram em serviço até 2005. Foram substituídos por 12 Mirage 2000 usados, vindos da França, que a Força Aérea aposentou em dezembro de 2013, no mesmo mês em que o governo escolheu o Gripen. Entre o Mirage 2000 e o Gripen, os Jaguars voaram com F-5EM modernizados; no plano de aposentadoria de 2022, restava apenas um F-5M nos registros do esquadrão.

O Brasil encomendou 36 caças Gripen E/F em outubro de 2014, e Anápolis sempre seria sua base. Em julho de 2022, segundo manchetes do Poder Aéreo, foi inaugurada uma nova instalação para o 1º Grupo de Defesa Aérea e chegaram equipamentos de apoio e treinamento para os Gripen. Quatorze pilotos operacionais concluíram o treinamento de conversão na Suécia até novembro de 2023, de acordo com o Diário Oficial citado pelo Poder Aéreo, e todos eles serviram no 1º GDA.

O verdadeiro marco ocorreu em 24 de fevereiro de 2026, quando o Gripen iniciou o alerta de defesa aérea para o Planalto Central a partir de Anápolis. O Poder Aéreo contabilizou dez aeronaves na base e registrou os eventos anteriores: certificação para reabastecimento em voo atrás do KC-390, um disparo real do míssil de longo alcance Meteor e o primeiro disparo de canhão em território brasileiro. A proposta orçamentária de 2027, publicada em setembro de 2026, previa a entrega de 12 Gripens.

Em meados de 2026, seis F-39E do esquadrão Jaguar foram enviados para o exterior pela primeira vez, para o exercício multinacional Salitre, no deserto do Atacama, no Chile, juntamente com Argentina, Chile, Colômbia, Estados Unidos e Paraguai. Retornaram em 12 de julho de 2026, voando de Antofagasta para Anápolis, cerca de 2.382 km, em duas horas e cinquenta minutos.

Anápolis também abriga as aeronaves de maior alcance. O Esquadrão Guardião, o 2º Esquadrão do 6º Grupo de Aviação, está aqui desde 2000 com o jato de alerta aéreo antecipado E-99 e a aeronave de sensoriamento remoto R-99, ambos construídos pela Embraer sobre a estrutura do EMB 145. A Wikipédia portuguesa informa que os Learjets do esquadrão de reconhecimento de Carcará se juntaram a eles em 2017.

Em 4 de setembro de 2019, a Embraer entregou o primeiro KC-390 Millennium da Força Aérea Francesa em Anápolis, para o 1º Grupo de Transporte de Tropas. A Força Aérea tinha então um pedido de 28 aeronaves; o pedido foi posteriormente reduzido para 19. O avião-tanque de transporte reabasteceu os caças Gripen da base, e entregas posteriores foram feitas para o Galeão, no Rio de Janeiro.

A base também desempenha um papel civil em emergências. Em fevereiro de 2020, o governo a escolheu para colocar em quarentena 25 brasileiros e quatro parentes chineses trazidos de Wuhan em dois aviões Embraer VC-2, por um período de 14 a 21 dias.

Anápolis também tem sido uma parada importante na rota de entrada. Quando os três primeiros F-5B foram transferidos de Palmdale em março de 1975, a Poder Aéreo lembra que eles fizeram escala em Belém e Anápolis antes de pousar em Galeão em 12 de março. Em 2006, a base sediou o terceiro exercício multinacional CRUZEX, com a participação do Brasil, França, Venezuela e Argentina, segundo a Wikipédia em inglês; todas as edições posteriores foram realizadas em Natal. A base abre seus portões ao público em dias de visitação, o mais recente anunciado para 13 de setembro de 2026, com a presença do Gripen, do KC-390 e do Esquadrão de Fumaça.