База изначально была американским бомбардировочным аэродромом. Pacific Wrecks утверждает, что армия США построила аэродром Флоридабланка для бомбардировщиков ещё до войны; Википедия датирует его строительство серединой ноября 1941 года и отождествляет его с аэродромом Дель Кармен. Это отождествление не является確確ным: Pacific Wrecks отмечает, что на карте японской эпохи сентября 1944 года показан “Новый аэродром Дель Кармен”, и что Флоридабланка, возможно, была “Дель Кармен № 2”. Официальная история армии США ясно указывает на то, что 8 декабря 1941 года на Дель Кармен базировалась 34-я истребительная эскадрилья, а 10 декабря и 12 и 13 декабря аэродром подвергся бомбардировкам, к тому времени поля были усеяны обломками самолётов.

Японские войска заняли этот район в конце декабря 1941 года. Википедия утверждает, что аэродром был вспомогательным полигоном на аэродроме Кларк, где в 1944 году были разработаны планы операций камикадзе; Pacific Wrecks находит мало свидетельств интенсивного использования этого района японцами и сообщает о находке самолета Ki-44 на аэродроме, обнаруженного американцами после их возвращения в январе 1945 года.

Затем американцы расширили его для размещения тяжелых бомбардировщиков. С 16 апреля по 13 августа 1945 года 312-я бомбардировочная группа базировалась во Флоридабланке на самолетах A-20 и B-32 Dominator — единственном боевом подразделении, эксплуатировавшем B-32, — а 348-я истребительная группа находилась здесь с P-47 и P-51 с 15 мая по 12 июля 1945 года, согласно данным Pacific Wrecks. Самолет A-20G был уничтожен на земле в результате аварии при загрузке бомбы 3 июня 1945 года.

Молодая филиппинская авиация приняла этот аэродром в 1947 году: GlobalSecurity датирует передачу 2 мая, а Википедия утверждает, что операции начались 22 августа. 6-я и 7-я истребительные эскадрильи были сформированы 24 октября 1947 года с использованием поставленных США истребителей P-51D Mustang, которые участвовали в борьбе с повстанцами Хукбалахап до начала 1950-х годов; 8-я истребительная эскадрилья последовала за ней 1 августа 1951 года, а в 1952 году эти подразделения стали 5-м истребительным крылом. 20 апреля 1948 года база была переименована в честь Сесара Басы.

Истребители F-86F Sabre и T-33 появились в 1957 году, а 9-я тактическая истребительная эскадрилья, сформированная 14 декабря 1962 года, отправила свои Sabre в Конго для участия в мероприятиях Организации Объединенных Наций в феврале 1963 года. За ними последовал F-5A в середине 1960-х годов; GlobalSecurity указывает 1965 год, Википедия — 1964 год.

Баса также была родиной «Голубых бриллиантов». Второй лейтенант Хосе Ф.Л. Гонсалес сформировал команду из четырех пилотов на самолетах Mustang в 1952–1953 годах, которая в 1954 году получила название «Голубой бриллиант», а в 1960 году — «Голубые бриллианты». Согласно Википедии, они летали на пяти P-51D до 1959 года, восьми F-86F до 1968 года и двенадцати F-5 до 2005 года. В Википедии также упоминается гибель четырех пилотов в период с 1957 по 1962 год. Команда практически не действовала с 1975 по 1985 год во время энергетического кризиса и не летала с тех пор, как F-5 были сняты с вооружения.

Крупнейшая закупка истребителей правительством Маркоса пришлась на Басу в 1977–1978 годах: 25 модернизированных бывших истребителей F-8H Crusader ВМС США, самых мощных истребителей, которые когда-либо эксплуатировались ВВС Пакистана. По данным GlobalSecurity, в 1988 году они были окончательно выведены из эксплуатации из-за высоких затрат на техническое обслуживание.

Истребители F-5A с базы Баса всё ещё летали в декабре 1989 года. GlobalSecurity сообщает, что 1 декабря эскадрилья этих самолётов взлетела с базы Баса и обстреляла удерживаемую повстанцами авиабазу Санглей-Пойнт, а 2 декабря атаковала лагерь Агуинальдо. В Википедии майор Данило Атьенса назван пилотом-лоялистом, погибшим в ходе операции; GlobalSecurity утверждает, что его самолёт разбился.

Восемнадцать месяцев спустя произошло извержение вулкана Пинатубо, расположенного менее чем в 25 км от Кларка. Исследование Геологической службы США о последствиях извержения для авиации показало, что 15-20 см насыщенного водой пепла обрушили здания в Кларке и Басе, и что “эскадрилья из 11 устаревших истребителей F-5 ВВС Филиппин, находившихся на авиабазе Баса, была покрыта пеплом от извержения 15 июня”. Компания GlobalSecurity сообщает, что простаивающие F-8 также получили повреждения и были перевезены в Кларк для хранения и утилизации. Эксплуатация авиабаз Кларк и Баса возобновилась в ограниченном режиме в 1992 году. Истребители F-5 продолжали эксплуатироваться до сентября 2005 года, когда были сняты с вооружения без замены.

В течение десяти лет после 2005 года на базе Баса не было истребителей. Ситуация изменилась с появлением FA-50PH, лёгкой боевой версии корейского Т-50: первые два самолёта прибыли на Филиппины 28 ноября 2015 года, а Википедия датирует прибытие этого типа самолётов на базу Баса 2017 годом, когда были поставлены последние из двенадцати. Они почти сразу же отправились на войну. 26 января 2017 года самолёты FA-50 7-й тактической истребительной эскадрильи бомбили позиции боевиков в Бутиге, провинция Ланао-дель-Сур, это была их первая боевая вылазка, и они участвовали в осаде Марави с мая по октябрь.

База Баса также вновь стала американской базой, хотя и не официально. Это было одно из пяти мест, согласованных в рамках EDCA в марте 2016 года, и 30 января 2019 года здесь открылся первый объект EDCA в стране — склад гуманитарной помощи и ликвидации последствий стихийных бедствий. В марте 2023 года начались работы по реконструкции взлетно-посадочной полосы стоимостью 1,3 миллиарда филиппинских песо, которую Википедия называет крупнейшим проектом EDCA на сегодняшний день; она была завершена в ноябре 2023 года и позволяет базе принимать более крупные и тяжелые самолеты.

Китай выступил против соглашения. С тех пор ВВС Филиппин использовали Басу для размещения иностранных истребителей в рамках серии учений Cope Thunder: в апреле 2024 года, во время Cope Thunder 24-1, пилоты ВВС Филиппин и США провели инструктаж гражданских авиадиспетчеров на базе Баса по самолетам FA-50PH и F-16, согласно информации на сайте ВВС Филиппин. В июне 2025 года Филиппины заказали еще 12 самолетов FA-50, Block 70, с поставкой примерно к 2030 году.