Apiay'ın kökenleri ormana dayanmaktadır. İngilizce Wikipedia'ya göre, birlik 1933 yılında Peru ile savaştan sonra kurulan karakollardan biri olan San José del Guaviare'de bir hava üssü olarak kurulmuş ve Aralık 1947'de Villavicencio'dan 12 km uzaklıktaki Apiay köyüne taşınmıştır. İngilizce Wikipedia'nın özetlediği hizmetin kendi tarihi ise bunun nedenini şöyle açıklıyor: Şiddet olayları sırasında hava kuvvetlerinin doğu ovaları üzerindeki etki alanını genişletmesi gerekiyordu, bu nedenle 1947'de Apiay ulusal havaalanı kuruldu ve 17 Kasım 1948'de Apiay Hava Üssü olarak adlandırıldı.

Üs aşamalar halinde büyüdü. 1956'dan itibaren AT-6 Texan ve T-34 Mentor uçaklarında pilot eğitimi verdi, 1959'da B-26 Invader uçaklarıyla ana üs haline geldi, 1961'de Kaptan Luis Francisco Gómez Niño'nun adını aldı ve 1972'de 2. Muharebe Hava Komutanlığı'nın karargahı olduğunda ilk jetleri olan T-33 ve T-37'leri teslim aldı. İlk yıllarına ait üzücü bir tarih de var: İngilizce Wikipedia'ya göre, 8 Eylül 1969'da SATENA'ya ait bir C-47, FAC-685, üssün yakınlarında düştü ve uçaktaki 32 kişinin tamamı hayatını kaybetti.

Kolombiya, 234 milyon ABD doları karşılığında 25 adet Embraer Super Tucano satın aldı. İlk üçü 14 Aralık 2006'da Bogotá'ya, sonuncusu ise Haziran 2008'de geldi. 18 Ocak 2007'de Kolombiya Super Tucanoları, FARC mevzilerine Mk 82 bombalarıyla saldırarak bu türün ilk muharebe görevini gerçekleştirdi. Apiay'da, 212. Birliğin AT-27 Tucanoları ve 213. Birliğin savaş helikopterleri ve helikopterlerinin yanı sıra, 211. Muharebe Filosu 'Grifos'u donatıyorlar.

İngilizce Vikipedi'deki Super Tucano makalesi, "Armagedón Operasyonu" olarak adlandırdığı saldırıyı şöyle anlatıyor: Apiay'den kalkan dokuz Super Tucano uçağı, polis istihbaratı tarafından görevlendirilen bir muhbirin koordinatlarıyla Meta'daki Vista Hermosa'da bulunan FARC'ın 27. Cephesi kampına saldırdı, üç dakika içinde 40 adet 500 librelik güdümlü bomba attı ve 36 isyancıyı öldürdü. Makalede tarih belirtilmemiş ve kayıp sayısı resmi bir Kolombiya veya bağımsız kaynakla karşılaştırılmamıştır. Aynı makale, 22 Eylül 2010'da Meta'da düzenlenen Sodoma Operasyonu'nda 25 Super Tucano uçağının yedi ton patlayıcı attığını ve FARC komutanı Mono Jojoy'un öldürüldüğünü belirtiyor; ancak hangi üsten uçtukları belirtilmiyor.

Apiay çok çeşitli uçaklara ev sahipliği yapıyor. İngilizce ve İspanyolca Wikipedia'da dört ünite listeleniyor: A-29B Super Tucano ile Escuadrón de Combate 211 'Grifos', eski AT-27 Tucano ile 212 'Tucanos', AC-47T Fantasma savaş helikopterleri, AH-60L Arpía IV helikopterleri, C-212 ve Cessna 208 karışımı ile Escuadrón de Combate Táctico 213 nakliye araçları ve Schweizer ve Citation gözetleme uçakları ve yalnızca İspanyolca Vikipedi'de Elbit Hermes 450 ve Hermes 900 dronlarıyla birlikte Escuadrón 217 'Quimera'.

Üssün en eski uçak gövdeleri bu savaş helikopterlerinde bulunuyor. Infodefensa'ya göre, 1986'dan beri Kolombiya hizmetinde altı adet AC-47T bulunuyor; bunlar 1991'den itibaren Basler BT-67 turboprop motorlarıyla yeniden donatılmış, FLIR sensörleri, GAU-19A ağır makineli tüfekler ve gece yakın hava desteği için aydınlatma fişekleri ile donatılmış durumda. Filo numaraları yayınlanmış, ancak Apiay'deki uçak sayısı belirtilmemiştir; burada da verilmemiştir.

Anayasa Mahkemesi'nin listesine göre, Apiay, 30 Ekim 2009 tarihli ABD-Kolombiya savunma işbirliği anlaşmasının ABD personeline açtığı üç hava üssünden biriydi (diğerleri Palanquero ve Malambo). Mahkeme, 17 Ağustos 2010'da anlaşmanın özünde bir antlaşma olduğuna ve Kongre tarafından onaylanana kadar yürürlüğe giremeyeceğine karar verdi. Bununla birlikte, İngilizce Wikipedia, üssün, Kolombiya Planı çerçevesinde uyuşturucu kaçakçılığı ve silahlı gruplara karşı eğitim programlarına katılan ABD Ordusu personeline ev sahipliği yaptığını belirtiyor. Kontrol edilen kaynaklarda bu varlığın kapsamı ve tarihleri yayınlanmamış olup, burada da herhangi bir rakam verilmemiştir.