A aviação militar em Dęblin começou no antigo aeródromo austríaco junto à fortaleza onde o rio Wieprz encontra o Vístula. Em maio de 1920, durante a guerra com a União Soviética, uma escola de pilotos francesa funcionou ali por um curto período. A escola permanente surgiu mais tarde. A Escola de Aviação de Oficiais (Oficerska Szkoła Lotnictwa) foi fundada em Grudziądz em 5 de novembro de 1925, sob o comando do Coronel Roman Florer. Alguns relatos secundários indicam 1º de novembro. A escola mudou-se para Dęblin em 14 de abril de 1927, de modo que, segundo a própria escola, tudo o que era necessário para o treinamento de voo estivesse em um só lugar.

Os primeiros observadores concluíram o curso em 15 de setembro de 1927. A primeira cerimônia formal de comissionamento, em 15 de agosto de 1928, nomeou 77 graduados como segundos-tenentes. A turma incluía Zdzisław Krasnodębski, que mais tarde se tornaria o primeiro comandante do Esquadrão nº 303, e Walerian Jesionowski, que posteriormente se tornaria comandante do Esquadrão nº 308. Em 1928, a escola tornou-se a Szkoła Podchorążych Lotnictwa (Escola de Cadetes da Aviação). A partir de 6 de abril de 1929, passou a fazer parte de um centro maior para a formação de oficiais da aviação, com seu próprio esquadrão de treinamento e base aérea.

O primeiro curso para cadetes pilotos começou no outono de 1934 e foi exigente: dos 40 cadetes que iniciaram, 30 foram comissionados como pilotos em 1936. A partir de 1935, o curso passou a ter duração de três anos. Em 17 de julho de 1937, o centro tornou-se o Centro de Treinamento de Aviação nº 1 (Centrum Wyszkolenia Lotnictwa Nr 1). Possuía seis esquadrões de treinamento e podia abrigar 600 cadetes simultaneamente. Em junho de 1939, com a mobilização parcial da Polônia, os cadetes do terceiro ano concluíram o curso antecipadamente e foram diretamente para os esquadrões de combate.

O Instituto da Memória Nacional estima que o número de pilotos e observadores aéreos formados antes da guerra era de 973. Um léxico do patrimônio de Lublin indica mais de mil, e a diferença provavelmente se deve a quais cursos são contabilizados. Entre os ex-cadetes está Stanisław Skalski, o piloto de caça polonês com maior número de vitórias na Segunda Guerra Mundial.

A escola não foi pega de surpresa. Esquadrões de combate poloneses já haviam se deslocado para pistas de pouso improvisadas, e em 1º de setembro, os pilotos da Escola Superior de Pilotagem formaram um grupo de caças improvisado sob o comando do Capitão Stanisław Brzezina. A história da escola conta que o grupo possuía 27 caças PZL P.7a e que o Tenente Henryk Szczęsny abateu dois bombardeiros He 111 entre os dias 14 e 15 de setembro. Nessa altura, o grupo já havia se afastado de Dęblin.

O golpe mais duro veio em 2 de setembro. O historiador do IPN, Tomasz Osiński, descreve dezenas de bombardeiros Dornier por volta do meio-dia, seguidos algumas horas depois por um número semelhante de He 111, que destruíram gravemente os edifícios da escola. Um léxico de Lublin estima as baixas do dia em cerca de 40 mortos e feridos. Entre os mortos estavam o tenente Marian Odorowski, sargentos do centro de treinamento e aviadores checoslovacos que estavam na escola na época. O museu menciona três deles: Zdeněk Rous, Štěpán Kurka e Ondřej Šandor. O tenente-coronel Jerzy Bajan ficou gravemente ferido e perdeu o uso de um braço.

Em 6 de setembro, 46 aviões Heinkel atacaram a fortaleza, e o tenente-coronel Edward Błaszczyk, do 28º Regimento de Artilharia Leve, foi mortalmente ferido. Entre 2 e 9 de setembro, cadetes e funcionários foram transferidos em grupos para Końskowola. De lá, muitos seguiram pela Romênia e França até a Grã-Bretanha. As tropas alemãs entraram em Dęblin em 15 de setembro de 1939. A cidade só foi libertada em 26 de julho de 1944.

Os graduados da escola constituíram grande parte da Força Aérea Polonesa na Grã-Bretanha, e no início de 1941 um novo esquadrão de caças recebeu o nome de Dęblin. O Esquadrão nº 315 “Dębliński”, cujo emblema era um galo de briga preto, participou das principais operações aéreas aliadas e dos desembarques na Normandia em 1944. Seu comandante de 15 de fevereiro a 18 de agosto de 1944 foi Eugeniusz Horbaczewski, creditado com 16,5 aeronaves destruídas, uma provável e uma danificada. O Museu da Força Aérea inaugurou uma exposição permanente sobre o esquadrão em 14 de agosto de 2019.

Os aviadores que voltaram para casa após a guerra frequentemente eram maltratados. Stanisław Skalski, graduado da Escola de Águias e o maior ás da aviação polonesa, foi incorporado ao Exército Popular e preso em junho de 1948 sob a acusação de espionagem. Em 7 de abril de 1950, um julgamento-espetáculo o condenou à morte. A sentença foi comutada para prisão perpétua em 1951. Em 11 de abril de 1956, o Supremo Tribunal Militar anulou a condenação. Em 1996, dois de seus ex-interrogadores foram presos.

A base atual mantém viva essa tradição. Quando a 41ª Base Aérea de Treinamento foi nomeada em homenagem a Horbaczewski por decisão do Ministério da Defesa Nacional em 25 de julho de 2011, ela assumiu as tradições de oito unidades predecessoras. O Esquadrão nº 315 (1941–1946) vem em primeiro lugar, seguido pelo 58º Regimento de Aviação de Treinamento e Combate (1958–1989), o 58º Regimento de Aviação de Treinamento (1989–2000), o 1º Centro de Treinamento de Aviação (2001–2010) e a 6ª Base Aérea (1994–2010), juntamente com diversas unidades de suprimentos e técnicas. O distintivo pessoal de piloto de Horbaczewski, número 277, está em exibição no museu.

O treinamento de voo recomeçou antes do fim da guerra. Uma escola de aviação de guerra foi formada em Zamość em 31 de outubro de 1944 e transferida, esquadrão por esquadrão, para Dęblin. Em 13 de abril de 1945, o Comandante Supremo criou a Escola de Pilotos Militares (MPS) no local, e seus primeiros graduados foram comissionados em 21 de junho de 1945. A própria história da escola relata que ela operou em meio aos danos da guerra, com instrutores soviéticos, até 1947. Em março de 1947, tornou-se a Escola de Aviação Militar (Oficirska Szkoła Lotnicza), com um esquadrão de caça e ataque ao solo em Radom e esquadrões de navegação e treinamento básico em Dęblin.

O regimento de treinamento da Guerra Fria, o 58º Regimento de Aviação de Treinamento e Combate, foi formado em 1958 e operou até 2000. Em 1º de janeiro de 1968, a escola obteve o status de ensino superior como Escola Superior de Aviação para Oficiais (WOSL), e seus primeiros cadetes se matricularam em 17 de março de 1968. Os primeiros engenheiros-pilotos se formaram em 1971. Um levantamento feito por entusiastas do aeródromo contabiliza 66 aeronaves TS-11 Iskras no regimento e oito An-2s em um esquadrão de treinamento em 1991. Mirosław Hermaszewski, o primeiro polonês no espaço, foi comandante de 1987 a 1990.

Após 1989, a escola e o aeródromo foram separados. Em 1 de outubro de 1994, a escola tornou-se a Escola Superior de Oficiais da Força Aérea (WSOSP). Em 6 de dezembro de 1994, o aeródromo tornou-se a 6ª Base Aérea, que foi subordinada à 4ª Ala de Treinamento Aéreo em 17 de dezembro de 2000. O 1º Centro de Treinamento de Aviação assumiu os voos a partir de 2001. Em 31 de dezembro de 2010, as duas estruturas fundiram-se na 41ª Base Aérea de Treinamento, por meio de uma ordem datada de 1 de julho de 2010. O nome atual da escola, Lotnicza Akademia Wojskowa, entrou em vigor em 1 de outubro de 2018. O histórico da própria escola data a mudança para 28 de agosto de 2018.

Em fevereiro de 2014, a Polônia escolheu o Alenia Aermacchi M-346 para substituir o TS-11 Iskra. O primeiro contrato, para oito aeronaves com treinamento e suporte logístico, foi avaliado em 1.167.754.500 PLN, segundo o jornal Polska Zbrojna. O Defence24 reportou um valor bruto de 1,432 bilhão de PLN. As duas primeiras aeronaves chegaram a Dęblin em novembro de 2016. Em 27 de março de 2018, a Polônia encomendou mais quatro por mais de 115 milhões de euros, com opção para mais quatro, que foi posteriormente exercida. A Leonardo entregou as quatro últimas aeronaves em 16 de dezembro de 2022, elevando a frota para 16.

Os primeiros anos foram difíceis. Um relatório pós-auditoria do Supremo Tribunal de Contas (NIK, na sigla em inglês) para a 41ª Base de Treinamento Aéreo, datado de 11 de junho de 2021, constatou que a frota de M-346 estava operacional, em média, apenas 47,3% do tempo em 2020 e 56,4% em 2021, contra uma meta contratual de pelo menos 75%. Em 2020, apenas 239 das 449 horas de voo planejadas para o M-346 foram realizadas. A base contava com 12 instrutores de M-346. Posteriormente, a imprensa noticiou a descoberta mais ampla do NIK de que mais de 40% dos pilotos de jato formados entre 2019 e 2020 não haviam realizado nenhum treinamento em jatos.

Para solucionar os problemas de suporte, a Leonardo assinou um acordo de suporte de longo prazo em 17 de fevereiro de 2023 com a Wojskowe Zakłady Lotnicze Nr 1, a fábrica de aeronaves militares próxima ao aeródromo de Dęblin. A frota foi novamente imobilizada em 5 de dezembro de 2023, quando a carenagem de um Bielik se desprendeu sobre o condado de Łuków. Permaneceu em solo até a primavera de 2024. Em 12 de julho de 2024, um Bielik caiu em Gdynia-Babie Doły e seu instrutor de voo faleceu. Até o momento da redação deste texto, a causa definitiva do acidente não havia sido divulgada.

O comandante da Força Aérea, General Andrzej Błasik, propôs a criação de um museu em Dęblin em 3 de junho de 2009. Um comitê honorário de 17 membros foi formado em outubro daquele ano. Błasik faleceu no acidente aéreo de Smoleńsk em abril de 2010, antes da inauguração do museu. Um decreto ministerial criou o museu em 10 de janeiro de 2011, Waldemar Wójcik tornou-se seu primeiro diretor em 1º de março e o museu foi inaugurado em 26 de agosto de 2011. Seus diretores subsequentes foram Ryszard Hać (2013–2016) e Paweł Pawłowski a partir de 2017.

Ao lado, o jato que treinou a maioria desses pilotos foi aposentado. No início de 2020, Dęblin ainda possuía 36 TS-11 Iskras, o primeiro jato projetado na Polônia a entrar em produção e serviço. Eles foram construídos na Mielec entre as décadas de 1960 e 1987, e fontes indicam um total entre 400 e 424 unidades. O Iskra deixou de treinar cadetes em 9 de dezembro de 2020. Os pilotos da esquadrilha White-and-Red Sparks, que operavam sete deles, fizeram seu voo de despedida em Dęblin em 27 de julho de 2022, após o modelo ter servido à força aérea por mais de 58 anos.

A coleção é composta principalmente por aeronaves e equipamentos desativados pelas forças armadas, além de doações de ex-pilotos e colecionadores. Atualmente, possui mais de 80 aeronaves, incluindo um C-130 Hercules, um MiG-29, um MiG-23MF, um Su-22UM3K, um PZL-130 Orlik número 005 e o único helicóptero Mi-6 da Polônia. Em setembro de 2025, a base entregou sete TS-11 Iskras, da extinta equipe White-and-Red Sparks, a uma fundação em Mielec, cidade onde o modelo foi fabricado, para serem restaurados e utilizados em shows aéreos.